MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_5

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017330	TCTGC	2	10	3	12	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017330	CTG	2	6	118	123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017330	TGT	2	6	347	352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017330	GTT	2	6	369	374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017330	G	9	9	395	403	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017330	GGT	2	6	414	419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017330	AG	3	6	678	683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017330	TTC	2	6	698	703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017330	CT	3	6	707	712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017330	A	6	6	724	729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017330	GGT	2	6	776	781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017330	A	8	8	797	804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017330	ATGTT	2	10	1119	1128	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017330	CTG	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017330	T	6	6	1154	1159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017330	A	7	7	1178	1184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017330	AT	3	6	1195	1200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017330	T	7	7	1205	1211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017330	CAT	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017330	TTG	2	6	2379	2384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017330	TCT	2	6	2408	2413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017330	A	6	6	2427	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017330	GGT	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017330	TC	3	6	2577	2582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017330	GCC	2	6	2831	2836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017330	G	6	6	2918	2923	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017330	T	6	6	2957	2962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017330	T	6	6	2972	2977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017330	T	6	6	2987	2992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017330	CGC	2	6	3056	3061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017330	GCA	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017330	TC	3	6	3173	3178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.