MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017328	TTC	2	6	2037055	2037060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_017328	GCA	2	6	2037186	2037191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_017328	AATACC	2	12	2037253	2037264	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_017328	GAT	2	6	2037265	2037270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017328	GCT	2	6	2037275	2037280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_017328	CGC	2	6	2037309	2037314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8007	NC_017328	CGA	2	6	2037339	2037344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_017328	GGTA	2	8	2037424	2037431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017328	CGG	3	9	2037494	2037502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_017328	CTTT	2	8	2037542	2037549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8011	NC_017328	CGC	2	6	2037616	2037621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8012	NC_017328	CAT	2	6	2037622	2037627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_017328	CGA	2	6	2037720	2037725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_017328	T	6	6	2037810	2037815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017328	CGGCA	2	10	2037823	2037832	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8016	NC_017328	TAA	2	6	2037837	2037842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017328	TC	3	6	2038018	2038023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8018	NC_017328	AATT	2	8	2038144	2038151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017328	TTG	2	6	2038249	2038254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017328	CAG	2	6	2038261	2038266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_017328	TTG	2	6	2038296	2038301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017328	TCT	2	6	2038324	2038329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_017328	TAA	2	6	2038382	2038387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017328	TCAT	2	8	2038417	2038424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8025	NC_017328	ATTA	2	8	2038431	2038438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_017328	ATTA	2	8	2038450	2038457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017328	A	6	6	2038495	2038500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017328	ATC	2	6	2038512	2038517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_017328	TCA	2	6	2038521	2038526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_017328	AATTCA	2	12	2038529	2038540	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8031	NC_017328	CAA	2	6	2038552	2038557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_017328	AT	3	6	2038623	2038628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017328	TGA	2	6	2038634	2038639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_017328	ATC	2	6	2038685	2038690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_017328	ATT	2	6	2038735	2038740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_017328	TAG	2	6	2039679	2039684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_017328	TCA	2	6	2039720	2039725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_017328	A	7	7	2039732	2039738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017328	AATC	2	8	2039917	2039924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8040	NC_017328	A	6	6	2039979	2039984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_017328	C	6	6	2039988	2039993	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8042	NC_017328	CTGG	2	8	2040098	2040105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8043	NC_017328	TAA	2	6	2040507	2040512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017328	ATA	2	6	2040540	2040545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017328	CAA	2	6	2040573	2040578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_017328	CGG	2	6	2041108	2041113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_017328	GCC	2	6	2041123	2041128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8048	NC_017328	TCC	2	6	2041380	2041385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8049	NC_017328	A	7	7	2041388	2041394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017328	TAGCG	2	10	2041398	2041407	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8051	NC_017328	AGC	2	6	2041499	2041504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_017328	AGA	2	6	2041556	2041561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017328	AGG	2	6	2043604	2043609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017328	A	6	6	2043633	2043638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_017328	GGT	2	6	2043648	2043653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017328	TTA	2	6	2043667	2043672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017328	CCA	2	6	2043773	2043778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8058	NC_017328	GAA	2	6	2043790	2043795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017328	TTC	2	6	2043875	2043880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_017328	ACTCGA	2	12	2043942	2043953	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_017328	TCA	2	6	2044004	2044009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_017328	TAT	2	6	2044034	2044039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_017328	GCC	2	6	2044055	2044060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_017328	CAC	2	6	2044113	2044118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8065	NC_017328	TGT	2	6	2044719	2044724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017328	TAGT	2	8	2047279	2047286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_017328	TGG	2	6	2047333	2047338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017328	TC	3	6	2047351	2047356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8069	NC_017328	ATTA	2	8	2047503	2047510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_017328	A	6	6	2047528	2047533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017328	A	6	6	2047602	2047607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_017328	CCG	2	6	2047645	2047650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8073	NC_017328	CAC	2	6	2047664	2047669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8074	NC_017328	GAGT	2	8	2048601	2048608	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_017328	ATAA	2	8	2048639	2048646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_017328	TA	4	8	2048651	2048658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_017328	TAT	2	6	2048664	2048669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_017328	TTA	2	6	2048713	2048718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8084	NC_017328	TAAA	2	8	2051283	2051290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8088	NC_017328	TCTTAT	2	12	2052208	2052219	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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8094	NC_017328	GCTG	2	8	2053110	2053117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8098	NC_017328	A	6	6	2053658	2053663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_017328	CCG	2	6	2053666	2053671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8100	NC_017328	AAC	2	6	2055446	2055451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_017328	T	7	7	2055460	2055466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_017328	T	6	6	2055479	2055484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_017328	CGA	2	6	2055491	2055496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8110	NC_017328	T	6	6	2059829	2059834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_017328	CAT	2	6	2059835	2059840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8113	NC_017328	AG	3	6	2059909	2059914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_017328	TAT	2	6	2059929	2059934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_017328	ATT	2	6	2059943	2059948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_017328	AAAT	2	8	2059956	2059963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_017328	TGG	2	6	2061260	2061265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8122	NC_017328	TG	3	6	2061567	2061572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017328	TTC	2	6	2061696	2061701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8127	NC_017328	A	6	6	2061884	2061889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017328	A	7	7	2061899	2061905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_017328	TATC	2	8	2061915	2061922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8130	NC_017328	GTG	2	6	2061977	2061982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8132	NC_017328	CCG	2	6	2062047	2062052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8133	NC_017328	TGG	2	6	2062104	2062109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8397	NC_017328	TAAC	2	8	2101938	2101945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8398	NC_017328	T	7	7	2102001	2102007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8399	NC_017328	TTA	2	6	2102078	2102083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8400	NC_017328	GACT	2	8	2103798	2103805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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