MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_017328	AAG	2	6	4227877	4227882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16502	NC_017328	CA	3	6	4227899	4227904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16503	NC_017328	CGG	2	6	4227995	4228000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16504	NC_017328	AAC	2	6	4228148	4228153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16505	NC_017328	GTT	2	6	4228158	4228163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16506	NC_017328	TC	3	6	4228170	4228175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16507	NC_017328	GAT	2	6	4228191	4228196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16508	NC_017328	GAAA	2	8	4228202	4228209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16509	NC_017328	GCG	2	6	4228470	4228475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16510	NC_017328	AGC	2	6	4228487	4228492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16511	NC_017328	GT	5	10	4228508	4228517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16512	NC_017328	G	6	6	4228631	4228636	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16513	NC_017328	TCC	2	6	4228641	4228646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16514	NC_017328	CTGA	2	8	4228661	4228668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16515	NC_017328	GTAC	2	8	4228745	4228752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16516	NC_017328	GGA	2	6	4228950	4228955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16517	NC_017328	AC	3	6	4229168	4229173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16518	NC_017328	CGTC	2	8	4229186	4229193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16519	NC_017328	AAC	2	6	4229205	4229210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16520	NC_017328	AGC	2	6	4229295	4229300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16521	NC_017328	CAT	2	6	4229301	4229306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16522	NC_017328	AAAG	2	8	4229309	4229316	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16523	NC_017328	GTT	2	6	4229404	4229409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16524	NC_017328	G	6	6	4229646	4229651	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_017328	TGA	2	6	4229745	4229750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16526	NC_017328	CAA	2	6	4229772	4229777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16527	NC_017328	GGT	2	6	4229844	4229849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_017328	GA	3	6	4229874	4229879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16529	NC_017328	GCTG	2	8	4229988	4229995	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16530	NC_017328	TTA	2	6	4230003	4230008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16531	NC_017328	CGG	2	6	4230127	4230132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16532	NC_017328	ATG	2	6	4230203	4230208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16533	NC_017328	ACC	2	6	4230398	4230403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16534	NC_017328	TGG	2	6	4230458	4230463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16535	NC_017328	TCC	2	6	4230484	4230489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16536	NC_017328	GGA	2	6	4230501	4230506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16537	NC_017328	AGG	2	6	4230539	4230544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16538	NC_017328	GGT	2	6	4230621	4230626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16539	NC_017328	CGG	2	6	4230708	4230713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16540	NC_017328	TCA	2	6	4230736	4230741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16541	NC_017328	CGT	2	6	4230816	4230821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16542	NC_017328	G	6	6	4230865	4230870	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16543	NC_017328	GAC	3	9	4231047	4231055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16544	NC_017328	GT	3	6	4231069	4231074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16545	NC_017328	GA	3	6	4231157	4231162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16546	NC_017328	GGC	2	6	4231228	4231233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16547	NC_017328	GGT	2	6	4231242	4231247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16548	NC_017328	GTC	2	6	4231397	4231402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16549	NC_017328	C	6	6	4231418	4231423	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16550	NC_017328	AGC	2	6	4231462	4231467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16551	NC_017328	GC	3	6	4234786	4234791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16552	NC_017328	GTAG	2	8	4234814	4234821	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16553	NC_017328	CAC	2	6	4234961	4234966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16554	NC_017328	AG	3	6	4235027	4235032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16555	NC_017328	TC	3	6	4235035	4235040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16556	NC_017328	TGA	2	6	4235125	4235130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16557	NC_017328	CAC	2	6	4235237	4235242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16558	NC_017328	TCC	2	6	4235251	4235256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16559	NC_017328	T	6	6	4235260	4235265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16560	NC_017328	CAA	2	6	4235284	4235289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16561	NC_017328	CAT	2	6	4236578	4236583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16562	NC_017328	TCA	2	6	4236623	4236628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16563	NC_017328	GGTT	2	8	4236761	4236768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16564	NC_017328	A	6	6	4237711	4237716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16565	NC_017328	GCG	2	6	4237717	4237722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16566	NC_017328	T	6	6	4237801	4237806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16567	NC_017328	TTA	2	6	4237833	4237838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16570	NC_017328	GAAG	2	8	4239144	4239151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16571	NC_017328	CGC	2	6	4239156	4239161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16572	NC_017328	ATT	2	6	4239291	4239296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16573	NC_017328	CT	3	6	4239339	4239344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16574	NC_017328	GGA	2	6	4239351	4239356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16583	NC_017328	ACA	2	6	4249116	4249121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16585	NC_017328	A	7	7	4249144	4249150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16586	NC_017328	CAA	2	6	4249162	4249167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16589	NC_017328	GCGAT	2	10	4254662	4254671	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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16593	NC_017328	GGCG	2	8	4256334	4256341	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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16600	NC_017328	TGA	2	6	4256819	4256824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16607	NC_017328	CGC	2	6	4257103	4257108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16608	NC_017328	GAA	3	9	4257120	4257128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16611	NC_017328	TATTT	2	10	4257291	4257300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16614	NC_017328	C	6	6	4258789	4258794	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16615	NC_017328	G	6	6	4258810	4258815	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16616	NC_017328	A	7	7	4258818	4258824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16619	NC_017328	TGA	2	6	4266353	4266358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16621	NC_017328	GTCA	2	8	4266418	4266425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16622	NC_017328	CGG	2	6	4266488	4266493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16623	NC_017328	CA	3	6	4266507	4266512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16624	NC_017328	CGGTT	2	10	4266519	4266528	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16625	NC_017328	TG	3	6	4266648	4266653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16626	NC_017328	GGC	2	6	4266802	4266807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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