MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017328	TATT	2	8	3838759	3838766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_017328	ATA	2	6	3838860	3838865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_017328	AAC	2	6	3838883	3838888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15004	NC_017328	GTTA	2	8	3838938	3838945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_017328	GGA	2	6	3840246	3840251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_017328	TTA	2	6	3840258	3840263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_017328	TAT	2	6	3840264	3840269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_017328	T	7	7	3840269	3840275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_017328	TTA	2	6	3840288	3840293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_017328	ATC	2	6	3840414	3840419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_017328	CAT	2	6	3840423	3840428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15012	NC_017328	A	6	6	3840432	3840437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_017328	ATT	2	6	3840459	3840464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_017328	ATTC	2	8	3840502	3840509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15015	NC_017328	CAC	2	6	3840567	3840572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15016	NC_017328	TAA	2	6	3841666	3841671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_017328	TAT	2	6	3841674	3841679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_017328	AAT	2	6	3841682	3841687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_017328	TTCC	2	8	3841697	3841704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15020	NC_017328	CTC	2	6	3841882	3841887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15021	NC_017328	A	6	6	3841945	3841950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_017328	AAACA	2	10	3842047	3842056	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15023	NC_017328	T	6	6	3842068	3842073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_017328	GGT	2	6	3842098	3842103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_017328	GAC	2	6	3843356	3843361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15026	NC_017328	GAT	2	6	3843437	3843442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_017328	TGG	2	6	3843809	3843814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_017328	TAAAAC	2	12	3843832	3843843	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15029	NC_017328	AT	3	6	3843856	3843861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_017328	TAG	2	6	3843886	3843891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_017328	ATT	2	6	3843906	3843911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_017328	AAGT	2	8	3844468	3844475	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_017328	GTAT	2	8	3844489	3844496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_017328	ATC	2	6	3844556	3844561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15035	NC_017328	ATA	2	6	3844577	3844582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_017328	TTCTGC	2	12	3844589	3844600	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15037	NC_017328	TCG	2	6	3844631	3844636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15038	NC_017328	CCAC	2	8	3844651	3844658	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15039	NC_017328	TG	3	6	3844815	3844820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_017328	ATAC	2	8	3844831	3844838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15041	NC_017328	ATG	2	6	3844978	3844983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_017328	GTAA	2	8	3845019	3845026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_017328	CCAC	2	8	3845033	3845040	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15044	NC_017328	AAC	2	6	3845209	3845214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15045	NC_017328	TCTT	2	8	3845271	3845278	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15046	NC_017328	GAT	2	6	3845320	3845325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_017328	CAG	2	6	3845417	3845422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15048	NC_017328	AAT	2	6	3845837	3845842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_017328	TGT	2	6	3845859	3845864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_017328	ATAAA	2	10	3845865	3845874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_017328	A	6	6	3845872	3845877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_017328	CAA	2	6	3845928	3845933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15053	NC_017328	ACA	2	6	3845977	3845982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_017328	CGA	2	6	3846036	3846041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_017328	CAG	2	6	3846067	3846072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_017328	AGAA	2	8	3846192	3846199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_017328	TGAA	2	8	3846200	3846207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_017328	CAA	2	6	3846277	3846282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_017328	T	6	6	3846294	3846299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_017328	AC	3	6	3846364	3846369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15061	NC_017328	TTAT	2	8	3846382	3846389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_017328	TAA	2	6	3848113	3848118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_017328	AGA	2	6	3848135	3848140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_017328	GAC	2	6	3848259	3848264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15065	NC_017328	CCA	2	6	3848289	3848294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15066	NC_017328	GTG	2	6	3848321	3848326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15073	NC_017328	CCA	2	6	3848844	3848849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15074	NC_017328	TGA	2	6	3849198	3849203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15082	NC_017328	ATT	2	6	3849820	3849825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_017328	ATA	2	6	3849826	3849831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_017328	AT	3	6	3849851	3849856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_017328	TAT	2	6	3849864	3849869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_017328	AT	3	6	3849868	3849873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15091	NC_017328	AT	3	6	3850045	3850050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_017328	AAT	2	6	3850088	3850093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_017328	GTA	2	6	3850098	3850103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_017328	ACCT	2	8	3850126	3850133	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15095	NC_017328	TAAA	2	8	3850157	3850164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_017328	AATT	2	8	3852958	3852965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_017328	TCA	2	6	3855692	3855697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15098	NC_017328	CTT	2	6	3855698	3855703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_017328	GGTC	2	8	3855710	3855717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15100	NC_017328	CAA	2	6	3861014	3861019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_017328	ACA	2	6	3861033	3861038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15102	NC_017328	TGG	2	6	3861046	3861051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_017328	TGT	2	6	3861055	3861060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_017328	CAC	2	6	3861119	3861124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15105	NC_017328	TCATT	2	10	3861179	3861188	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15106	NC_017328	CGT	2	6	3861219	3861224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15107	NC_017328	GAT	2	6	3861262	3861267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15109	NC_017328	GCCCG	2	10	3861475	3861484	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15110	NC_017328	A	8	8	3861751	3861758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_017328	A	7	7	3861760	3861766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_017328	TC	3	6	3861793	3861798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15113	NC_017328	AACC	2	8	3861864	3861871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15114	NC_017328	TAA	2	6	3861877	3861882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_017328	TTCA	2	8	3861903	3861910	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15116	NC_017328	GTG	2	6	3866576	3866581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_017328	AGT	2	6	3866607	3866612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_017328	CAC	2	6	3867347	3867352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15119	NC_017328	AGGA	2	8	3867370	3867377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_017328	ATGGAA	2	12	3867384	3867395	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15123	NC_017328	TTA	2	6	3867469	3867474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_017328	CGAA	2	8	3867478	3867485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15125	NC_017328	TAT	2	6	3867588	3867593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_017328	ATTA	2	8	3867642	3867649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_017328	TCA	2	6	3868426	3868431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15128	NC_017328	CAT	2	6	3868473	3868478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15129	NC_017328	TA	4	8	3868572	3868579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_017328	CAA	2	6	3868616	3868621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15131	NC_017328	TCC	2	6	3868637	3868642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15132	NC_017328	CGC	2	6	3869724	3869729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15133	NC_017328	GCG	2	6	3871644	3871649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15134	NC_017328	ATT	2	6	3873262	3873267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15135	NC_017328	TA	4	8	3873277	3873284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15136	NC_017328	TAA	2	6	3873315	3873320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15137	NC_017328	AATTA	2	10	3873375	3873384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15138	NC_017328	TAA	2	6	3873419	3873424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15140	NC_017328	A	6	6	3873506	3873511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15141	NC_017328	ATT	2	6	3874347	3874352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15142	NC_017328	A	7	7	3874395	3874401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15143	NC_017328	T	7	7	3874424	3874430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15144	NC_017328	T	9	9	3874435	3874443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15147	NC_017328	TCCT	2	8	3877479	3877486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15148	NC_017328	GTG	2	6	3877504	3877509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15149	NC_017328	CCTTT	2	10	3878309	3878318	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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15151	NC_017328	TC	3	6	3878395	3878400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15154	NC_017328	T	6	6	3879855	3879860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15155	NC_017328	ATG	2	6	3881256	3881261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15157	NC_017328	T	6	6	3881310	3881315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15160	NC_017328	CAAC	2	8	3881500	3881507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15163	NC_017328	TCCT	2	8	3881697	3881704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15164	NC_017328	TAA	2	6	3881730	3881735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15168	NC_017328	A	7	7	3881986	3881992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15241	NC_017328	CAA	2	6	3901830	3901835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15247	NC_017328	AGA	2	6	3901932	3901937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15248	NC_017328	CGA	2	6	3903563	3903568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15249	NC_017328	GAGCA	2	10	3903645	3903654	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15250	NC_017328	GGTAC	2	10	3903702	3903711	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15251	NC_017328	AGTGA	2	10	3903780	3903789	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15252	NC_017328	CCG	2	6	3903791	3903796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15253	NC_017328	CG	3	6	3903795	3903800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15254	NC_017328	GC	3	6	3903871	3903876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15255	NC_017328	ACC	2	6	3903944	3903949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15256	NC_017328	GGC	2	6	3903972	3903977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15257	NC_017328	GGGC	2	8	3904024	3904031	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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15259	NC_017328	GCA	3	9	3904086	3904094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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