MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017328	ATCAC	2	10	1729047	1729056	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6502	NC_017328	T	6	6	1729097	1729102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_017328	GAT	2	6	1729540	1729545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_017328	TATTTT	2	12	1729565	1729576	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_017328	GCC	2	6	1729579	1729584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_017328	T	7	7	1729618	1729624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_017328	CAA	2	6	1729637	1729642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_017328	A	6	6	1729657	1729662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_017328	ACC	2	6	1729725	1729730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6510	NC_017328	GTT	2	6	1729740	1729745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_017328	AG	3	6	1729797	1729802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_017328	GTT	2	6	1729853	1729858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_017328	ACA	2	6	1729870	1729875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_017328	ACC	2	6	1729906	1729911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6515	NC_017328	TGA	2	6	1729976	1729981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_017328	CCT	2	6	1730030	1730035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6517	NC_017328	TG	3	6	1730067	1730072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_017328	T	6	6	1730078	1730083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_017328	AG	3	6	1730128	1730133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_017328	TTTA	2	8	1731212	1731219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_017328	TAT	2	6	1731232	1731237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_017328	TCT	2	6	1731287	1731292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_017328	GAG	2	6	1731326	1731331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_017328	A	6	6	1734131	1734136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_017328	ATGG	2	8	1735224	1735231	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_017328	CCAT	2	8	1735243	1735250	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6529	NC_017328	TGT	2	6	1736383	1736388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_017328	A	7	7	1736401	1736407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_017328	TAT	2	6	1736472	1736477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_017328	ATCA	2	8	1736511	1736518	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6533	NC_017328	AG	3	6	1736519	1736524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6535	NC_017328	TAT	2	6	1736737	1736742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_017328	TGT	2	6	1736752	1736757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_017328	TTA	2	6	1736839	1736844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_017328	TAA	2	6	1736848	1736853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_017328	ATC	2	6	1736882	1736887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_017328	TAA	2	6	1736890	1736895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_017328	TACC	2	8	1736896	1736903	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6542	NC_017328	ATTA	2	8	1736912	1736919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_017328	TAA	2	6	1737181	1737186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_017328	TGT	2	6	1737694	1737699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_017328	ATA	2	6	1737720	1737725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_017328	GGC	2	6	1737726	1737731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_017328	T	6	6	1737732	1737737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_017328	TGAT	2	8	1743428	1743435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6551	NC_017328	ATG	2	6	1744219	1744224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_017328	ATC	2	6	1744240	1744245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_017328	T	7	7	1744287	1744293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_017328	ATTC	2	8	1744310	1744317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6555	NC_017328	AC	3	6	1744387	1744392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6556	NC_017328	CAA	2	6	1744394	1744399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6560	NC_017328	T	6	6	1744537	1744542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_017328	ATT	2	6	1744610	1744615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_017328	T	6	6	1744694	1744699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_017328	A	7	7	1744740	1744746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_017328	T	9	9	1746305	1746313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_017328	TA	3	6	1749223	1749228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_017328	GCC	2	6	1750035	1750040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6567	NC_017328	T	6	6	1751229	1751234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6575	NC_017328	GCTG	3	12	1751417	1751428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6579	NC_017328	GA	3	6	1751673	1751678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_017328	T	6	6	1751705	1751710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_017328	CCT	2	6	1751755	1751760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6582	NC_017328	A	6	6	1751794	1751799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6599	NC_017328	GCCA	2	8	1755868	1755875	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6600	NC_017328	GC	3	6	1755895	1755900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6601	NC_017328	GCG	2	6	1755929	1755934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_017328	ATG	4	12	1755937	1755948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_017328	AAAC	2	8	1756046	1756053	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6604	NC_017328	GCA	2	6	1756066	1756071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_017328	TGC	2	6	1756109	1756114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6609	NC_017328	GCC	2	6	1756406	1756411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6610	NC_017328	AGT	2	6	1756423	1756428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6614	NC_017328	TACTC	2	10	1756634	1756643	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6615	NC_017328	GCA	2	6	1756651	1756656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6618	NC_017328	CTT	2	6	1756801	1756806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_017328	TGGCT	2	10	1756949	1756958	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6620	NC_017328	GCC	3	9	1757000	1757008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6621	NC_017328	CG	3	6	1757014	1757019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6622	NC_017328	GCC	2	6	1757048	1757053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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