MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 3684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017326	CAT	2	6	702704	702709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_017326	GGA	2	6	702716	702721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017326	GCA	2	6	703758	703763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_017326	AGC	2	6	706438	706443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_017326	AC	3	6	706491	706496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_017326	GAA	2	6	708147	708152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017326	TCCG	2	8	708523	708530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_017326	CGC	2	6	708558	708563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_017326	CGC	2	6	709703	709708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_017326	TAA	2	6	709728	709733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017326	TAA	2	6	709750	709755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017326	GGA	2	6	709806	709811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017326	GAG	2	6	709827	709832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017326	TTC	2	6	710827	710832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_017326	CGG	2	6	710839	710844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_017326	TCGG	2	8	710851	710858	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_017326	GGA	2	6	710915	710920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017326	GAG	2	6	714471	714476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017326	CGC	2	6	719353	719358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_017326	AC	3	6	719364	719369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_017326	AGC	2	6	719372	719377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_017326	GC	3	6	719376	719381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_017326	ACG	2	6	719388	719393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017326	GCC	2	6	719401	719406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_017326	TTTC	2	8	719418	719425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_017326	CGG	2	6	719433	719438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_017326	CCA	2	6	720479	720484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_017326	ATG	2	6	720522	720527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017326	GTCC	2	8	720588	720595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_017326	GAA	2	6	720624	720629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017326	CCG	2	6	721750	721755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_017326	A	7	7	721759	721765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017326	GGC	2	6	721784	721789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_017326	CGG	3	9	723100	723108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_017326	CGC	2	6	723109	723114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_017326	CAAA	2	8	723659	723666	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_017326	GGCT	2	8	723670	723677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_017326	GTT	2	6	723750	723755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017326	ATG	2	6	723796	723801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017326	GCA	2	6	723865	723870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_017326	GGT	2	6	724230	724235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017326	TGGGC	2	10	724238	724247	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1543	NC_017326	CGG	3	9	724321	724329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017326	ATCG	3	12	724408	724419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_017326	AGT	2	6	724668	724673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017326	CCT	2	6	724674	724679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_017326	CGG	2	6	724733	724738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_017326	GCCG	2	8	724759	724766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_017326	GACGT	2	10	724770	724779	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1550	NC_017326	GGGCG	2	10	724868	724877	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1551	NC_017326	GT	3	6	725081	725086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017326	GC	3	6	725947	725952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_017326	TCCG	2	8	725958	725965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_017326	GCC	2	6	730446	730451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_017326	CTT	3	9	732979	732987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_017326	CGG	2	6	732993	732998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_017326	AGA	2	6	737186	737191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017326	A	6	6	737194	737199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017326	CAA	2	6	737269	737274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_017326	GATC	2	8	738596	738603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_017326	CG	3	6	738617	738622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_017326	CT	3	6	739293	739298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_017326	CAA	2	6	739420	739425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_017326	AGA	2	6	739484	739489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017326	TCT	2	6	742705	742710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_017326	CGT	2	6	742711	742716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_017326	TTTTA	2	10	742846	742855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017326	ATT	2	6	742877	742882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017326	GCAT	2	8	742928	742935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_017326	GGC	2	6	743654	743659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_017326	TCA	2	6	743663	743668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_017326	GCCCT	2	10	743693	743702	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1573	NC_017326	GCT	2	6	752387	752392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_017326	TTC	2	6	753415	753420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_017326	GCC	2	6	753421	753426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_017326	AGC	2	6	755120	755125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_017326	CGG	2	6	755126	755131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_017326	AC	3	6	755154	755159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_017326	GGC	2	6	755909	755914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_017326	CA	3	6	755997	756002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_017326	GTC	2	6	756010	756015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_017326	CTT	2	6	756865	756870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_017326	CCG	2	6	757332	757337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_017326	GCT	2	6	759151	759156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_017326	TGCA	2	8	759178	759185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_017326	GCG	2	6	759190	759195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_017326	AGAGC	2	10	759290	759299	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1588	NC_017326	TG	3	6	761432	761437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017326	TCCG	2	8	761444	761451	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_017326	GC	3	6	761472	761477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_017326	TCGA	2	8	761486	761493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_017326	TCT	2	6	767294	767299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_017326	AAG	2	6	767345	767350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017326	ACA	2	6	767582	767587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_017326	TCTA	2	8	768254	768261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_017326	AAG	2	6	768262	768267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017326	TCCT	2	8	768273	768280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_017326	GGA	3	9	768289	768297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017326	GC	3	6	768298	768303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_017326	CT	3	6	769305	769310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_017326	CAGG	2	8	769397	769404	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_017326	CTGC	2	8	769411	769418	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_017326	CGG	2	6	769458	769463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_017326	GAG	3	9	769501	769509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017326	TCGG	2	8	772683	772690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_017326	CGG	2	6	772789	772794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_017326	TGCC	2	8	772880	772887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_017326	CG	3	6	776564	776569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_017326	CG	3	6	776576	776581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_017326	TCT	2	6	778197	778202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_017326	GA	3	6	778235	778240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017326	AAC	2	6	778306	778311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_017326	CGA	2	6	778341	778346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_017326	TCC	2	6	778350	778355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_017326	GC	3	6	778388	778393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_017326	GAA	2	6	778447	778452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017326	A	6	6	778515	778520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017326	CACC	2	8	778557	778564	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1619	NC_017326	CGG	2	6	778605	778610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_017326	ACC	2	6	778658	778663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_017326	CCG	2	6	778751	778756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_017326	GCC	2	6	779912	779917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_017326	GCCTCC	2	12	779956	779967	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_017326	CGG	2	6	779991	779996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_017326	CGC	2	6	779997	780002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_017326	TTC	2	6	785229	785234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_017326	CAG	2	6	785298	785303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_017326	TCA	2	6	785368	785373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_017326	GT	3	6	785405	785410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017326	GC	3	6	785414	785419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_017326	AGC	2	6	785463	785468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_017326	TAT	2	6	785509	785514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017326	GTT	2	6	785533	785538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017326	GGC	2	6	786419	786424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1636	NC_017326	AAG	2	6	786453	786458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1910	NC_017326	ACG	2	6	956245	956250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1912	NC_017326	TCA	2	6	956461	956466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1913	NC_017326	CGA	2	6	956512	956517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1914	NC_017326	ACG	2	6	956532	956537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1927	NC_017326	TCA	2	6	967172	967177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1948	NC_017326	GCG	2	6	983752	983757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1949	NC_017326	GACC	2	8	985424	985431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1952	NC_017326	GC	3	6	988878	988883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1953	NC_017326	CGCA	2	8	990387	990394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1954	NC_017326	ACA	2	6	990397	990402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1955	NC_017326	CGC	2	6	990417	990422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1956	NC_017326	AAGA	2	8	990461	990468	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1957	NC_017326	GGC	2	6	990502	990507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1958	NC_017326	ACGC	2	8	990583	990590	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1959	NC_017326	TCGA	2	8	990593	990600	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1970	NC_017326	GCG	3	9	993505	993513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1971	NC_017326	TCCT	2	8	993539	993546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1972	NC_017326	GCC	2	6	997167	997172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2000	NC_017326	GAG	2	6	999182	999187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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