MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017328	CTA	2	6	2838398	2838403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_017328	CGG	2	6	2838406	2838411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_017328	AATG	2	8	2838431	2838438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_017328	TGTT	2	8	2838468	2838475	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_017328	CTG	2	6	2838542	2838547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_017328	TGGTC	2	10	2838550	2838559	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11507	NC_017328	TTC	2	6	2838566	2838571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_017328	ACC	2	6	2838593	2838598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11509	NC_017328	A	6	6	2838636	2838641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_017328	TCA	2	6	2840850	2840855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_017328	CTTG	2	8	2841271	2841278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11512	NC_017328	TGAT	2	8	2844611	2844618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_017328	ACT	2	6	2844629	2844634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_017328	TTTA	2	8	2844651	2844658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_017328	CGC	2	6	2847409	2847414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11516	NC_017328	CAT	2	6	2849713	2849718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_017328	CGT	2	6	2849752	2849757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_017328	CCGC	2	8	2849783	2849790	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11519	NC_017328	TGA	2	6	2850516	2850521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_017328	CGC	2	6	2856161	2856166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11521	NC_017328	T	6	6	2857426	2857431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_017328	TTA	2	6	2857453	2857458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_017328	TCG	2	6	2857486	2857491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_017328	CAT	2	6	2857514	2857519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_017328	ATT	2	6	2857524	2857529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_017328	ATT	2	6	2857558	2857563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_017328	TAGT	2	8	2861234	2861241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_017328	ATCTTA	2	12	2863792	2863803	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11529	NC_017328	A	6	6	2867506	2867511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_017328	AT	3	6	2867533	2867538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_017328	TTA	2	6	2867571	2867576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_017328	CT	3	6	2867595	2867600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11533	NC_017328	T	6	6	2867600	2867605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_017328	ACTT	2	8	2867617	2867624	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11535	NC_017328	ATA	2	6	2867638	2867643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_017328	GGT	2	6	2867778	2867783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_017328	CAA	2	6	2867810	2867815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_017328	ATT	2	6	2867858	2867863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_017328	ATA	2	6	2867879	2867884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_017328	TGA	2	6	2867917	2867922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_017328	ACA	2	6	2868004	2868009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_017328	ATT	2	6	2868024	2868029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_017328	ATG	2	6	2868044	2868049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_017328	GGC	2	6	2868111	2868116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_017328	CTT	2	6	2868147	2868152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_017328	GCG	2	6	2869015	2869020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_017328	ATC	2	6	2869071	2869076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11549	NC_017328	AATGGG	2	12	2869200	2869211	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11551	NC_017328	CGC	2	6	2869320	2869325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11552	NC_017328	CTG	2	6	2869351	2869356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_017328	TGG	2	6	2869361	2869366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_017328	TTC	2	6	2869449	2869454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_017328	CTGG	2	8	2869495	2869502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11556	NC_017328	TGG	2	6	2869536	2869541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_017328	ATT	2	6	2869687	2869692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_017328	GTT	2	6	2869698	2869703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_017328	TGC	2	6	2869719	2869724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_017328	GATGT	2	10	2869771	2869780	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_017328	CGT	2	6	2869785	2869790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_017328	GCC	2	6	2869798	2869803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11563	NC_017328	TGG	2	6	2869841	2869846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_017328	AGA	2	6	2869998	2870003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11569	NC_017328	A	7	7	2870594	2870600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11574	NC_017328	AT	3	6	2871760	2871765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_017328	A	7	7	2871767	2871773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11580	NC_017328	CAT	2	6	2872812	2872817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11582	NC_017328	T	7	7	2872897	2872903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_017328	CG	3	6	2875281	2875286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11595	NC_017328	CAAA	2	8	2878413	2878420	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11599	NC_017328	ATT	2	6	2884875	2884880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_017328	GGT	2	6	2885289	2885294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_017328	AAT	2	6	2888181	2888186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11607	NC_017328	ATA	3	9	2890849	2890857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_017328	TA	3	6	2890867	2890872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_017328	A	6	6	2890880	2890885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_017328	A	7	7	2890895	2890901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11619	NC_017328	TAA	2	6	2895815	2895820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11621	NC_017328	AACC	2	8	2895871	2895878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11622	NC_017328	GT	3	6	2896383	2896388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_017328	CGG	2	6	2896389	2896394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11626	NC_017328	T	7	7	2898295	2898301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_017328	TCA	2	6	2898308	2898313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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