MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017328	TC	3	6	3597559	3597564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14002	NC_017328	TTG	2	6	3597565	3597570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_017328	ACATG	2	10	3597612	3597621	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14004	NC_017328	T	6	6	3597643	3597648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_017328	GCG	2	6	3597796	3597801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_017328	AT	3	6	3597840	3597845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_017328	AGCGC	2	10	3597871	3597880	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14008	NC_017328	ATCA	2	8	3597933	3597940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14009	NC_017328	CCCG	2	8	3601646	3601653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14010	NC_017328	T	7	7	3602852	3602858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_017328	TGA	2	6	3602909	3602914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_017328	ATA	2	6	3602955	3602960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_017328	GATA	2	8	3602974	3602981	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_017328	A	6	6	3602987	3602992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_017328	AAT	2	6	3603031	3603036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_017328	ATT	2	6	3603097	3603102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_017328	A	6	6	3603109	3603114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_017328	A	6	6	3603137	3603142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_017328	ATT	2	6	3603161	3603166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_017328	TGA	2	6	3603614	3603619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_017328	TG	3	6	3603664	3603669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_017328	CGC	2	6	3603719	3603724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14023	NC_017328	GGC	2	6	3603762	3603767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14025	NC_017328	TTA	2	6	3605048	3605053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_017328	ATT	2	6	3605096	3605101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_017328	A	6	6	3605112	3605117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_017328	TCT	2	6	3606040	3606045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14030	NC_017328	CTC	2	6	3609494	3609499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14031	NC_017328	AGC	2	6	3609538	3609543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_017328	A	7	7	3609545	3609551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_017328	TGA	2	6	3609552	3609557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_017328	ACTTA	2	10	3609569	3609578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14035	NC_017328	A	6	6	3610963	3610968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_017328	A	6	6	3611667	3611672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_017328	GGA	2	6	3611680	3611685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14039	NC_017328	TCT	2	6	3614238	3614243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14040	NC_017328	A	7	7	3614252	3614258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_017328	CATTG	2	10	3614323	3614332	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14042	NC_017328	GCG	2	6	3614353	3614358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_017328	A	6	6	3614364	3614369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_017328	TTA	2	6	3614381	3614386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_017328	CGTA	2	8	3614407	3614414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14046	NC_017328	GATG	2	8	3615147	3615154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_017328	GAA	2	6	3615184	3615189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14049	NC_017328	GATAC	2	10	3618166	3618175	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14050	NC_017328	GAAA	2	8	3624248	3624255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_017328	ATAG	2	8	3624298	3624305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_017328	CA	3	6	3624738	3624743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14053	NC_017328	CTTC	2	8	3624839	3624846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14054	NC_017328	T	7	7	3624941	3624947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_017328	TTC	2	6	3624950	3624955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14057	NC_017328	GCC	2	6	3630011	3630016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14058	NC_017328	ACG	2	6	3630019	3630024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14059	NC_017328	TTC	2	6	3630034	3630039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_017328	AAG	2	6	3630050	3630055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_017328	GC	3	6	3630075	3630080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14062	NC_017328	GTA	2	6	3630121	3630126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_017328	TGT	2	6	3630128	3630133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_017328	CAT	2	6	3630134	3630139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14066	NC_017328	TGT	2	6	3630316	3630321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_017328	ATT	2	6	3631964	3631969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_017328	AAT	2	6	3632032	3632037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_017328	ATA	2	6	3632070	3632075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14072	NC_017328	ATCC	2	8	3633954	3633961	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14073	NC_017328	A	8	8	3633977	3633984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_017328	ATTT	2	8	3634016	3634023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_017328	A	6	6	3634044	3634049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14079	NC_017328	AT	4	8	3634192	3634199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14082	NC_017328	TAT	2	6	3634348	3634353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_017328	CG	3	6	3634368	3634373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14084	NC_017328	ATT	2	6	3634406	3634411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14099	NC_017328	TGG	2	6	3636583	3636588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14104	NC_017328	TGA	2	6	3636866	3636871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_017328	ATA	2	6	3636913	3636918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_017328	CTCAT	2	10	3636984	3636993	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14107	NC_017328	AAT	2	6	3636996	3637001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_017328	GAAAA	2	10	3637032	3637041	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_017328	TC	3	6	3637072	3637077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14110	NC_017328	TTG	2	6	3637156	3637161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14113	NC_017328	GAG	2	6	3637249	3637254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_017328	ATA	2	6	3637260	3637265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14117	NC_017328	CT	3	6	3637356	3637361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14118	NC_017328	CAA	2	6	3637365	3637370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14120	NC_017328	T	6	6	3637513	3637518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_017328	TAA	2	6	3637564	3637569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_017328	ATA	2	6	3637570	3637575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_017328	T	7	7	3637587	3637593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_017328	A	6	6	3637601	3637606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_017328	ATC	2	6	3637641	3637646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14261	NC_017328	AGATGC	2	12	3666452	3666463	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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14265	NC_017328	CA	3	6	3667161	3667166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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