MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 12637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017338	CCT	2	6	2249632	2249637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10002	NC_017338	TAA	2	6	2249655	2249660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_017338	A	6	6	2250277	2250282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_017338	ATG	2	6	2250321	2250326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_017338	A	7	7	2250629	2250635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_017338	TCAT	2	8	2250636	2250643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10007	NC_017338	ATGA	2	8	2250656	2250663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_017338	T	7	7	2250664	2250670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_017338	AT	3	6	2250747	2250752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_017338	AATC	2	8	2252126	2252133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10011	NC_017338	TA	3	6	2252159	2252164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_017338	TATG	2	8	2252221	2252228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_017338	AAT	2	6	2252239	2252244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_017338	T	6	6	2252276	2252281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_017338	A	6	6	2252295	2252300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_017338	TTTAAA	2	12	2252334	2252345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_017338	A	6	6	2252343	2252348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_017338	TTTA	2	8	2255375	2255382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_017338	TTATT	2	10	2255383	2255392	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_017338	TA	4	8	2255452	2255459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_017338	TAA	2	6	2255467	2255472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_017338	ATC	2	6	2255531	2255536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_017338	A	6	6	2255657	2255662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_017338	GTA	2	6	2255703	2255708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_017338	GTA	2	6	2256813	2256818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_017338	ATA	2	6	2259781	2259786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_017338	ATCATT	2	12	2259790	2259801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10028	NC_017338	ATCT	2	8	2259818	2259825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10029	NC_017338	TTA	2	6	2261847	2261852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_017338	TTA	2	6	2261879	2261884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_017338	GA	3	6	2261903	2261908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_017338	ATA	2	6	2261909	2261914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_017338	ATT	2	6	2261931	2261936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_017338	A	6	6	2261946	2261951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_017338	T	7	7	2262528	2262534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_017338	T	7	7	2262538	2262544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_017338	TGA	2	6	2262560	2262565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_017338	CCT	2	6	2263367	2263372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10039	NC_017338	AGTTAA	2	12	2263374	2263385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_017338	T	7	7	2263417	2263423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_017338	ATA	2	6	2263431	2263436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_017338	TAA	2	6	2263440	2263445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_017338	ATTT	2	8	2263452	2263459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_017338	AT	3	6	2263463	2263468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_017338	AT	3	6	2263490	2263495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_017338	TAAA	2	8	2263509	2263516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_017338	ATT	2	6	2263522	2263527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_017338	TA	3	6	2265163	2265168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_017338	TAA	2	6	2265177	2265182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_017338	AT	3	6	2265203	2265208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_017338	AC	3	6	2265212	2265217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10052	NC_017338	ATT	2	6	2265222	2265227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_017338	CAA	2	6	2265238	2265243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_017338	ATT	2	6	2265281	2265286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_017338	A	6	6	2265344	2265349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_017338	TACT	2	8	2265389	2265396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10057	NC_017338	TTA	2	6	2266438	2266443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_017338	TG	3	6	2266460	2266465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_017338	CAT	2	6	2266478	2266483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_017338	AAT	2	6	2266509	2266514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_017338	GAC	2	6	2266519	2266524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_017338	A	6	6	2266583	2266588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_017338	TTA	2	6	2266589	2266594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_017338	CTTT	2	8	2267653	2267660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10065	NC_017338	GTT	2	6	2267743	2267748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_017338	AATA	2	8	2267855	2267862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_017338	T	6	6	2267891	2267896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_017338	TAG	2	6	2267910	2267915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_017338	TA	3	6	2268816	2268821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_017338	CAT	2	6	2268868	2268873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_017338	ATTG	2	8	2268919	2268926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_017338	CTT	2	6	2268927	2268932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_017338	GT	3	6	2268945	2268950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_017338	AT	4	8	2268964	2268971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_017338	TAAA	2	8	2269002	2269009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_017338	GTC	2	6	2274454	2274459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_017338	TCC	2	6	2274987	2274992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10078	NC_017338	AAAC	2	8	2275542	2275549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10079	NC_017338	ATA	2	6	2275561	2275566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_017338	TTTG	2	8	2275576	2275583	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_017338	TGT	2	6	2275620	2275625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_017338	TAA	2	6	2275669	2275674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_017338	CA	3	6	2275697	2275702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10084	NC_017338	A	7	7	2275702	2275708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_017338	ATTCAC	2	12	2275729	2275740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10087	NC_017338	ATT	2	6	2276599	2276604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_017338	T	6	6	2276603	2276608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_017338	TAA	2	6	2276628	2276633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_017338	AT	3	6	2276651	2276656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_017338	TAA	2	6	2276742	2276747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_017338	TCAT	2	8	2276767	2276774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10093	NC_017338	TTCA	2	8	2277635	2277642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10094	NC_017338	CT	3	6	2277674	2277679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10095	NC_017338	TAT	2	6	2277845	2277850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_017338	AATT	2	8	2277855	2277862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_017338	TAGAA	2	10	2277881	2277890	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_017338	TGA	2	6	2277912	2277917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_017338	CAA	2	6	2277942	2277947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_017338	CTACCT	2	12	2277956	2277967	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_017338	ACA	2	6	2279295	2279300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_017338	CCT	2	6	2280060	2280065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10103	NC_017338	CAT	2	6	2280071	2280076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_017338	AT	3	6	2280075	2280080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_017338	TA	5	10	2280098	2280107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_017338	ATATT	2	10	2280108	2280117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_017338	AAT	2	6	2280169	2280174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_017338	TAAT	2	8	2280233	2280240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_017338	TAA	2	6	2280242	2280247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_017338	TA	3	6	2280258	2280263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_017338	TTA	2	6	2280290	2280295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_017338	TAAT	2	8	2280298	2280305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_017338	ATTA	2	8	2280316	2280323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_017338	ATA	2	6	2280353	2280358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_017338	AT	3	6	2280364	2280369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_017338	TGCT	2	8	2280381	2280388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10117	NC_017338	TAA	2	6	2280407	2280412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_017338	T	6	6	2280474	2280479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_017338	CCT	2	6	2281346	2281351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_017338	TA	3	6	2281873	2281878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_017338	TTA	2	6	2281908	2281913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_017338	AAATTT	2	12	2281917	2281928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_017338	T	6	6	2281934	2281939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_017338	TA	3	6	2281979	2281984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_017338	ATT	2	6	2282023	2282028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_017338	T	6	6	2282032	2282037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_017338	ATT	2	6	2282042	2282047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_017338	TA	3	6	2282096	2282101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_017338	ATT	2	6	2282109	2282114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_017338	ATT	2	6	2282177	2282182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10132	NC_017338	AT	3	6	2284700	2284705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10264	NC_017338	T	6	6	2307979	2307984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10265	NC_017338	CCT	2	6	2308180	2308185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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