MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_017328	AGAA	2	8	2504788	2504795	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_017328	T	6	6	2504843	2504848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_017328	A	7	7	2508405	2508411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_017328	TAAA	2	8	2508412	2508419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_017328	T	7	7	2508449	2508455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_017328	AGA	2	6	2508509	2508514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_017328	AAGAA	2	10	2508515	2508524	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_017328	CGTA	2	8	2508552	2508559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10010	NC_017328	TGC	2	6	2508926	2508931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_017328	GTT	2	6	2508936	2508941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_017328	A	6	6	2509070	2509075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_017328	AAAT	2	8	2509203	2509210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10015	NC_017328	TTGC	2	8	2510646	2510653	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10017	NC_017328	TAAA	2	8	2510852	2510859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_017328	T	6	6	2510866	2510871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_017328	AT	4	8	2510893	2510900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_017328	ATCA	2	8	2510910	2510917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10021	NC_017328	ATT	2	6	2511993	2511998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_017328	T	6	6	2512006	2512011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10035	NC_017328	CTCCC	2	10	2513319	2513328	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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10041	NC_017328	GGC	2	6	2516016	2516021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_017328	CAA	2	6	2516045	2516050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_017328	T	7	7	2516788	2516794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10047	NC_017328	ATA	2	6	2518439	2518444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_017328	CAATA	2	10	2519524	2519533	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10049	NC_017328	A	6	6	2519533	2519538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_017328	AAT	2	6	2519543	2519548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_017328	AAGT	2	8	2519607	2519614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_017328	GAA	2	6	2519646	2519651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_017328	TGC	2	6	2521280	2521285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10055	NC_017328	TAT	2	6	2524045	2524050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10057	NC_017328	ATTC	2	8	2524096	2524103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10058	NC_017328	A	8	8	2524175	2524182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10061	NC_017328	CATTT	2	10	2524305	2524314	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10062	NC_017328	TAC	2	6	2524415	2524420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_017328	AAT	2	6	2524452	2524457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_017328	T	7	7	2525096	2525102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10068	NC_017328	CAA	2	6	2525213	2525218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_017328	A	8	8	2525241	2525248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_017328	TTG	2	6	2525286	2525291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10096	NC_017328	TAT	2	6	2535301	2535306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10098	NC_017328	CTGATG	2	12	2535699	2535710	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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10101	NC_017328	TGCG	2	8	2536110	2536117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10102	NC_017328	T	6	6	2536123	2536128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10109	NC_017328	CTC	2	6	2537281	2537286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10110	NC_017328	ATA	2	6	2537296	2537301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_017328	T	6	6	2537321	2537326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_017328	T	6	6	2537333	2537338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_017328	ATT	2	6	2537356	2537361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_017328	GAC	2	6	2537739	2537744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10116	NC_017328	TCTG	2	8	2539074	2539081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10117	NC_017328	CAC	2	6	2539170	2539175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10118	NC_017328	TTA	2	6	2539181	2539186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_017328	CCAG	2	8	2539210	2539217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_017328	CTG	2	6	2539303	2539308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_017328	TCA	2	6	2539310	2539315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_017328	TGC	2	6	2539384	2539389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_017328	TTCT	2	8	2539431	2539438	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10124	NC_017328	ACGT	2	8	2539579	2539586	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10125	NC_017328	CGG	2	6	2539604	2539609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_017328	CAT	2	6	2539634	2539639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_017328	CGG	2	6	2539682	2539687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_017328	T	6	6	2542228	2542233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_017328	ATC	2	6	2542247	2542252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_017328	GAT	2	6	2542329	2542334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_017328	ATC	2	6	2542346	2542351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_017328	AAAT	2	8	2546139	2546146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_017328	CGT	2	6	2546183	2546188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10134	NC_017328	GC	3	6	2546294	2546299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10135	NC_017328	CGT	2	6	2546302	2546307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10136	NC_017328	CTG	2	6	2546312	2546317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10137	NC_017328	AAT	2	6	2548797	2548802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_017328	AGGA	2	8	2548933	2548940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_017328	TTCT	2	8	2549938	2549945	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10140	NC_017328	AAC	3	9	2549970	2549978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10141	NC_017328	AGGC	2	8	2549986	2549993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10142	NC_017328	CA	3	6	2550017	2550022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10143	NC_017328	A	6	6	2551369	2551374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10144	NC_017328	GAT	2	6	2551405	2551410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10145	NC_017328	GGC	2	6	2551502	2551507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10146	NC_017328	GCA	2	6	2551533	2551538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10147	NC_017328	CGC	2	6	2551908	2551913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10148	NC_017328	ATGCT	2	10	2553223	2553232	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10149	NC_017328	TGA	2	6	2553313	2553318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10150	NC_017328	GTTATG	2	12	2553326	2553337	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_017328	ACA	2	6	2553378	2553383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10152	NC_017328	GT	4	8	2553441	2553448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10153	NC_017328	CATA	2	8	2554729	2554736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10154	NC_017328	A	7	7	2554736	2554742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_017328	T	6	6	2554761	2554766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10156	NC_017328	CTG	3	9	2554849	2554857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10157	NC_017328	ATC	2	6	2554928	2554933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10158	NC_017328	TGA	2	6	2554983	2554988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10159	NC_017328	TCA	2	6	2555042	2555047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10160	NC_017328	GCT	2	6	2555076	2555081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10161	NC_017328	TGT	2	6	2555085	2555090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10162	NC_017328	TGC	2	6	2555094	2555099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10163	NC_017328	CTC	2	6	2555122	2555127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10164	NC_017328	AAT	2	6	2555182	2555187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10165	NC_017328	GCA	2	6	2555208	2555213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10166	NC_017328	T	6	6	2555251	2555256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10167	NC_017328	GT	3	6	2555266	2555271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10168	NC_017328	GCCA	2	8	2555273	2555280	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10170	NC_017328	CG	3	6	2555315	2555320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10171	NC_017328	GCC	2	6	2555371	2555376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10172	NC_017328	CG	3	6	2555390	2555395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10173	NC_017328	TCA	2	6	2555402	2555407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10174	NC_017328	TTG	2	6	2555423	2555428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10178	NC_017328	GCCA	2	8	2555579	2555586	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10179	NC_017328	CAA	2	6	2555599	2555604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10186	NC_017328	GCG	2	6	2556001	2556006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10188	NC_017328	GAT	2	6	2556214	2556219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10197	NC_017328	CA	3	6	2556589	2556594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10198	NC_017328	A	6	6	2556636	2556641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10199	NC_017328	GA	3	6	2556642	2556647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10200	NC_017328	GCCA	2	8	2556703	2556710	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10201	NC_017328	T	6	6	2556858	2556863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10204	NC_017328	AAT	2	6	2556927	2556932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10211	NC_017328	CATGC	2	10	2557246	2557255	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10212	NC_017328	CAT	2	6	2557316	2557321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10227	NC_017328	CGG	2	6	2560151	2560156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10234	NC_017328	TTGAG	2	10	2560330	2560339	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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10236	NC_017328	GCGA	2	8	2560382	2560389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10237	NC_017328	CCA	2	6	2560410	2560415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10238	NC_017328	A	6	6	2560420	2560425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10239	NC_017328	T	6	6	2560441	2560446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10240	NC_017328	GATT	2	8	2560465	2560472	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10241	NC_017328	TCT	2	6	2560475	2560480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10242	NC_017328	TTC	2	6	2560492	2560497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10243	NC_017328	CTTCAA	2	12	2560548	2560559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10244	NC_017328	TTCC	2	8	2560560	2560567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10245	NC_017328	AGT	2	6	2560580	2560585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_017328	CG	3	6	2560624	2560629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10247	NC_017328	ATC	2	6	2560643	2560648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10248	NC_017328	ACTC	2	8	2560651	2560658	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10249	NC_017328	CAG	2	6	2560775	2560780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10250	NC_017328	AGC	2	6	2560803	2560808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10251	NC_017328	A	6	6	2560845	2560850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_017328	TTC	2	6	2561799	2561804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_017328	GAA	2	6	2561844	2561849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_017328	ATC	2	6	2561867	2561872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_017328	CAAGTG	2	12	2566244	2566255	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10256	NC_017328	AGAT	2	8	2566279	2566286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10258	NC_017328	TG	3	6	2567191	2567196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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