MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_017328	TAG	2	6	2247197	2247202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_017328	CCA	2	6	2247208	2247213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9003	NC_017328	GAAAAA	2	12	2247222	2247233	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_017328	AGA	2	6	2247294	2247299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_017328	AT	3	6	2247324	2247329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_017328	GAA	2	6	2247361	2247366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_017328	TAC	2	6	2247369	2247374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_017328	ACG	2	6	2247402	2247407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_017328	AT	3	6	2247420	2247425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_017328	ATT	2	6	2247467	2247472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_017328	TTCA	2	8	2247500	2247507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9012	NC_017328	ATT	2	6	2247518	2247523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_017328	ACA	2	6	2247541	2247546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_017328	ATACCG	2	12	2247606	2247617	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_017328	CAA	2	6	2247754	2247759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9016	NC_017328	CTG	2	6	2247827	2247832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_017328	GCG	2	6	2247836	2247841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_017328	TCA	2	6	2247907	2247912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_017328	CTC	2	6	2248103	2248108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9020	NC_017328	CAA	2	6	2253621	2253626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_017328	ATCA	2	8	2253627	2253634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9022	NC_017328	TTA	2	6	2253714	2253719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_017328	CCTTAC	2	12	2253738	2253749	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
9024	NC_017328	TTG	2	6	2253775	2253780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_017328	CAC	2	6	2253821	2253826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9026	NC_017328	GGT	2	6	2253925	2253930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_017328	TTCG	2	8	2253936	2253943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9028	NC_017328	GTG	2	6	2253968	2253973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_017328	TAAA	2	8	2253990	2253997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_017328	CAG	2	6	2254012	2254017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_017328	T	8	8	2254018	2254025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_017328	AAC	2	6	2254063	2254068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_017328	TA	3	6	2260713	2260718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_017328	TAAA	2	8	2261525	2261532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_017328	CGG	2	6	2262012	2262017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_017328	GCC	2	6	2262032	2262037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9037	NC_017328	TTC	2	6	2262054	2262059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_017328	GC	3	6	2262068	2262073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9039	NC_017328	CGC	2	6	2262109	2262114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9040	NC_017328	GC	3	6	2262141	2262146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9041	NC_017328	ATC	2	6	2262147	2262152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9042	NC_017328	CTG	2	6	2262182	2262187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_017328	TGT	2	6	2262327	2262332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_017328	TCAGAT	2	12	2262334	2262345	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9045	NC_017328	GCCA	2	8	2262421	2262428	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9046	NC_017328	CAG	2	6	2262461	2262466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_017328	AGA	2	6	2262471	2262476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_017328	TCC	2	6	2262526	2262531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9049	NC_017328	CAGC	2	8	2262554	2262561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9050	NC_017328	ATCAC	2	10	2262618	2262627	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9051	NC_017328	T	6	6	2262668	2262673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_017328	T	6	6	2263018	2263023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_017328	TGT	2	6	2263032	2263037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_017328	GAC	2	6	2263118	2263123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9055	NC_017328	TCT	2	6	2263160	2263165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9056	NC_017328	ATT	3	9	2263237	2263245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_017328	TGA	2	6	2263309	2263314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_017328	ACAT	2	8	2265775	2265782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9059	NC_017328	CTTT	2	8	2265796	2265803	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9060	NC_017328	AAAAT	2	10	2265860	2265869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_017328	T	7	7	2265960	2265966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_017328	TC	3	6	2266061	2266066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9063	NC_017328	TTGCC	2	10	2266068	2266077	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9064	NC_017328	ATG	2	6	2266123	2266128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_017328	TTG	2	6	2266139	2266144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_017328	CAT	2	6	2266197	2266202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9068	NC_017328	CGA	2	6	2267487	2267492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9070	NC_017328	CGA	2	6	2267549	2267554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9071	NC_017328	CGA	2	6	2267559	2267564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9073	NC_017328	GCA	2	6	2268012	2268017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9074	NC_017328	CGT	2	6	2268029	2268034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9077	NC_017328	T	7	7	2269238	2269244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9078	NC_017328	TTA	2	6	2269315	2269320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9080	NC_017328	GCCC	2	8	2271057	2271064	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9081	NC_017328	TCT	2	6	2271157	2271162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9094	NC_017328	T	7	7	2271740	2271746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_017328	TCAG	2	8	2273150	2273157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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9098	NC_017328	TCCT	2	8	2274231	2274238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9099	NC_017328	GTG	2	6	2274256	2274261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9101	NC_017328	ATGC	2	8	2275086	2275093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9102	NC_017328	CA	3	6	2275145	2275150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9103	NC_017328	ACA	2	6	2275194	2275199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9106	NC_017328	CATG	2	8	2275248	2275255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9107	NC_017328	TAAAA	2	10	2275274	2275283	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_017328	CG	3	6	2275327	2275332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9109	NC_017328	CTG	2	6	2275936	2275941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9122	NC_017328	T	6	6	2287448	2287453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_017328	ATGT	2	8	2287481	2287488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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9128	NC_017328	GCG	2	6	2288574	2288579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9261	NC_017328	CCAG	2	8	2306798	2306805	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9262	NC_017328	CTT	2	6	2306807	2306812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9263	NC_017328	GTA	2	6	2306820	2306825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9264	NC_017328	ACGC	2	8	2307054	2307061	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9265	NC_017328	GTC	2	6	2307064	2307069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9266	NC_017328	CTGG	2	8	2307120	2307127	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9267	NC_017328	GCT	2	6	2307279	2307284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9270	NC_017328	CGCGAT	2	12	2307662	2307673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9271	NC_017328	TGG	2	6	2307683	2307688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9278	NC_017328	TTCG	2	8	2307957	2307964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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9282	NC_017328	TCT	2	6	2308252	2308257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9291	NC_017328	ATTA	2	8	2311072	2311079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9292	NC_017328	AT	3	6	2311083	2311088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9293	NC_017328	ATTTT	2	10	2311094	2311103	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9342	NC_017328	TCAT	2	8	2332778	2332785	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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9379	NC_017328	TGAT	2	8	2351255	2351262	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9380	NC_017328	T	6	6	2351262	2351267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9384	NC_017328	ATG	2	6	2351320	2351325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9386	NC_017328	ACGCT	2	10	2351410	2351419	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9387	NC_017328	TAA	2	6	2351435	2351440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9388	NC_017328	ACT	2	6	2351452	2351457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9390	NC_017328	GATC	2	8	2352191	2352198	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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9392	NC_017328	TCA	2	6	2352276	2352281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9396	NC_017328	ACC	2	6	2356444	2356449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9397	NC_017328	TCA	2	6	2356463	2356468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9483	NC_017328	GCCA	2	8	2383611	2383618	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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