MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017328	GTT	2	6	547127	547132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017328	AAC	2	6	547193	547198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_017328	G	6	6	549317	549322	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017328	CGC	2	6	549441	549446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_017328	TTTA	2	8	550802	550809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017328	AAC	2	6	552092	552097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_017328	GCA	2	6	552126	552131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_017328	TCG	2	6	552134	552139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_017328	TAT	2	6	552168	552173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017328	CATCC	2	10	552174	552183	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1511	NC_017328	ATG	3	9	552333	552341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017328	TG	3	6	552404	552409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017328	TGGGT	2	10	552417	552426	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017328	GCA	2	6	552453	552458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_017328	T	8	8	552460	552467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017328	GTG	2	6	552471	552476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017328	GTT	2	6	552481	552486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017328	CAA	2	6	552572	552577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_017328	CAC	2	6	552730	552735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1521	NC_017328	GAA	2	6	552763	552768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017328	CAG	2	6	552791	552796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_017328	CTGC	2	8	552853	552860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_017328	CCG	2	6	552899	552904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_017328	CTG	2	6	552953	552958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_017328	GCCCA	2	10	552977	552986	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1527	NC_017328	AAC	2	6	553012	553017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_017328	CAC	2	6	553067	553072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_017328	ACC	2	6	553138	553143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_017328	GCT	2	6	553164	553169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_017328	CTT	2	6	553259	553264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017328	GCT	2	6	553369	553374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_017328	T	6	6	553483	553488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1535	NC_017328	GTT	2	6	553604	553609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017328	GGC	2	6	553653	553658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_017328	CAA	2	6	553682	553687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_017328	T	7	7	553730	553736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017328	TGT	2	6	553751	553756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017328	ATC	2	6	553862	553867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_017328	GTT	2	6	553912	553917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017328	CGTT	2	8	553955	553962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_017328	TTC	2	6	553976	553981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017328	CCG	2	6	554047	554052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_017328	AGG	2	6	554055	554060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1548	NC_017328	T	6	6	554169	554174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1551	NC_017328	GCC	2	6	554281	554286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_017328	AGC	2	6	554317	554322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_017328	GCCT	2	8	554416	554423	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_017328	TGA	2	6	554459	554464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017328	TCG	2	6	554561	554566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_017328	GTT	2	6	554574	554579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017328	TGGCGA	2	12	554589	554600	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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1561	NC_017328	CGT	2	6	554830	554835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_017328	AG	3	6	554977	554982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017328	T	7	7	556187	556193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017328	GCA	2	6	556226	556231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1566	NC_017328	CT	3	6	556368	556373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_017328	AATA	2	8	556463	556470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017328	TAG	2	6	556482	556487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017328	TA	3	6	556499	556504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1572	NC_017328	T	6	6	557459	557464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1574	NC_017328	T	7	7	557489	557495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017328	T	6	6	557562	557567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1592	NC_017328	GACT	2	8	561843	561850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_017328	T	6	6	561852	561857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_017328	CTAT	2	8	564825	564832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1601	NC_017328	GGCG	2	8	564868	564875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_017328	TGA	2	6	564876	564881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1608	NC_017328	CAG	2	6	565422	565427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1612	NC_017328	TG	4	8	565575	565582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_017328	CGG	2	6	565842	565847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_017328	CG	3	6	565885	565890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_017328	CAG	2	6	565914	565919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1621	NC_017328	CGA	2	6	565996	566001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1624	NC_017328	CCAG	2	8	566077	566084	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_017328	ATGCC	2	10	566262	566271	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1627	NC_017328	CAC	2	6	566319	566324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_017328	AT	3	6	566345	566350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017328	CAG	2	6	567303	567308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1631	NC_017328	ATTT	2	8	571814	571821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017328	T	6	6	571838	571843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017328	ATTT	2	8	571844	571851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017328	T	6	6	571864	571869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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