MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_2

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017332	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017332	TAA	2	6	90	95	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017332	GAAC	2	8	133	140	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017332	AT	3	6	148	153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017332	TAT	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017332	AAAT	2	8	205	212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017332	AT	3	6	211	216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017332	T	6	6	237	242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017332	AT	3	6	541	546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017332	TACA	2	8	572	579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017332	T	6	6	607	612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017332	A	6	6	615	620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017332	A	6	6	626	631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017332	TCA	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017332	TAT	2	6	1658	1663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017332	TAA	2	6	1680	1685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017332	T	6	6	1697	1702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017332	TA	5	10	1767	1776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017332	TA	3	6	1792	1797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017332	CAAGA	2	10	1802	1811	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017332	TAAA	2	8	1878	1885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017332	AATA	2	8	1904	1911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017332	ATT	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017332	A	6	6	1996	2001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017332	TAAA	2	8	2002	2009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017332	ATATT	2	10	2046	2055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017332	AACAA	2	10	2070	2079	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017332	AT	3	6	2675	2680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017332	TCG	2	6	2747	2752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017332	TTC	2	6	2803	2808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017332	TAAA	2	8	2869	2876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017332	ATT	2	6	2902	2907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017332	TTCA	2	8	2918	2925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017332	TAA	2	6	2981	2986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.