MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017341	TTG	2	6	2194854	2194859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_017341	TAAAT	2	10	2194880	2194889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_017341	AT	3	6	2194926	2194931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_017341	TAA	2	6	2194951	2194956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_017341	ATT	3	9	2195000	2195008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_017341	TTA	2	6	2195009	2195014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_017341	AAT	2	6	2195099	2195104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_017341	T	7	7	2195114	2195120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_017341	TTA	2	6	2195147	2195152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_017341	ATG	2	6	2198953	2198958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_017341	AT	3	6	2198975	2198980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_017341	GCT	2	6	2198986	2198991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_017341	ATT	2	6	2199053	2199058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_017341	GGA	2	6	2199060	2199065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_017341	GAG	2	6	2200092	2200097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_017341	ATC	2	6	2205968	2205973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_017341	CCT	2	6	2206228	2206233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10018	NC_017341	AGTA	2	8	2206284	2206291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_017341	ATTT	2	8	2206315	2206322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_017341	TCGA	2	8	2206334	2206341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10021	NC_017341	TCA	2	6	2206396	2206401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_017341	G	6	6	2206446	2206451	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_017341	CA	3	6	2206487	2206492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10024	NC_017341	CTC	2	6	2206573	2206578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10025	NC_017341	ACG	2	6	2206596	2206601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_017341	ACG	2	6	2206622	2206627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_017341	ACC	2	6	2206817	2206822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10028	NC_017341	ATGA	2	8	2206899	2206906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_017341	AGG	2	6	2206953	2206958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_017341	CAC	2	6	2206998	2207003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10031	NC_017341	GTG	2	6	2207009	2207014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_017341	GTA	2	6	2207041	2207046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_017341	CCA	2	6	2207049	2207054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_017341	CCTA	2	8	2207093	2207100	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10035	NC_017341	TC	3	6	2207213	2207218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10036	NC_017341	GCC	2	6	2207310	2207315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_017341	CTC	2	6	2207358	2207363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10038	NC_017341	TCGC	2	8	2207547	2207554	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10039	NC_017341	TCTA	2	8	2207613	2207620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10040	NC_017341	TCT	2	6	2207667	2207672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_017341	CAATC	2	10	2207740	2207749	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10042	NC_017341	C	6	6	2207775	2207780	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10043	NC_017341	GGT	2	6	2207800	2207805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_017341	ATG	2	6	2208120	2208125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_017341	GCT	2	6	2208126	2208131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_017341	AT	3	6	2208185	2208190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_017341	TGG	2	6	2208205	2208210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_017341	AATT	2	8	2208270	2208277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_017341	AAT	2	6	2208346	2208351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_017341	GA	3	6	2208384	2208389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_017341	TCGGT	2	10	2208461	2208470	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10052	NC_017341	ACT	2	6	2208666	2208671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_017341	AG	3	6	2208761	2208766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_017341	TCC	2	6	2208787	2208792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10055	NC_017341	CGT	2	6	2208820	2208825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_017341	AG	3	6	2208842	2208847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_017341	ACA	2	6	2208848	2208853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_017341	ATT	2	6	2208868	2208873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_017341	CTT	2	6	2208876	2208881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_017341	GAT	2	6	2208897	2208902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_017341	GTC	2	6	2208912	2208917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_017341	CAA	2	6	2208951	2208956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_017341	TTG	2	6	2208963	2208968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_017341	TCGC	2	8	2208987	2208994	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10065	NC_017341	CTA	2	6	2208997	2209002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_017341	TCC	2	6	2209026	2209031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10067	NC_017341	CTTA	2	8	2209149	2209156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10068	NC_017341	TCG	2	6	2209174	2209179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_017341	TAA	2	6	2209232	2209237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_017341	CCA	2	6	2209252	2209257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10071	NC_017341	ATT	2	6	2209296	2209301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_017341	AAT	2	6	2209338	2209343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_017341	TTA	2	6	2209394	2209399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_017341	ATT	2	6	2209430	2209435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_017341	TACT	2	8	2209502	2209509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10076	NC_017341	A	6	6	2209570	2209575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_017341	AAC	2	6	2209632	2209637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_017341	CTTT	2	8	2209640	2209647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10079	NC_017341	A	6	6	2209696	2209701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_017341	TAAA	2	8	2209713	2209720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_017341	TCT	2	6	2209759	2209764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_017341	AT	3	6	2209781	2209786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_017341	AGG	2	6	2209795	2209800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_017341	GTG	2	6	2209922	2209927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_017341	GT	3	6	2209937	2209942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_017341	AAC	2	6	2210041	2210046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_017341	GT	3	6	2210106	2210111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_017341	ATG	2	6	2210131	2210136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_017341	TCC	2	6	2210157	2210162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10090	NC_017341	ATG	2	6	2210201	2210206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_017341	CACGA	2	10	2210256	2210265	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10092	NC_017341	GAC	2	6	2210269	2210274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_017341	CAC	2	6	2210282	2210287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10094	NC_017341	TTC	2	6	2210359	2210364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_017341	GCA	2	6	2210478	2210483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_017341	TCC	2	6	2210623	2210628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10097	NC_017341	A	6	6	2210744	2210749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_017341	CG	3	6	2210757	2210762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10099	NC_017341	AAT	2	6	2210773	2210778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_017341	GCT	2	6	2210813	2210818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_017341	TTAC	2	8	2210871	2210878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10102	NC_017341	TTC	2	6	2210886	2210891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_017341	TAA	2	6	2210894	2210899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_017341	TCA	2	6	2210924	2210929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_017341	CTG	2	6	2210981	2210986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_017341	TTACC	2	10	2211075	2211084	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10107	NC_017341	ATC	2	6	2211163	2211168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_017341	TAGG	2	8	2211208	2211215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_017341	CCG	2	6	2211239	2211244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10110	NC_017341	AAGC	2	8	2211257	2211264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10111	NC_017341	CGC	2	6	2211301	2211306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10112	NC_017341	ATG	2	6	2211349	2211354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_017341	AAT	2	6	2211377	2211382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_017341	TTAT	2	8	2211680	2211687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_017341	TAT	2	6	2211690	2211695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_017341	T	7	7	2211728	2211734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_017341	ATTAA	2	10	2211737	2211746	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_017341	GTT	2	6	2211759	2211764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_017341	TAA	2	6	2211781	2211786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_017341	TAAAT	2	10	2211818	2211827	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_017341	TCAAA	2	10	2211845	2211854	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10122	NC_017341	TTTA	2	8	2211856	2211863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_017341	T	6	6	2211872	2211877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_017341	ACTA	2	8	2211897	2211904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10125	NC_017341	TCAA	2	8	2211930	2211937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10126	NC_017341	TA	3	6	2212000	2212005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_017341	ATT	2	6	2212009	2212014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_017341	TAATC	2	10	2212036	2212045	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10129	NC_017341	TCT	2	6	2212168	2212173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_017341	TA	3	6	2212221	2212226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_017341	ATAA	2	8	2212242	2212249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_017341	TTGTA	2	10	2212277	2212286	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_017341	ATTT	2	8	2214920	2214927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_017341	ATT	2	6	2215037	2215042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10136	NC_017341	CAT	2	6	2215056	2215061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10139	NC_017341	TCT	2	6	2215136	2215141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10140	NC_017341	ATT	2	6	2215150	2215155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10142	NC_017341	TTAA	2	8	2215224	2215231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10143	NC_017341	TAA	2	6	2215258	2215263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10151	NC_017341	CCT	2	6	2218002	2218007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10156	NC_017341	TAA	2	6	2218184	2218189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10165	NC_017341	ATTTT	2	10	2223114	2223123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10173	NC_017341	ATAAA	2	10	2227626	2227635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10244	NC_017341	TTA	2	6	2241408	2241413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10245	NC_017341	TGA	2	6	2241475	2241480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_017341	GAA	2	6	2241508	2241513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10247	NC_017341	TTA	2	6	2241525	2241530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10248	NC_017341	ATT	2	6	2241562	2241567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10253	NC_017341	ATT	2	6	2241729	2241734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_017341	A	6	6	2245641	2245646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_017341	TCC	2	6	2245647	2245652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10256	NC_017341	TAAA	2	8	2245654	2245661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_017341	A	7	7	2245659	2245665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_017341	AGT	2	6	2245682	2245687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10260	NC_017341	ATT	2	6	2245868	2245873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10261	NC_017341	TAT	3	9	2245886	2245894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_017341	ATA	2	6	2245901	2245906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10263	NC_017341	AT	3	6	2245920	2245925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10264	NC_017341	A	7	7	2245935	2245941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10265	NC_017341	AT	3	6	2245966	2245971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10266	NC_017341	TA	3	6	2245990	2245995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10267	NC_017341	ATTA	2	8	2245999	2246006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10272	NC_017341	T	6	6	2246828	2246833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10274	NC_017341	T	6	6	2246922	2246927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10289	NC_017341	ATT	2	6	2249999	2250004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10291	NC_017341	TA	3	6	2250380	2250385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10292	NC_017341	A	6	6	2250430	2250435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10293	NC_017341	A	6	6	2250449	2250454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10294	NC_017341	GTG	2	6	2250475	2250480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10295	NC_017341	A	6	6	2250518	2250523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10296	NC_017341	AGT	2	6	2250587	2250592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10301	NC_017341	TTTA	2	8	2250832	2250839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10308	NC_017341	A	7	7	2256233	2256239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10370	NC_017341	TATT	2	8	2271648	2271655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10385	NC_017341	AACAT	2	10	2275130	2275139	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10386	NC_017341	AAGC	2	8	2275142	2275149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10387	NC_017341	GTT	2	6	2275158	2275163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10388	NC_017341	AAATT	2	10	2275182	2275191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10389	NC_017341	TTAC	2	8	2275196	2275203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10390	NC_017341	TAAA	2	8	2275282	2275289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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