MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017328	GTA	2	6	4109006	4109011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_017328	GTC	2	6	4110460	4110465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_017328	ATT	2	6	4110484	4110489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_017328	A	6	6	4110506	4110511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_017328	ATG	2	6	4110593	4110598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_017328	GGA	2	6	4110725	4110730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_017328	T	6	6	4112635	4112640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_017328	A	6	6	4112647	4112652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_017328	T	9	9	4112671	4112679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_017328	AG	3	6	4112740	4112745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_017328	CTTT	2	8	4112786	4112793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16012	NC_017328	T	6	6	4112791	4112796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_017328	GCGTAA	2	12	4112798	4112809	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16014	NC_017328	TAA	2	6	4114567	4114572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_017328	ATG	2	6	4115708	4115713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_017328	TTCCAT	2	12	4115739	4115750	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_017328	TCCT	2	8	4115757	4115764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16018	NC_017328	GTG	2	6	4115782	4115787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_017328	A	6	6	4115985	4115990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_017328	GTGAT	2	10	4116031	4116040	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_017328	GCTG	2	8	4116097	4116104	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16022	NC_017328	GGA	2	6	4116127	4116132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_017328	CCA	2	6	4116813	4116818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16024	NC_017328	CGT	2	6	4118275	4118280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16025	NC_017328	TTA	4	12	4118281	4118292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_017328	ACAT	2	8	4118333	4118340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16027	NC_017328	GAA	2	6	4118497	4118502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_017328	CCAG	2	8	4118504	4118511	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16029	NC_017328	AAG	2	6	4118531	4118536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_017328	ACGC	2	8	4118566	4118573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16031	NC_017328	GAA	2	6	4118636	4118641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_017328	CAGG	2	8	4118645	4118652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16033	NC_017328	GCC	3	9	4118675	4118683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16034	NC_017328	GAA	2	6	4118684	4118689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_017328	CAG	2	6	4118720	4118725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_017328	GCC	2	6	4118726	4118731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16037	NC_017328	CTT	3	9	4118741	4118749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16038	NC_017328	ACA	2	6	4118827	4118832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_017328	GTAC	2	8	4118848	4118855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16040	NC_017328	CAGGC	2	10	4118972	4118981	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16041	NC_017328	TTGG	3	12	4118994	4119005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_017328	CAG	2	6	4119053	4119058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_017328	GGC	2	6	4119080	4119085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16044	NC_017328	CAG	3	9	4119152	4119160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_017328	GCC	2	6	4119173	4119178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16046	NC_017328	GCC	2	6	4119189	4119194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16047	NC_017328	CGTT	2	8	4119204	4119211	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16048	NC_017328	TCA	2	6	4119256	4119261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16049	NC_017328	GCC	2	6	4119497	4119502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16050	NC_017328	CAG	2	6	4119566	4119571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_017328	AG	3	6	4119602	4119607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_017328	TGTGA	2	10	4119650	4119659	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_017328	TTG	2	6	4121776	4121781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_017328	TTA	2	6	4121790	4121795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_017328	AT	3	6	4121828	4121833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_017328	AGCTG	2	10	4121848	4121857	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16057	NC_017328	TAA	2	6	4121867	4121872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_017328	TTC	2	6	4121911	4121916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16059	NC_017328	TGCTT	2	10	4126088	4126097	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16060	NC_017328	A	6	6	4126131	4126136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_017328	AGG	2	6	4128012	4128017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_017328	G	6	6	4130919	4130924	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_017328	CAC	2	6	4132427	4132432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16064	NC_017328	AGGA	2	8	4132450	4132457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_017328	ATGGAA	2	12	4132464	4132475	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_017328	CAT	2	6	4132500	4132505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16067	NC_017328	TAAA	2	8	4134148	4134155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_017328	AATAT	2	10	4134164	4134173	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_017328	A	6	6	4134617	4134622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_017328	TAA	2	6	4134672	4134677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_017328	A	6	6	4134720	4134725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_017328	CTTT	2	8	4134741	4134748	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16073	NC_017328	TC	3	6	4134771	4134776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16074	NC_017328	A	6	6	4135057	4135062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_017328	GTT	2	6	4135094	4135099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_017328	GCG	2	6	4135110	4135115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16077	NC_017328	AT	3	6	4135154	4135159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_017328	AGCGC	2	10	4135184	4135193	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16079	NC_017328	TCA	2	6	4135214	4135219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16080	NC_017328	GAA	2	6	4135255	4135260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_017328	GA	3	6	4135312	4135317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_017328	GTC	2	6	4135322	4135327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16083	NC_017328	GTC	2	6	4137845	4137850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16084	NC_017328	AAGG	2	8	4137876	4137883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_017328	T	6	6	4137951	4137956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_017328	CAC	2	6	4138044	4138049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16087	NC_017328	GCTTTG	2	12	4138051	4138062	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16088	NC_017328	GGA	2	6	4138077	4138082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_017328	AGT	2	6	4138193	4138198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_017328	GGT	2	6	4138221	4138226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_017328	CGT	2	6	4138268	4138273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16092	NC_017328	GCG	2	6	4138334	4138339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16093	NC_017328	CTG	2	6	4138416	4138421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16094	NC_017328	CGC	2	6	4138439	4138444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16095	NC_017328	GCGCT	2	10	4138454	4138463	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16096	NC_017328	GCG	2	6	4138575	4138580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16097	NC_017328	CCATGC	2	12	4138590	4138601	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16098	NC_017328	CCAGC	2	10	4138602	4138611	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16099	NC_017328	ACG	2	6	4138644	4138649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16100	NC_017328	CAG	2	6	4138693	4138698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_017328	AGG	2	6	4138703	4138708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_017328	GTT	2	6	4138745	4138750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_017328	CTT	2	6	4138829	4138834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16104	NC_017328	GTCA	2	8	4138959	4138966	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16105	NC_017328	TCT	2	6	4139041	4139046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16106	NC_017328	CGA	2	6	4139091	4139096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16107	NC_017328	GACA	2	8	4139185	4139192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16108	NC_017328	TTTGTT	2	12	4139202	4139213	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_017328	TCA	2	6	4139273	4139278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16110	NC_017328	CGT	2	6	4139297	4139302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16111	NC_017328	CCG	2	6	4139348	4139353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16112	NC_017328	AAG	2	6	4139368	4139373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_017328	TCA	2	6	4139378	4139383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_017328	GAA	2	6	4139391	4139396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_017328	AGT	2	6	4139414	4139419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_017328	CAG	2	6	4139433	4139438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_017328	AGGT	2	8	4139461	4139468	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_017328	CGC	3	9	4139582	4139590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16119	NC_017328	AGC	3	9	4139611	4139619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_017328	ATC	2	6	4139623	4139628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_017328	AGG	2	6	4139894	4139899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_017328	CGT	2	6	4139924	4139929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_017328	CACG	2	8	4139966	4139973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16124	NC_017328	CAG	2	6	4140030	4140035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16125	NC_017328	TAG	2	6	4140091	4140096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_017328	CCG	3	9	4140104	4140112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16127	NC_017328	GATC	2	8	4140128	4140135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16128	NC_017328	GCG	2	6	4140205	4140210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16129	NC_017328	CAC	2	6	4140222	4140227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16130	NC_017328	TGGT	2	8	4140259	4140266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16131	NC_017328	GC	3	6	4140356	4140361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16132	NC_017328	CA	3	6	4140410	4140415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16133	NC_017328	TCT	2	6	4140487	4140492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16134	NC_017328	TCA	2	6	4140494	4140499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16135	NC_017328	GCGAT	2	10	4140505	4140514	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16136	NC_017328	TGC	2	6	4140538	4140543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16137	NC_017328	CCA	2	6	4140608	4140613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16138	NC_017328	AGAT	2	8	4140680	4140687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16139	NC_017328	T	6	6	4140697	4140702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16140	NC_017328	GCA	2	6	4140782	4140787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16141	NC_017328	GTG	2	6	4140847	4140852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16142	NC_017328	CTG	2	6	4140892	4140897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16143	NC_017328	TGC	2	6	4140952	4140957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16144	NC_017328	GGGAGT	2	12	4140965	4140976	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16146	NC_017328	AT	4	8	4141950	4141957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16147	NC_017328	AT	3	6	4146371	4146376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16148	NC_017328	TGG	2	6	4146392	4146397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16151	NC_017328	ATT	2	6	4146529	4146534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16158	NC_017328	TCT	2	6	4151900	4151905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16162	NC_017328	AAT	2	6	4152851	4152856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16254	NC_017328	TATT	2	8	4173193	4173200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16255	NC_017328	T	6	6	4173229	4173234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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