MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_017328	GAT	2	6	2622584	2622589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_017328	AGCA	2	8	2625512	2625519	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10503	NC_017328	TTG	2	6	2625536	2625541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_017328	T	7	7	2625551	2625557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_017328	AAC	2	6	2625572	2625577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_017328	GCTG	2	8	2626664	2626671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10507	NC_017328	T	6	6	2626751	2626756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_017328	CAT	2	6	2626773	2626778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_017328	ATT	2	6	2627528	2627533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_017328	TGG	2	6	2627632	2627637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_017328	GCG	2	6	2627638	2627643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_017328	CAT	2	6	2627651	2627656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_017328	TGG	3	9	2627785	2627793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_017328	GCG	3	9	2627844	2627852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_017328	CTT	2	6	2627858	2627863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_017328	CATCG	2	10	2627876	2627885	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10517	NC_017328	CTG	2	6	2627895	2627900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_017328	ATG	2	6	2627940	2627945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_017328	CAGG	2	8	2627975	2627982	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10520	NC_017328	T	6	6	2628015	2628020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_017328	CTT	2	6	2628056	2628061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10522	NC_017328	GAT	2	6	2631949	2631954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_017328	CGC	2	6	2634229	2634234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10524	NC_017328	CTG	2	6	2634317	2634322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_017328	TAT	2	6	2634344	2634349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_017328	ATG	2	6	2634354	2634359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_017328	ACG	2	6	2634384	2634389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_017328	TAT	2	6	2634419	2634424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_017328	GTG	2	6	2634461	2634466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_017328	GTCA	2	8	2634502	2634509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10531	NC_017328	CG	3	6	2634513	2634518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10532	NC_017328	GCGA	2	8	2634537	2634544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10533	NC_017328	CGA	2	6	2634678	2634683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_017328	CCT	2	6	2634762	2634767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10535	NC_017328	TTGT	2	8	2634788	2634795	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_017328	CTT	2	6	2634895	2634900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_017328	GT	3	6	2634911	2634916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_017328	CTG	2	6	2635016	2635021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_017328	TTG	2	6	2635074	2635079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_017328	TGG	2	6	2635183	2635188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_017328	CGC	2	6	2635193	2635198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10542	NC_017328	GC	3	6	2635249	2635254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10543	NC_017328	TGC	2	6	2635278	2635283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_017328	AAC	2	6	2635302	2635307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_017328	CGAC	2	8	2635330	2635337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10546	NC_017328	TTTACC	2	12	2635450	2635461	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_017328	GGC	2	6	2635462	2635467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_017328	ACA	2	6	2635541	2635546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10549	NC_017328	CTG	2	6	2635561	2635566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_017328	TTG	2	6	2635610	2635615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_017328	GCC	2	6	2635690	2635695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10552	NC_017328	TGC	2	6	2635727	2635732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_017328	ACCG	2	8	2635795	2635802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10554	NC_017328	CGC	2	6	2635889	2635894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10555	NC_017328	TAA	2	6	2637633	2637638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_017328	CGC	2	6	2637679	2637684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10557	NC_017328	TTA	2	6	2637756	2637761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_017328	GCC	3	9	2637779	2637787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10559	NC_017328	ATG	3	9	2637850	2637858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_017328	CAA	2	6	2637874	2637879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_017328	ATT	2	6	2637904	2637909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_017328	AGT	2	6	2637933	2637938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_017328	CTGG	2	8	2638010	2638017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10564	NC_017328	ATG	2	6	2638054	2638059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_017328	CAG	2	6	2638065	2638070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_017328	ATC	3	9	2638102	2638110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_017328	TGG	2	6	2638117	2638122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_017328	CGA	2	6	2638157	2638162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10569	NC_017328	CAT	2	6	2638191	2638196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10570	NC_017328	T	6	6	2638196	2638201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_017328	TCAG	2	8	2638212	2638219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10572	NC_017328	ATC	2	6	2638234	2638239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10573	NC_017328	CA	3	6	2638303	2638308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10574	NC_017328	GAT	2	6	2638380	2638385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_017328	TTA	2	6	2638410	2638415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_017328	TTG	2	6	2638491	2638496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_017328	CT	3	6	2638516	2638521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10578	NC_017328	CTA	2	6	2638542	2638547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10579	NC_017328	ATCGC	2	10	2638561	2638570	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10580	NC_017328	TGCC	2	8	2638592	2638599	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10581	NC_017328	GCA	2	6	2638628	2638633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10582	NC_017328	ACC	2	6	2638639	2638644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10583	NC_017328	AGC	2	6	2638654	2638659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10584	NC_017328	TATC	2	8	2638688	2638695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10585	NC_017328	CAG	2	6	2638722	2638727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10587	NC_017328	CGACA	2	10	2638827	2638836	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10588	NC_017328	TCT	2	6	2638877	2638882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10589	NC_017328	GGC	2	6	2638965	2638970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10592	NC_017328	CGG	2	6	2639060	2639065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_017328	GCC	2	6	2639100	2639105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10595	NC_017328	GC	3	6	2639256	2639261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10596	NC_017328	CCGA	2	8	2639289	2639296	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10597	NC_017328	GAGC	2	8	2639361	2639368	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10598	NC_017328	CTG	2	6	2639373	2639378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10599	NC_017328	TGC	2	6	2639479	2639484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10601	NC_017328	GAA	3	9	2639508	2639516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_017328	TTG	2	6	2639557	2639562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_017328	GCG	2	6	2639577	2639582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10604	NC_017328	CAC	2	6	2639603	2639608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10605	NC_017328	GCT	2	6	2639609	2639614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10606	NC_017328	AAAC	2	8	2639687	2639694	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10607	NC_017328	GCC	2	6	2639748	2639753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10608	NC_017328	TGG	2	6	2639908	2639913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10610	NC_017328	TTA	2	6	2640013	2640018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_017328	TGG	2	6	2640049	2640054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_017328	TGA	2	6	2640115	2640120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10614	NC_017328	CGTT	2	8	2640258	2640265	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10615	NC_017328	TCG	2	6	2640277	2640282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10616	NC_017328	TTTG	2	8	2640341	2640348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_017328	GCCATT	2	12	2640360	2640371	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10619	NC_017328	TTA	2	6	2640451	2640456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_017328	CGG	2	6	2640494	2640499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10621	NC_017328	TATT	2	8	2640530	2640537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_017328	TCG	2	6	2640577	2640582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10623	NC_017328	TATT	2	8	2640586	2640593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_017328	TCG	2	6	2640633	2640638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10625	NC_017328	TATT	2	8	2640642	2640649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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