MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017341	GT	3	6	2328531	2328536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_017341	ATG	2	6	2328556	2328561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_017341	TCC	2	6	2328582	2328587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_017341	ATG	2	6	2328626	2328631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_017341	CACGA	2	10	2328681	2328690	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11006	NC_017341	GAC	2	6	2328694	2328699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_017341	CAC	2	6	2328707	2328712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11008	NC_017341	TTC	2	6	2328784	2328789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_017341	GCA	2	6	2328903	2328908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_017341	TCC	2	6	2329048	2329053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11011	NC_017341	A	6	6	2329169	2329174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_017341	CG	3	6	2329182	2329187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11013	NC_017341	AAT	2	6	2329198	2329203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_017341	GCT	2	6	2329238	2329243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_017341	TTAC	2	8	2329296	2329303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11016	NC_017341	TTC	2	6	2329311	2329316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_017341	TAA	2	6	2329319	2329324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_017341	TCA	2	6	2329349	2329354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_017341	CTG	2	6	2329406	2329411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_017341	TTACC	2	10	2329500	2329509	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11021	NC_017341	TAGG	2	8	2329633	2329640	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_017341	CCG	2	6	2329664	2329669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11023	NC_017341	AAGC	2	8	2329682	2329689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11024	NC_017341	CGC	2	6	2329726	2329731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11025	NC_017341	ATG	2	6	2329774	2329779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_017341	AAT	2	6	2329802	2329807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_017341	ATTT	2	8	2329904	2329911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_017341	TTTA	2	8	2329942	2329949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_017341	TTC	2	6	2330001	2330006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_017341	CGT	2	6	2330021	2330026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_017341	GAC	2	6	2330031	2330036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11032	NC_017341	T	6	6	2330076	2330081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_017341	CTT	2	6	2330107	2330112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_017341	AT	3	6	2330215	2330220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_017341	CAT	2	6	2331324	2331329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_017341	TAAA	2	8	2331382	2331389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_017341	A	7	7	2331387	2331393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_017341	TAT	2	6	2331404	2331409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_017341	ACT	2	6	2331423	2331428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_017341	ATT	2	6	2331432	2331437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_017341	GTT	2	6	2332858	2332863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_017341	CAT	2	6	2332878	2332883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_017341	TCC	2	6	2332887	2332892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11044	NC_017341	AGT	2	6	2332950	2332955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_017341	ATA	2	6	2332962	2332967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_017341	AAG	2	6	2332968	2332973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_017341	ATA	2	6	2332980	2332985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_017341	ATT	2	6	2332990	2332995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_017341	TAA	2	6	2333060	2333065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_017341	TTTAT	2	10	2333066	2333075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_017341	TAT	2	6	2333137	2333142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_017341	TTC	2	6	2333146	2333151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_017341	AAG	2	6	2333163	2333168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_017341	CCT	2	6	2333679	2333684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_017341	TAA	2	6	2333688	2333693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_017341	TAT	2	6	2333728	2333733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_017341	CCT	2	6	2335124	2335129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11058	NC_017341	TA	3	6	2335132	2335137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_017341	TTTA	2	8	2335138	2335145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_017341	TTTA	2	8	2335152	2335159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_017341	AAT	2	6	2335162	2335167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_017341	TACAA	2	10	2335222	2335231	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11063	NC_017341	TAA	2	6	2335254	2335259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_017341	A	7	7	2335258	2335264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_017341	CCT	2	6	2337190	2337195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11066	NC_017341	TAA	2	6	2337213	2337218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_017341	A	6	6	2337835	2337840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_017341	ATG	2	6	2337879	2337884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_017341	A	7	7	2338187	2338193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_017341	TCAT	2	8	2338194	2338201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11071	NC_017341	ATGA	2	8	2338214	2338221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_017341	T	7	7	2338222	2338228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_017341	AT	3	6	2338305	2338310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_017341	AATC	2	8	2339684	2339691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11075	NC_017341	TA	3	6	2339717	2339722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_017341	AACA	2	8	2339740	2339747	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11077	NC_017341	TATG	2	8	2339779	2339786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_017341	AAT	2	6	2339797	2339802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_017341	TTA	2	6	2339808	2339813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_017341	A	6	6	2339852	2339857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_017341	T	6	6	2339891	2339896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_017341	ACG	2	6	2340859	2340864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_017341	AT	3	6	2341806	2341811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_017341	AAAG	2	8	2341820	2341827	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_017341	TA	3	6	2341839	2341844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_017341	TCTTTT	2	12	2341860	2341871	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11087	NC_017341	TAT	2	6	2342940	2342945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_017341	T	6	6	2342986	2342991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_017341	TA	3	6	2343012	2343017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_017341	TAA	2	6	2343025	2343030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_017341	ATC	2	6	2343089	2343094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_017341	CAA	2	6	2343205	2343210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_017341	A	6	6	2343215	2343220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_017341	GTA	2	6	2343261	2343266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_017341	GTA	2	6	2344371	2344376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_017341	TAA	2	6	2347165	2347170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_017341	TCCAA	2	10	2347258	2347267	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11098	NC_017341	TAG	2	6	2347279	2347284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_017341	A	7	7	2347297	2347303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_017341	ATA	2	6	2347339	2347344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_017341	ATCATT	2	12	2347348	2347359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11102	NC_017341	ATCT	2	8	2347376	2347383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11103	NC_017341	TTA	2	6	2349405	2349410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_017341	TTA	2	6	2349437	2349442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_017341	GA	3	6	2349461	2349466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_017341	ATA	2	6	2349467	2349472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_017341	ATT	2	6	2349489	2349494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_017341	A	6	6	2349504	2349509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_017341	A	7	7	2349531	2349537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_017341	CAG	2	6	2349538	2349543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_017341	CTG	2	6	2349574	2349579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_017341	TAC	2	6	2349686	2349691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_017341	TTTTAC	2	12	2349706	2349717	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11114	NC_017341	A	6	6	2349726	2349731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_017341	AAT	2	6	2349771	2349776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_017341	TAA	2	6	2349811	2349816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_017341	ACTAA	2	10	2349822	2349831	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11118	NC_017341	ATG	2	6	2350988	2350993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_017341	TAA	2	6	2351007	2351012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_017341	GATA	2	8	2351050	2351057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_017341	TGA	2	6	2351091	2351096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_017341	TCA	2	6	2351101	2351106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_017341	T	7	7	2352051	2352057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_017341	TGA	2	6	2352073	2352078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_017341	CCT	2	6	2352880	2352885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11126	NC_017341	AGTTAA	2	12	2352887	2352898	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_017341	T	7	7	2352930	2352936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_017341	ATA	2	6	2352944	2352949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_017341	TAA	2	6	2352953	2352958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_017341	ATTT	2	8	2352965	2352972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11265	NC_017341	TTAA	2	8	2380753	2380760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11393	NC_017341	TAC	2	6	2412016	2412021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11394	NC_017341	TAA	2	6	2412374	2412379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11396	NC_017341	TTA	2	6	2412450	2412455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11398	NC_017341	TAT	2	6	2412553	2412558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11400	NC_017341	A	7	7	2415787	2415793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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