MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 18169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017328	TCA	3	9	1394608	1394616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_017328	TGA	2	6	1394626	1394631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017328	AGC	2	6	1394651	1394656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_017328	TGG	2	6	1394701	1394706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017328	GCT	2	6	1394726	1394731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_017328	ATG	2	6	1394805	1394810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017328	TCC	2	6	1394815	1394820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_017328	TAAA	2	8	1394843	1394850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017328	AAC	2	6	1394854	1394859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_017328	CGG	2	6	1394879	1394884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_017328	T	7	7	1394897	1394903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017328	AT	3	6	1394904	1394909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017328	A	6	6	1394962	1394967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017328	CCAT	2	8	1395010	1395017	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_017328	TGG	2	6	1396988	1396993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017328	TCTG	2	8	1397024	1397031	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_017328	GGC	2	6	1398277	1398282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_017328	CGC	2	6	1398287	1398292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_017328	TTG	2	6	1399117	1399122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017328	TTG	2	6	1399127	1399132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017328	TCG	2	6	1399152	1399157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_017328	TTA	2	6	1399188	1399193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017328	G	7	7	1399253	1399259	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017328	CAA	2	6	1399333	1399338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_017328	CAC	2	6	1399429	1399434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_017328	TCGG	2	8	1399449	1399456	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_017328	AAT	2	6	1399864	1399869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017328	AGG	2	6	1399875	1399880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017328	TGGT	2	8	1405269	1405276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017328	CTATAA	2	12	1405328	1405339	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5031	NC_017328	AAC	2	6	1405347	1405352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_017328	GAG	2	6	1405358	1405363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017328	GCG	2	6	1405429	1405434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_017328	GAT	2	6	1405770	1405775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017328	GGCGC	2	10	1405816	1405825	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5036	NC_017328	CAGG	2	8	1405834	1405841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_017328	CAGT	2	8	1407340	1407347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_017328	AGG	2	6	1407351	1407356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017328	CCTC	2	8	1407370	1407377	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5040	NC_017328	ATC	2	6	1407394	1407399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_017328	CAT	2	6	1407402	1407407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_017328	GCC	2	6	1407451	1407456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_017328	AAC	2	6	1407534	1407539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_017328	A	6	6	1409110	1409115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017328	AT	3	6	1410649	1410654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017328	AAT	2	6	1414764	1414769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017328	TGCGC	2	10	1414776	1414785	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5048	NC_017328	ACG	2	6	1414801	1414806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_017328	TATG	2	8	1414814	1414821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017328	CGC	2	6	1414838	1414843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_017328	TTC	2	6	1415909	1415914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_017328	A	6	6	1415942	1415947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017328	CAG	2	6	1415974	1415979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_017328	ACA	2	6	1416008	1416013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_017328	GGC	2	6	1416694	1416699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_017328	CGC	3	9	1416709	1416717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_017328	GCG	2	6	1417957	1417962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_017328	T	8	8	1417974	1417981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017328	ATT	2	6	1418010	1418015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017328	A	6	6	1418049	1418054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017328	AGT	2	6	1418110	1418115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017328	AAT	2	6	1420042	1420047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017328	AGA	2	6	1420687	1420692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017328	TTC	2	6	1420726	1420731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_017328	ATTG	2	8	1420765	1420772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017328	GAA	2	6	1420823	1420828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017328	TCA	2	6	1420848	1420853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_017328	AGC	2	6	1420926	1420931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_017328	ATCG	2	8	1420934	1420941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_017328	TCA	2	6	1420959	1420964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017328	GGC	2	6	1421063	1421068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_017328	GGA	2	6	1421107	1421112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017328	GCT	2	6	1421131	1421136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_017328	A	6	6	1421171	1421176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017328	GAT	2	6	1421299	1421304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017328	TGC	2	6	1421332	1421337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_017328	CAT	2	6	1421362	1421367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_017328	AAG	2	6	1421445	1421450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017328	GTG	2	6	1421474	1421479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017328	CCG	2	6	1421532	1421537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_017328	AGC	2	6	1421551	1421556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_017328	ACA	2	6	1421589	1421594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_017328	TGA	2	6	1421607	1421612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017328	TGC	2	6	1421623	1421628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_017328	ACG	2	6	1421676	1421681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_017328	TTA	2	6	1421682	1421687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017328	TGGTG	2	10	1421797	1421806	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017328	CAGGA	2	10	1421909	1421918	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5089	NC_017328	A	6	6	1424732	1424737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017328	CA	3	6	1424748	1424753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_017328	GA	3	6	1424785	1424790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017328	CTG	2	6	1424842	1424847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5094	NC_017328	GAA	2	6	1424860	1424865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017328	GCG	2	6	1424872	1424877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_017328	ACC	2	6	1424902	1424907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_017328	GCG	2	6	1424912	1424917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_017328	CGT	2	6	1424953	1424958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_017328	G	7	7	1425009	1425015	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017328	CCG	2	6	1425051	1425056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_017328	CGC	2	6	1425064	1425069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_017328	GTGA	2	8	1425096	1425103	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017328	CGC	2	6	1425128	1425133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_017328	GTG	2	6	1425147	1425152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017328	TCG	2	6	1425209	1425214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_017328	TCG	2	6	1425220	1425225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_017328	GAA	2	6	1425279	1425284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017328	GC	3	6	1425407	1425412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_017328	AGA	2	6	1425458	1425463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017328	ATA	2	6	1425561	1425566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017328	TAC	2	6	1425603	1425608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_017328	TGG	2	6	1425631	1425636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017328	CTGT	2	8	1425637	1425644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_017328	CAGGCG	2	12	1425660	1425671	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_017328	TGC	2	6	1425721	1425726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_017328	ATGTG	2	10	1425814	1425823	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017328	CCGC	2	8	1425831	1425838	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5118	NC_017328	GAC	2	6	1425842	1425847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_017328	CG	3	6	1425875	1425880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_017328	GA	3	6	1425972	1425977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017328	ACC	2	6	1425986	1425991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_017328	GCG	2	6	1426011	1426016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_017328	GTG	2	6	1426056	1426061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017328	CTG	2	6	1426064	1426069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_017328	TGC	2	6	1426096	1426101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_017328	ATGT	2	8	1426103	1426110	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017328	CGG	2	6	1426122	1426127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_017328	CGG	2	6	1426255	1426260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_017328	AAC	2	6	1426379	1426384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_017328	GAC	2	6	1426421	1426426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_017328	GCA	2	6	1426440	1426445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_017328	ATCA	2	8	1426457	1426464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5133	NC_017328	TGA	2	6	1426482	1426487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_017328	CAT	2	6	1426510	1426515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_017328	TGG	2	6	1426524	1426529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_017328	ATA	2	6	1430618	1430623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_017328	A	7	7	1430632	1430638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_017328	TTA	2	6	1430640	1430645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_017328	TG	3	6	1430665	1430670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_017328	ATGG	2	8	1430769	1430776	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_017328	GCC	2	6	1430805	1430810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5142	NC_017328	TAT	2	6	1430838	1430843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_017328	GAT	2	6	1430934	1430939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_017328	CGG	2	6	1430957	1430962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5148	NC_017328	TAT	2	6	1431204	1431209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_017328	GAC	2	6	1431231	1431236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5150	NC_017328	CA	3	6	1431260	1431265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5151	NC_017328	GAT	2	6	1431363	1431368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5152	NC_017328	ACG	2	6	1431475	1431480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5154	NC_017328	GCATC	2	10	1431611	1431620	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5155	NC_017328	TCCG	2	8	1432657	1432664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5159	NC_017328	T	8	8	1432765	1432772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5160	NC_017328	AGC	2	6	1432784	1432789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5162	NC_017328	ATC	2	6	1435364	1435369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5164	NC_017328	TTC	2	6	1439349	1439354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5166	NC_017328	GTT	2	6	1439395	1439400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5171	NC_017328	AGTAC	2	10	1439542	1439551	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5172	NC_017328	TA	3	6	1439561	1439566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_017328	A	6	6	1440248	1440253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5248	NC_017328	AT	3	6	1451937	1451942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_017328	TA	3	6	1451948	1451953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_017328	CAA	2	6	1451956	1451961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5251	NC_017328	A	6	6	1451960	1451965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_017328	AAAT	2	8	1452012	1452019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_017328	A	6	6	1452092	1452097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_017328	TAG	2	6	1452111	1452116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5257	NC_017328	T	7	7	1452221	1452227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_017328	CTG	2	6	1452265	1452270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_017328	TAG	2	6	1452298	1452303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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