MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_017341	ACT	2	6	2289843	2289848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_017341	TCA	2	6	2289884	2289889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_017341	TCT	2	6	2289912	2289917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_017341	TAT	2	6	2289930	2289935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_017341	AT	3	6	2290118	2290123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_017341	CAC	2	6	2290151	2290156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10507	NC_017341	AT	3	6	2290168	2290173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_017341	TTA	2	6	2290207	2290212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_017341	TAAG	2	8	2291177	2291184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_017341	TGT	3	9	2291199	2291207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_017341	ATTTTG	2	12	2291216	2291227	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_017341	TAT	2	6	2291243	2291248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_017341	TC	3	6	2291382	2291387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10514	NC_017341	TAA	2	6	2291437	2291442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_017341	TCA	2	6	2291524	2291529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_017341	A	6	6	2291535	2291540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_017341	ACA	2	6	2292259	2292264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_017341	TATT	2	8	2292271	2292278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_017341	TAC	2	6	2292345	2292350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_017341	ATTAA	2	10	2292360	2292369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_017341	T	6	6	2293762	2293767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_017341	TGA	2	6	2293796	2293801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_017341	TTA	2	6	2293810	2293815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_017341	TAT	2	6	2293829	2293834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_017341	TAT	2	6	2293867	2293872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_017341	TAAT	2	8	2293895	2293902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_017341	TTA	2	6	2293905	2293910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_017341	T	6	6	2293934	2293939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_017341	GAA	2	6	2293956	2293961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_017341	AGG	2	6	2293963	2293968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_017341	CAC	2	6	2293969	2293974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10532	NC_017341	GTT	2	6	2295092	2295097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_017341	ATGC	2	8	2295108	2295115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10534	NC_017341	GTT	2	6	2295149	2295154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_017341	GTT	2	6	2295215	2295220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_017341	CTT	2	6	2295226	2295231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_017341	TA	3	6	2295256	2295261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_017341	TA	3	6	2295284	2295289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_017341	CTG	2	6	2295326	2295331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10540	NC_017341	TTA	2	6	2295347	2295352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_017341	AT	3	6	2295400	2295405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_017341	GTA	2	6	2295408	2295413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_017341	TATTT	2	10	2295516	2295525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_017341	T	6	6	2295570	2295575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_017341	AAC	2	6	2295667	2295672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_017341	TTA	2	6	2295695	2295700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_017341	CCA	2	6	2295710	2295715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10548	NC_017341	AATA	2	8	2295732	2295739	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_017341	T	6	6	2295781	2295786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_017341	TTC	2	6	2295844	2295849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_017341	TCA	2	6	2295866	2295871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_017341	T	6	6	2295892	2295897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_017341	TTG	2	6	2295942	2295947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_017341	TCA	2	6	2296008	2296013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10555	NC_017341	A	6	6	2296018	2296023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_017341	ATC	2	6	2296087	2296092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_017341	TAAA	2	8	2296317	2296324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_017341	CT	3	6	2296327	2296332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10559	NC_017341	ATATT	2	10	2296338	2296347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_017341	TTA	2	6	2297528	2297533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_017341	A	6	6	2297543	2297548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_017341	AACA	2	8	2297557	2297564	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10563	NC_017341	A	7	7	2297606	2297612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_017341	TC	3	6	2297637	2297642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10565	NC_017341	ATA	2	6	2297685	2297690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_017341	C	6	6	2297723	2297728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10567	NC_017341	AT	3	6	2297742	2297747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_017341	ACA	2	6	2297798	2297803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10569	NC_017341	ATA	2	6	2297820	2297825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_017341	TAA	2	6	2297860	2297865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_017341	TTA	3	9	2297898	2297906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_017341	TCA	2	6	2297908	2297913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10573	NC_017341	ACA	2	6	2297934	2297939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10574	NC_017341	GAT	2	6	2297950	2297955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10576	NC_017341	TA	3	6	2297964	2297969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_017341	CATT	2	8	2297976	2297983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10578	NC_017341	T	6	6	2298014	2298019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10579	NC_017341	A	7	7	2298053	2298059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_017341	TATT	2	8	2298084	2298091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_017341	AATA	2	8	2298138	2298145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_017341	GAT	2	6	2298153	2298158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10584	NC_017341	T	7	7	2298298	2298304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_017341	CTA	2	6	2298321	2298326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10588	NC_017341	TTA	2	6	2298401	2298406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_017341	GAT	2	6	2298452	2298457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10592	NC_017341	AATA	2	8	2298559	2298566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_017341	TTAA	2	8	2299463	2299470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_017341	ATT	2	6	2299479	2299484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_017341	TTA	2	6	2299487	2299492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_017341	TAACA	2	10	2300336	2300345	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10597	NC_017341	TAAA	3	12	2300366	2300377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_017341	A	6	6	2300436	2300441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_017341	TTTAAT	2	12	2300482	2300493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10601	NC_017341	A	6	6	2300508	2300513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_017341	ATA	2	6	2302405	2302410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10605	NC_017341	TTA	2	6	2302537	2302542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10607	NC_017341	CCG	2	6	2302613	2302618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10608	NC_017341	TCC	2	6	2302635	2302640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10609	NC_017341	AT	3	6	2302655	2302660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_017341	AT	3	6	2302682	2302687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_017341	CAAATA	2	12	2302702	2302713	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10612	NC_017341	ATT	2	6	2302770	2302775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_017341	GTT	2	6	2302786	2302791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_017341	T	7	7	2302840	2302846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_017341	TGA	2	6	2302881	2302886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_017341	TTTA	2	8	2302890	2302897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_017341	ATTT	2	8	2302908	2302915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_017341	CT	3	6	2302956	2302961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10619	NC_017341	TA	4	8	2302968	2302975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_017341	AT	3	6	2302981	2302986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_017341	A	6	6	2302988	2302993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_017341	TAAA	2	8	2304548	2304555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_017341	A	6	6	2304558	2304563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_017341	GGA	2	6	2304565	2304570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_017341	TTTG	2	8	2308273	2308280	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_017341	AAG	2	6	2308285	2308290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_017341	TAA	2	6	2308318	2308323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_017341	GTA	2	6	2308325	2308330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10629	NC_017341	A	6	6	2308367	2308372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10631	NC_017341	TAA	2	6	2308431	2308436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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