MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017341	ATA	2	6	88614	88619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017341	AGA	2	6	88685	88690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017341	CA	4	8	89477	89484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_017341	AAT	2	6	89519	89524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017341	T	6	6	91844	91849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017341	A	6	6	91870	91875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017341	TGT	2	6	91893	91898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017341	ATAA	2	8	91906	91913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017341	ATCA	2	8	91916	91923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_017341	ATG	2	6	91927	91932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017341	AATATA	2	12	94634	94645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017341	A	6	6	94649	94654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017341	TTAT	2	8	94691	94698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017341	GTT	2	6	94702	94707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017341	TA	4	8	94739	94746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017341	ATT	2	6	94864	94869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017341	ATA	2	6	94896	94901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017341	A	6	6	94915	94920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017341	A	6	6	94975	94980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017341	ATAA	2	8	94988	94995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017341	ATT	2	6	96748	96753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017341	AT	3	6	96759	96764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017341	TTA	2	6	96798	96803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017341	ATG	2	6	96854	96859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017341	CAAT	2	8	96860	96867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
526	NC_017341	TCA	2	6	96882	96887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017341	A	7	7	96887	96893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017341	CCA	2	6	98771	98776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_017341	T	6	6	98909	98914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017341	AAT	2	6	98937	98942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017341	GTAAT	2	10	99053	99062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017341	AAAG	2	8	99101	99108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017341	ATG	2	6	99607	99612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017341	ATT	2	6	99636	99641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017341	ATAA	2	8	99642	99649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017341	AT	3	6	99674	99679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017341	TATT	2	8	99680	99687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017341	ATC	2	6	99775	99780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017341	GAT	2	6	99818	99823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017341	TA	3	6	99832	99837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017341	AG	3	6	99839	99844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017341	TGT	2	6	101457	101462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017341	ATT	2	6	101493	101498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017341	T	6	6	101547	101552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017341	GTT	2	6	101610	101615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017341	AGTA	2	8	101622	101629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017341	A	6	6	101634	101639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017341	CAA	2	6	101649	101654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017341	GAT	2	6	101676	101681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017341	TA	3	6	101717	101722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017341	TTGT	2	8	101765	101772	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017341	TAAAA	2	10	103166	103175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017341	TAA	2	6	103239	103244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017341	AT	3	6	103256	103261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017341	T	6	6	103267	103272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017341	TTA	2	6	103287	103292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017341	A	6	6	103303	103308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017341	GTT	2	6	103390	103395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017341	A	6	6	103418	103423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017341	ATA	2	6	104273	104278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017341	AAT	2	6	104284	104289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017341	ATA	2	6	104309	104314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017341	TTA	2	6	104323	104328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017341	GAA	2	6	104406	104411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017341	ATTG	2	8	104413	104420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017341	TA	3	6	104451	104456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017341	TTAACA	2	12	104492	104503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
568	NC_017341	A	7	7	104518	104524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017341	GTTA	2	8	104535	104542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017341	GTT	2	6	104562	104567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017341	TAA	2	6	104585	104590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017341	CCT	2	6	107606	107611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_017341	T	6	6	107662	107667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017341	ATT	2	6	107709	107714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017341	A	6	6	107731	107736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017341	AC	3	6	107782	107787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_017341	GAG	2	6	107810	107815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017341	ATG	2	6	119067	119072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017341	ATA	2	6	119097	119102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017341	TAAA	2	8	119180	119187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017341	TAAA	2	8	119218	119225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017341	GA	3	6	119878	119883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017341	A	6	6	119887	119892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017341	TGT	2	6	120008	120013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017341	GAG	2	6	120061	120066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017341	TAA	3	9	120863	120871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017341	T	6	6	120913	120918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017341	TAG	2	6	120942	120947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017341	TAA	2	6	120953	120958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017341	ATG	2	6	120979	120984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017341	CAT	2	6	121047	121052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017341	TAAA	2	8	121076	121083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017341	ATTTT	2	10	121102	121111	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017341	TAAA	2	8	121114	121121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017341	A	6	6	121119	121124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017341	AT	3	6	121162	121167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017341	TAA	2	6	122831	122836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017341	TAAA	2	8	122840	122847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017341	CAT	2	6	122935	122940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_017341	TGA	2	6	122971	122976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017341	TAAGAA	2	12	126862	126873	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_017341	TA	3	6	127005	127010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017341	AAAT	2	8	127023	127030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017341	AAT	3	9	127028	127036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017341	AC	3	6	127046	127051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_017341	ATTA	2	8	127057	127064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017341	AGG	2	6	127086	127091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017341	T	6	6	127747	127752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017341	ATA	2	6	127813	127818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017341	TTA	2	6	127843	127848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017341	TTG	2	6	127849	127854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017341	TA	3	6	127877	127882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017341	ACA	2	6	127889	127894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017341	TAAA	2	8	127921	127928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017341	ATT	2	6	127944	127949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017341	A	6	6	127974	127979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017341	TTG	2	6	127999	128004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017341	ATA	2	6	128026	128031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017341	CAT	2	6	128736	128741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017341	TCA	2	6	128809	128814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017341	T	8	8	128820	128827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017341	AAT	2	6	128829	128834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017341	TCA	2	6	129610	129615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017341	AAT	2	6	129619	129624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017341	AAC	2	6	129665	129670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017341	A	6	6	129757	129762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017341	TAT	3	9	129763	129771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017341	GGA	2	6	129814	129819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017341	AT	3	6	131913	131918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017341	TAAA	2	8	131937	131944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017341	TA	3	6	131950	131955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017341	GAG	2	6	131960	131965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017341	ATA	2	6	133856	133861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017341	CAG	2	6	133866	133871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017341	TAA	2	6	133884	133889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017341	CTG	2	6	133902	133907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_017341	TAT	2	6	133912	133917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017341	CTTT	2	8	136370	136377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
640	NC_017341	AT	3	6	136510	136515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_017341	CTTT	2	8	137646	137653	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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925	NC_017341	ACA	2	6	224477	224482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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931	NC_017341	GAAA	2	8	226321	226328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
932	NC_017341	AAT	2	6	229710	229715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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934	NC_017341	TTTG	2	8	229811	229818	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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953	NC_017341	AT	3	6	235996	236001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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956	NC_017341	ACA	2	6	238119	238124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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958	NC_017341	ATT	2	6	238192	238197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
959	NC_017341	AACAT	2	10	238215	238224	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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963	NC_017341	TAG	3	9	238405	238413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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966	NC_017341	AAT	2	6	238561	238566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
967	NC_017341	TTCA	2	8	238606	238613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
968	NC_017341	TTCA	2	8	238632	238639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
969	NC_017341	ATC	2	6	239841	239846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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987	NC_017341	AT	3	6	247844	247849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
988	NC_017341	ATTAA	2	10	247865	247874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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