MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017328	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017328	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017328	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017328	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017328	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017328	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017328	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017328	T	8	8	302	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017328	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017328	T	6	6	5070	5075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017328	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017328	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017328	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017328	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017328	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017328	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017328	A	7	7	6495	6501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017328	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017328	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017328	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017328	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017328	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017328	TGC	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017328	GCTGCC	2	12	7105	7116	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017328	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017328	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017328	GCCA	2	8	7226	7233	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017328	TTA	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017328	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017328	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017328	GGA	2	6	7426	7431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017328	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017328	GCA	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017328	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017328	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017328	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017328	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017328	A	6	6	7945	7950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017328	GCAT	2	8	7955	7962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017328	AAG	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017328	TA	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017328	TGG	2	6	8085	8090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017328	CGG	2	6	8150	8155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017328	CGT	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017328	ATC	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017328	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017328	C	6	6	9899	9904	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_017328	G	6	6	9909	9914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017328	ATC	3	9	10506	10514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017328	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017328	AAT	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017328	ATA	2	6	10569	10574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017328	GAAAAT	2	12	10612	10623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017328	CTG	2	6	11836	11841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017328	AGA	2	6	11848	11853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017328	TCTTT	2	10	11867	11876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017328	TTA	2	6	11877	11882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017328	T	6	6	11886	11891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017328	ATTC	2	8	11911	11918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017328	A	6	6	11991	11996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017328	TGA	2	6	12014	12019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017328	TAG	2	6	12039	12044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017328	AGTG	2	8	12053	12060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017328	A	7	7	12068	12074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017328	ATG	2	6	12130	12135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017328	AT	3	6	12141	12146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017328	A	6	6	14160	14165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017328	CCG	2	6	15389	15394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017328	AGG	2	6	15613	15618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017328	GACA	2	8	15683	15690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017328	CGC	2	6	15703	15708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017328	TAT	2	6	15709	15714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017328	CT	3	6	15719	15724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017328	T	6	6	15785	15790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017328	ATT	2	6	15800	15805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017328	ATT	2	6	15832	15837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017328	GAC	2	6	15838	15843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017328	ATT	2	6	15851	15856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017328	ACA	2	6	15891	15896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017328	AATT	2	8	15897	15904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017328	TAAT	2	8	15916	15923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017328	TTC	2	6	16024	16029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017328	A	6	6	16040	16045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017328	ATT	2	6	16049	16054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017328	GAT	2	6	16079	16084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017328	GA	3	6	17358	17363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017328	ATT	2	6	18342	18347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017328	AATA	2	8	18386	18393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017328	CTTC	2	8	18408	18415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017328	AGT	2	6	18433	18438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017328	CAT	2	6	18472	18477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017328	T	6	6	18531	18536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017328	ATG	2	6	18647	18652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017328	TA	3	6	19475	19480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017328	GT	3	6	19682	19687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017328	TC	3	6	19688	19693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017328	AGC	2	6	19706	19711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017328	A	7	7	19718	19724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017328	TTG	2	6	19779	19784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017328	CTT	2	6	20095	20100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017328	AGC	2	6	26149	26154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017328	T	6	6	26191	26196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017328	GAA	2	6	26199	26204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017328	TCAT	2	8	27148	27155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017328	TCCC	2	8	27178	27185	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_017328	TGGC	2	8	27219	27226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017328	TAT	2	6	28123	28128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017328	ATTTA	2	10	28145	28154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017328	TCT	2	6	28244	28249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017328	TGT	2	6	28255	28260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017328	TCT	2	6	28320	28325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017328	TGC	2	6	28326	28331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017328	GAT	2	6	28356	28361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017328	CATG	2	8	28388	28395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017328	ATA	2	6	28405	28410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017328	A	6	6	28412	28417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017328	GCC	2	6	28460	28465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017328	TCG	2	6	28479	28484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017328	TCA	2	6	28510	28515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017328	AGTG	2	8	28538	28545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017328	TGA	2	6	33015	33020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017328	T	9	9	33027	33035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017328	TGA	2	6	33072	33077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017328	TGT	2	6	33653	33658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017328	GGGC	2	8	36773	36780	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017328	GCG	2	6	38073	38078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017328	ATTT	2	8	40873	40880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017328	GTTT	2	8	40890	40897	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017328	ATT	3	9	40921	40929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017328	TTA	2	6	41045	41050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017328	A	7	7	41078	41084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017328	ACC	2	6	41157	41162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017328	ACG	2	6	41170	41175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017328	TGA	2	6	42045	42050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017328	AATCA	2	10	42071	42080	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017328	ATG	2	6	42096	42101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017328	GAT	2	6	42172	42177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017328	GGC	2	6	42271	42276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017328	GCG	2	6	42299	42304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017328	CGG	2	6	42370	42375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017328	GAA	2	6	42389	42394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017328	CAG	2	6	42427	42432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017328	GC	3	6	42536	42541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017328	TGG	2	6	42576	42581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017328	GTCG	2	8	42587	42594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017328	GCA	2	6	42603	42608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017328	ATGG	2	8	42694	42701	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_017328	TCT	2	6	127156	127161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_017328	AG	3	6	127174	127179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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404	NC_017328	GTG	2	6	174099	174104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_017328	GAA	2	6	175480	175485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
427	NC_017328	ATT	2	6	175498	175503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_017328	GCA	2	6	175524	175529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_017328	TGC	2	6	175533	175538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_017328	A	6	6	179114	179119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_017328	AT	4	8	179970	179977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_017328	CAA	2	6	180097	180102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_017328	GCC	2	6	182152	182157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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437	NC_017328	TTG	2	6	183085	183090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_017328	AAATA	2	10	183178	183187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_017328	TAA	2	6	183191	183196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_017328	TG	4	8	183252	183259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017328	GTCTG	2	10	183263	183272	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
443	NC_017328	CGC	2	6	183878	183883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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445	NC_017328	AG	3	6	185163	185168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
446	NC_017328	AGT	2	6	185225	185230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_017328	A	6	6	185324	185329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_017328	GTT	2	6	186163	186168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_017328	GCC	2	6	186175	186180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
452	NC_017328	TGG	2	6	186204	186209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017328	AGTT	2	8	188330	188337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017328	GAA	2	6	188340	188345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
455	NC_017328	ATA	2	6	188349	188354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_017328	GTAGTG	2	12	190810	190821	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_017328	CTT	2	6	211321	211326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_017328	ATT	2	6	213031	213036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_017328	TAT	2	6	213037	213042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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