MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398 plasmid pS0385-2

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017335	GAA	2	6	1	6	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017335	A	6	6	36	41	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017335	TTA	2	6	1036	1041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017335	TTTTG	2	10	1062	1071	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017335	T	6	6	1120	1125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017335	ACG	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017335	ATTAT	2	10	1242	1251	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017335	GGT	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017335	GAAC	2	8	1305	1312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017335	AGTG	2	8	1395	1402	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017335	GTA	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017335	AGA	2	6	1620	1625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017335	TGA	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017335	ATTT	2	8	3102	3109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017335	A	6	6	3383	3388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017335	AAATA	2	10	3438	3447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017335	A	6	6	3447	3452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017335	A	6	6	3503	3508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017335	TTC	2	6	3565	3570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017335	AT	4	8	3574	3581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017335	CTT	2	6	3594	3599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017335	T	6	6	3620	3625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017335	A	7	7	3676	3682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017335	TTG	2	6	3762	3767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017335	TAA	2	6	3775	3780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017335	AT	3	6	3840	3845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017335	TAA	2	6	3955	3960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017335	GAA	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017335	AAAAC	2	10	3988	3997	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017335	GAT	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017335	AGATT	2	10	4031	4040	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017335	TTTTGA	2	12	4045	4056	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017335	ATT	2	6	4071	4076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017335	T	6	6	4110	4115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017335	TTA	2	6	4173	4178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017335	TAA	2	6	4186	4191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017335	A	6	6	4190	4195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017335	ATT	2	6	4281	4286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.