MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017328	A	7	7	2732308	2732314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_017328	ACA	2	6	2732373	2732378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_017328	CTTTGG	2	12	2733955	2733966	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11004	NC_017328	CG	3	6	2734044	2734049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11005	NC_017328	T	6	6	2734106	2734111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_017328	AGC	2	6	2734207	2734212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_017328	GAT	2	6	2734216	2734221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_017328	GGC	2	6	2734225	2734230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_017328	TG	3	6	2734248	2734253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_017328	G	6	6	2734264	2734269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_017328	ATT	2	6	2734312	2734317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_017328	CA	3	6	2734391	2734396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11013	NC_017328	ATTA	2	8	2734851	2734858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_017328	TATT	2	8	2734886	2734893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_017328	TGA	2	6	2734898	2734903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_017328	TA	3	6	2734933	2734938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_017328	TTAT	2	8	2734955	2734962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_017328	TTA	2	6	2734965	2734970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_017328	ATG	2	6	2735056	2735061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_017328	TGA	2	6	2735066	2735071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_017328	TGC	2	6	2735189	2735194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_017328	GAC	2	6	2735213	2735218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_017328	TTC	2	6	2735343	2735348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_017328	TGT	2	6	2735421	2735426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_017328	TGC	2	6	2735437	2735442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_017328	TAT	2	6	2735515	2735520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_017328	AATA	2	8	2738976	2738983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_017328	CAA	2	6	2738991	2738996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_017328	CAGTTT	2	12	2739049	2739060	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11030	NC_017328	ACG	2	6	2739148	2739153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_017328	ATAA	2	8	2739186	2739193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_017328	ATT	2	6	2742037	2742042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_017328	CGC	2	6	2742114	2742119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11034	NC_017328	CTACA	2	10	2742123	2742132	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11035	NC_017328	CAA	2	6	2742209	2742214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_017328	CCAAA	2	10	2744933	2744942	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11037	NC_017328	AGCA	2	8	2744986	2744993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11038	NC_017328	TTTG	2	8	2745041	2745048	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_017328	TATC	2	8	2745069	2745076	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11040	NC_017328	CAC	2	6	2745167	2745172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11041	NC_017328	TCC	2	6	2745177	2745182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11042	NC_017328	CCAG	2	8	2745184	2745191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11043	NC_017328	CGC	2	6	2745208	2745213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11044	NC_017328	ATG	2	6	2745277	2745282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_017328	ATT	2	6	2745360	2745365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_017328	GCG	2	6	2745370	2745375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_017328	GCC	2	6	2745483	2745488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11048	NC_017328	TGA	2	6	2745494	2745499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_017328	ATTG	2	8	2745533	2745540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_017328	TG	3	6	2745600	2745605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_017328	TTTG	2	8	2745629	2745636	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_017328	GAA	2	6	2745660	2745665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_017328	CGT	2	6	2745702	2745707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_017328	TTC	2	6	2745709	2745714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_017328	GCC	2	6	2745717	2745722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11056	NC_017328	GCA	2	6	2745799	2745804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_017328	CGG	2	6	2745935	2745940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_017328	ACC	2	6	2745963	2745968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11059	NC_017328	TCT	2	6	2745981	2745986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_017328	TGGCG	2	10	2746003	2746012	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11061	NC_017328	CG	3	6	2746011	2746016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11062	NC_017328	GCG	2	6	2746111	2746116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_017328	TGA	2	6	2746166	2746171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_017328	GCG	2	6	2746174	2746179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_017328	CG	3	6	2746189	2746194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11066	NC_017328	ATGAA	2	10	2746219	2746228	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_017328	CCG	2	6	2746273	2746278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11068	NC_017328	GAT	2	6	2746301	2746306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_017328	CA	3	6	2746340	2746345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11070	NC_017328	CTG	2	6	2746366	2746371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_017328	GGT	2	6	2746386	2746391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_017328	TGA	2	6	2746400	2746405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_017328	CGG	2	6	2746525	2746530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_017328	AGA	2	6	2746532	2746537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11076	NC_017328	GTA	2	6	2746623	2746628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11080	NC_017328	GAT	2	6	2746835	2746840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11082	NC_017328	T	7	7	2750099	2750105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_017328	A	7	7	2750743	2750749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_017328	ATT	2	6	2751199	2751204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11091	NC_017328	T	7	7	2751386	2751392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_017328	A	6	6	2751409	2751414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_017328	AGAA	2	8	2751435	2751442	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11095	NC_017328	GC	3	6	2753285	2753290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11096	NC_017328	CG	3	6	2753306	2753311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11097	NC_017328	TTG	2	6	2753369	2753374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11099	NC_017328	CGT	2	6	2753423	2753428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_017328	TTA	2	6	2757385	2757390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_017328	GTC	2	6	2757403	2757408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11103	NC_017328	GTTT	2	8	2758835	2758842	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_017328	T	6	6	2758840	2758845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_017328	TTG	2	6	2760509	2760514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11107	NC_017328	TTAG	2	8	2760593	2760600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_017328	GAG	2	6	2760617	2760622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_017328	AGG	2	6	2760644	2760649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11111	NC_017328	ACC	2	6	2760895	2760900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11112	NC_017328	GCC	2	6	2760909	2760914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11113	NC_017328	TCT	2	6	2760977	2760982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11117	NC_017328	C	6	6	2761272	2761277	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11118	NC_017328	ACG	2	6	2761321	2761326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_017328	TGA	2	6	2761401	2761406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11121	NC_017328	ACC	2	6	2761516	2761521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11122	NC_017328	CCT	2	6	2761598	2761603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11123	NC_017328	CTC	2	6	2761635	2761640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11124	NC_017328	AGG	2	6	2761652	2761657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_017328	CCA	2	6	2761679	2761684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11126	NC_017328	GGT	2	6	2761739	2761744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_017328	CAT	2	6	2761934	2761939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11129	NC_017328	TAA	2	6	2762134	2762139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_017328	CAGC	2	8	2762147	2762154	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11245	NC_017328	GCCA	2	8	2781668	2781675	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11254	NC_017328	TAA	2	6	2783831	2783836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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