MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017328	TAA	2	6	1599620	1599625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017328	CAC	2	6	1599662	1599667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_017328	GC	3	6	1601645	1601650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_017328	AGC	2	6	1601712	1601717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_017328	TTA	2	6	1602226	1602231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017328	GCAA	2	8	1602979	1602986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6007	NC_017328	TGC	2	6	1602991	1602996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_017328	CTT	2	6	1603006	1603011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_017328	T	7	7	1603010	1603016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_017328	AGG	2	6	1603035	1603040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_017328	GAGAA	2	10	1603050	1603059	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_017328	T	7	7	1603096	1603102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017328	CAC	2	6	1603288	1603293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_017328	CTAA	2	8	1607009	1607016	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_017328	T	6	6	1607035	1607040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017328	CAG	2	6	1607087	1607092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_017328	ACG	2	6	1609477	1609482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_017328	A	6	6	1609501	1609506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017328	GAT	2	6	1610009	1610014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_017328	AGT	2	6	1610043	1610048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_017328	ATT	2	6	1610077	1610082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_017328	A	7	7	1610104	1610110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_017328	CCT	2	6	1610950	1610955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_017328	TAT	2	6	1612678	1612683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_017328	AGCA	2	8	1612703	1612710	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_017328	ACA	2	6	1612727	1612732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_017328	CCCAT	2	10	1612748	1612757	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6028	NC_017328	TTG	2	6	1613838	1613843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_017328	GT	3	6	1613915	1613920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_017328	GGT	2	6	1613933	1613938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_017328	A	7	7	1613951	1613957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_017328	TTC	2	6	1614816	1614821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_017328	ATTTT	2	10	1614910	1614919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_017328	T	6	6	1614916	1614921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_017328	CATTT	2	10	1614932	1614941	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6036	NC_017328	A	7	7	1615027	1615033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_017328	T	7	7	1615058	1615064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_017328	CGG	2	6	1617532	1617537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_017328	CTG	2	6	1620877	1620882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_017328	TCT	2	6	1621859	1621864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_017328	G	12	12	1622719	1622730	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017328	CAA	2	6	1622756	1622761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_017328	A	8	8	1622768	1622775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_017328	AAT	2	6	1622851	1622856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_017328	AT	3	6	1622918	1622923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017328	TGCT	2	8	1622930	1622937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6047	NC_017328	ATG	2	6	1623467	1623472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_017328	TTCCAT	2	12	1623497	1623508	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_017328	TCCT	2	8	1623515	1623522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_017328	GTG	2	6	1623540	1623545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_017328	CTT	2	6	1624361	1624366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_017328	A	7	7	1624454	1624460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_017328	AAC	2	6	1624526	1624531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_017328	TAA	2	6	1624547	1624552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_017328	ATT	2	6	1624553	1624558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_017328	ATAA	2	8	1624591	1624598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_017328	GATG	2	8	1624633	1624640	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_017328	TTAT	2	8	1624645	1624652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_017328	AATA	2	8	1624656	1624663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_017328	AAC	2	6	1624675	1624680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_017328	GCGT	2	8	1624720	1624727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6062	NC_017328	ACT	2	6	1624733	1624738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_017328	TTTA	2	8	1625795	1625802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_017328	AGA	2	6	1625858	1625863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_017328	TTTAA	2	10	1625939	1625948	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_017328	AAT	2	6	1625969	1625974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_017328	TTC	2	6	1625988	1625993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_017328	CAG	2	6	1626008	1626013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_017328	TG	3	6	1628322	1628327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_017328	ATT	2	6	1628335	1628340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_017328	GAT	2	6	1628356	1628361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_017328	TACA	2	8	1628368	1628375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_017328	AT	3	6	1628397	1628402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_017328	ACT	2	6	1628414	1628419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_017328	CT	3	6	1628418	1628423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_017328	TAT	2	6	1628438	1628443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_017328	CAT	2	6	1628477	1628482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6079	NC_017328	ATA	2	6	1628571	1628576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_017328	AAT	2	6	1628587	1628592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_017328	ACA	2	6	1630229	1630234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_017328	ACA	2	6	1631301	1631306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_017328	A	6	6	1631309	1631314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_017328	CCA	2	6	1631316	1631321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_017328	ACT	2	6	1631326	1631331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6088	NC_017328	ACC	2	6	1631606	1631611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6089	NC_017328	CTG	2	6	1631622	1631627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6093	NC_017328	AAT	2	6	1631791	1631796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_017328	A	6	6	1631825	1631830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6096	NC_017328	ACC	2	6	1631905	1631910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6097	NC_017328	TAAA	2	8	1631918	1631925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_017328	ACA	2	6	1631932	1631937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_017328	AAT	2	6	1631945	1631950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_017328	ACA	2	6	1632583	1632588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_017328	CAA	2	6	1632683	1632688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_017328	CCA	2	6	1632689	1632694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6103	NC_017328	CCA	2	6	1632701	1632706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_017328	GCT	2	6	1632738	1632743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6110	NC_017328	ATGA	2	8	1633105	1633112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_017328	A	6	6	1633129	1633134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_017328	TCAA	2	8	1633158	1633165	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6113	NC_017328	AT	3	6	1633194	1633199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_017328	CAA	2	6	1633208	1633213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6117	NC_017328	GC	3	6	1633278	1633283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_017328	AAC	2	6	1633345	1633350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_017328	C	6	6	1633387	1633392	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6121	NC_017328	GTC	2	6	1633415	1633420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_017328	TGG	2	6	1633454	1633459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_017328	TCGC	2	8	1633499	1633506	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_017328	CAC	2	6	1633510	1633515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_017328	AAT	2	6	1633538	1633543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_017328	TAAT	2	8	1633553	1633560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_017328	A	7	7	1633569	1633575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_017328	GCG	2	6	1633584	1633589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_017328	CAT	2	6	1633628	1633633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6131	NC_017328	T	6	6	1636035	1636040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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