MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017328	ATCT	2	8	3408939	3408946	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13502	NC_017328	TGC	3	9	3409012	3409020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_017328	T	6	6	3409028	3409033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_017328	CAAAA	2	10	3410127	3410136	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13505	NC_017328	T	6	6	3410156	3410161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_017328	ATT	2	6	3410162	3410167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_017328	GGT	2	6	3411318	3411323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_017328	ACA	2	6	3411351	3411356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13509	NC_017328	AATT	2	8	3411370	3411377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_017328	ATT	2	6	3411460	3411465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_017328	CTT	2	6	3411471	3411476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13512	NC_017328	AAT	2	6	3411516	3411521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_017328	ACC	2	6	3411531	3411536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13514	NC_017328	GGC	2	6	3412041	3412046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_017328	CTT	2	6	3412078	3412083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13516	NC_017328	CAT	2	6	3412127	3412132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_017328	ATAC	2	8	3412144	3412151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13518	NC_017328	A	7	7	3412155	3412161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_017328	TAAT	2	8	3412201	3412208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_017328	AATA	2	8	3412209	3412216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_017328	T	6	6	3412223	3412228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_017328	T	6	6	3412233	3412238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_017328	TTA	2	6	3412240	3412245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_017328	ATTA	2	8	3412294	3412301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_017328	AAT	2	6	3412306	3412311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_017328	CGA	2	6	3412667	3412672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13527	NC_017328	T	8	8	3412694	3412701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_017328	A	6	6	3413037	3413042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_017328	AT	3	6	3416297	3416302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_017328	TAT	2	6	3416329	3416334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_017328	ATTA	2	8	3417394	3417401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_017328	AAT	2	6	3417412	3417417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_017328	GTTA	2	8	3418885	3418892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_017328	T	6	6	3418906	3418911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_017328	GCG	2	6	3418925	3418930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13536	NC_017328	GGC	2	6	3422877	3422882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_017328	CAGG	2	8	3426573	3426580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13538	NC_017328	CTGC	2	8	3426598	3426605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13539	NC_017328	GCA	2	6	3427718	3427723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13540	NC_017328	ATC	2	6	3427740	3427745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_017328	CAG	2	6	3427821	3427826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13542	NC_017328	TCAT	2	8	3427857	3427864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13543	NC_017328	TGC	2	6	3427874	3427879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_017328	GC	3	6	3427921	3427926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13545	NC_017328	GCTTT	2	10	3429979	3429988	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13546	NC_017328	ATT	2	6	3430015	3430020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_017328	CAT	2	6	3430029	3430034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13548	NC_017328	AAT	2	6	3431040	3431045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_017328	AG	3	6	3431047	3431052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_017328	CAT	2	6	3431067	3431072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13551	NC_017328	CTC	2	6	3431205	3431210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13552	NC_017328	ATT	2	6	3431220	3431225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_017328	AAT	2	6	3431315	3431320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_017328	GTTG	2	8	3431379	3431386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_017328	GTC	2	6	3431465	3431470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_017328	ATT	2	6	3431499	3431504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_017328	GGCT	2	8	3431550	3431557	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13558	NC_017328	AAG	2	6	3431582	3431587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_017328	GAT	2	6	3431595	3431600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_017328	TTG	2	6	3431627	3431632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_017328	TCC	2	6	3431744	3431749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13562	NC_017328	T	6	6	3431808	3431813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_017328	GGA	2	6	3431817	3431822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_017328	AGC	2	6	3431824	3431829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13565	NC_017328	CTG	2	6	3431898	3431903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13566	NC_017328	CGG	2	6	3431950	3431955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13567	NC_017328	T	6	6	3433871	3433876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_017328	TTC	2	6	3433919	3433924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13569	NC_017328	ATT	2	6	3436590	3436595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13573	NC_017328	A	6	6	3436793	3436798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_017328	CGC	2	6	3436810	3436815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13575	NC_017328	T	6	6	3438191	3438196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13578	NC_017328	CT	3	6	3441377	3441382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13579	NC_017328	CGC	2	6	3441418	3441423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13595	NC_017328	CCAG	2	8	3443141	3443148	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13600	NC_017328	TTGAT	2	10	3445287	3445296	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_017328	ACC	2	6	3445390	3445395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13603	NC_017328	GTG	2	6	3445451	3445456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13605	NC_017328	GCC	2	6	3445649	3445654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13608	NC_017328	CGT	3	9	3445826	3445834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13614	NC_017328	ACC	2	6	3446256	3446261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13621	NC_017328	GCC	2	6	3446749	3446754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13622	NC_017328	TAA	2	6	3446874	3446879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_017328	CAGC	2	8	3446887	3446894	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13624	NC_017328	TC	3	6	3447003	3447008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13625	NC_017328	ACC	2	6	3447033	3447038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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