MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

Total Repeats: 12299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017333	TG	3	6	1138996	1139001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017333	ACTTC	2	10	1139017	1139026	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5003	NC_017333	TAG	2	6	1139032	1139037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017333	TCC	2	6	1140971	1140976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_017333	TGTT	2	8	1140983	1140990	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017333	TA	3	6	1141027	1141032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017333	ATTC	2	8	1141040	1141047	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_017333	ATC	2	6	1141050	1141055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_017333	TAA	2	6	1141070	1141075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017333	TAA	2	6	1141085	1141090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017333	TCA	2	6	1141097	1141102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017333	A	6	6	1141116	1141121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017333	ATG	2	6	1141164	1141169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017333	ATA	2	6	1141174	1141179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017333	TATT	2	8	1141235	1141242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017333	AAAT	2	8	1141244	1141251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017333	AAGA	2	8	1141274	1141281	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017333	AT	3	6	1141348	1141353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017333	TGT	2	6	1141359	1141364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017333	CAT	2	6	1141400	1141405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_017333	GT	3	6	1141436	1141441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017333	CCTT	2	8	1142003	1142010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_017333	GTT	2	6	1142046	1142051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017333	ACT	2	6	1142098	1142103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_017333	A	6	6	1142157	1142162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017333	ATTT	2	8	1142201	1142208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017333	ATC	2	6	1142209	1142214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_017333	ATTAT	2	10	1142227	1142236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017333	TGTAA	2	10	1142279	1142288	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017333	ATTTA	2	10	1142326	1142335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017333	AAC	2	6	1143009	1143014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_017333	TAT	2	6	1143027	1143032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017333	T	7	7	1143040	1143046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017333	ATTT	2	8	1143084	1143091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017333	AAATG	2	10	1145298	1145307	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017333	AGG	2	6	1145326	1145331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017333	T	6	6	1148097	1148102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017333	AGT	2	6	1148114	1148119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017333	CATG	2	8	1148156	1148163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_017333	TTCG	2	8	1148487	1148494	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_017333	T	6	6	1148517	1148522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017333	TAA	2	6	1148538	1148543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017333	T	6	6	1148610	1148615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017333	TAG	2	6	1152964	1152969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017333	TAA	2	6	1152992	1152997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017333	TGA	2	6	1154052	1154057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017333	AGTA	2	8	1154068	1154075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017333	TTA	2	6	1154088	1154093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017333	TTAA	2	8	1154131	1154138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017333	TAT	2	6	1154219	1154224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017333	GTA	2	6	1154287	1154292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017333	TTA	2	6	1154296	1154301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017333	AAAG	2	8	1154313	1154320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017333	GTT	2	6	1154787	1154792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017333	ATT	2	6	1154794	1154799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017333	CAAC	2	8	1154805	1154812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_017333	CTT	2	6	1156199	1156204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_017333	ATA	2	6	1156214	1156219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017333	TAA	2	6	1156223	1156228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017333	ATTT	2	8	1156248	1156255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017333	T	6	6	1156259	1156264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017333	ATT	2	6	1156275	1156280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017333	A	7	7	1156308	1156314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017333	TAT	2	6	1156345	1156350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017333	CCT	2	6	1156986	1156991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_017333	AGC	2	6	1157032	1157037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_017333	AAG	2	6	1157080	1157085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017333	TAA	2	6	1157110	1157115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017333	GAT	2	6	1157127	1157132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017333	ATA	2	6	1158026	1158031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017333	A	7	7	1158031	1158037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017333	TCA	2	6	1158065	1158070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_017333	TG	3	6	1158077	1158082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017333	ATA	2	6	1158350	1158355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017333	A	6	6	1158355	1158360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017333	AAGA	2	8	1158388	1158395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017333	ATA	2	6	1160263	1160268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017333	ATA	2	6	1160315	1160320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017333	TA	3	6	1161068	1161073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017333	ATT	2	6	1161076	1161081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017333	TA	3	6	1161167	1161172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017333	AT	3	6	1161470	1161475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017333	AGC	2	6	1161511	1161516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_017333	TAATT	2	10	1161533	1161542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017333	TGT	2	6	1161563	1161568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017333	CTT	2	6	1161569	1161574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_017333	GTCA	2	8	1161583	1161590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5088	NC_017333	TA	3	6	1161690	1161695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017333	TA	3	6	1163070	1163075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017333	TGA	2	6	1163094	1163099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017333	TTTTG	2	10	1163144	1163153	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017333	AAACA	2	10	1163189	1163198	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5093	NC_017333	TGG	2	6	1163243	1163248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017333	ATG	2	6	1163262	1163267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017333	ATA	2	6	1163291	1163296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017333	ATTTT	2	10	1163314	1163323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017333	T	6	6	1163327	1163332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017333	CAA	2	6	1163360	1163365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_017333	TGT	2	6	1163380	1163385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017333	ATT	3	9	1163404	1163412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017333	TAT	2	6	1163506	1163511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017333	TTAG	2	8	1163516	1163523	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017333	GAG	2	6	1163540	1163545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017333	TAAAA	2	10	1167015	1167024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017333	CTTAGG	2	12	1167068	1167079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5106	NC_017333	A	7	7	1167101	1167107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017333	T	6	6	1167148	1167153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017333	CAT	2	6	1168078	1168083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_017333	A	7	7	1168084	1168090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017333	ATGA	2	8	1168137	1168144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017333	TA	3	6	1168186	1168191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017333	ATC	2	6	1168226	1168231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_017333	ATG	2	6	1168253	1168258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017333	TTA	2	6	1168343	1168348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017333	TAAAT	2	10	1168377	1168386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017333	AATTT	2	10	1168436	1168445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017333	AGG	2	6	1168505	1168510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017333	ATTA	2	8	1169429	1169436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017333	T	6	6	1169965	1169970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017333	GAA	2	6	1169974	1169979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017333	T	7	7	1170024	1170030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017333	TAA	2	6	1170047	1170052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017333	GAT	2	6	1170135	1170140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017333	TAAT	2	8	1170187	1170194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017333	GTT	2	6	1170197	1170202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017333	T	6	6	1170201	1170206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017333	GGT	2	6	1170229	1170234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017333	ACTA	2	8	1171765	1171772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_017333	A	6	6	1172725	1172730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017333	TCC	2	6	1172732	1172737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_017333	TG	3	6	1172787	1172792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_017333	ATG	2	6	1172834	1172839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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