MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 9936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017325	GAC	2	6	424321	424326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017325	GCC	2	6	424346	424351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_017325	GTC	2	6	424355	424360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017325	GAG	2	6	424380	424385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017325	TTC	2	6	424478	424483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017325	GCG	2	6	424887	424892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017325	TCT	2	6	425082	425087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017325	GGA	2	6	425136	425141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017325	CCCT	2	8	426373	426380	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1010	NC_017325	GC	3	6	426389	426394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_017325	CTT	2	6	427857	427862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017325	TG	3	6	427875	427880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017325	TCA	2	6	427885	427890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017325	TCC	2	6	427998	428003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_017325	CG	4	8	428134	428141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_017325	ACCG	2	8	428184	428191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_017325	GCC	2	6	428192	428197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_017325	TCG	2	6	428525	428530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017325	GGCA	2	8	428603	428610	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_017325	ACG	2	6	428611	428616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017325	TGC	2	6	428618	428623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017325	GAG	2	6	428624	428629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017325	CCG	2	6	428655	428660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_017325	GCG	2	6	428668	428673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_017325	CAAT	2	8	429194	429201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_017325	C	6	6	429209	429214	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1027	NC_017325	AAC	2	6	429253	429258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017325	GGA	2	6	429291	429296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017325	GCG	2	6	429319	429324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017325	TCG	2	6	429389	429394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017325	CGA	2	6	429444	429449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_017325	ATGC	2	8	429470	429477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_017325	CCG	2	6	429599	429604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_017325	A	7	7	429660	429666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017325	CTTCTG	2	12	429684	429695	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017325	CCGCT	2	10	429755	429764	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1037	NC_017325	A	7	7	429773	429779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017325	GCG	2	6	429795	429800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017325	GA	3	6	429828	429833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017325	CG	3	6	429858	429863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_017325	GCTT	2	8	432643	432650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_017325	C	6	6	432671	432676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1043	NC_017325	TGC	2	6	432683	432688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_017325	ATC	2	6	434197	434202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_017325	GC	3	6	434212	434217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_017325	CCT	2	6	434290	434295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_017325	ACT	2	6	434314	434319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_017325	GC	3	6	434338	434343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_017325	AGG	2	6	434361	434366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017325	TTG	2	6	435365	435370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017325	ACA	2	6	435378	435383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017325	CGG	2	6	435387	435392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_017325	ATC	2	6	437050	437055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017325	CGC	2	6	437555	437560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_017325	CTG	2	6	437585	437590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017325	TCG	2	6	439517	439522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017325	TGGGA	2	10	439523	439532	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017325	AGG	2	6	439633	439638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017325	GGA	2	6	441192	441197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017325	TGA	2	6	442188	442193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017325	TTC	2	6	442344	442349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017325	CGC	2	6	442688	442693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_017325	CG	3	6	442737	442742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_017325	CTG	2	6	442814	442819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017325	T	7	7	442853	442859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017325	CGC	2	6	442889	442894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_017325	TAT	2	6	442908	442913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017325	AAC	2	6	443666	443671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_017325	TTCC	2	8	444540	444547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_017325	TCCG	2	8	444649	444656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_017325	GCG	2	6	446119	446124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_017325	TTTC	2	8	446133	446140	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_017325	A	7	7	446152	446158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017325	G	6	6	448510	448515	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017325	GCG	2	6	448562	448567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_017325	CTC	2	6	449141	449146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_017325	CGC	2	6	449222	449227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_017325	AT	3	6	449264	449269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017325	CGG	2	6	449343	449348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_017325	CG	4	8	449393	449400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_017325	ATTG	2	8	450292	450299	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017325	AAG	2	6	450371	450376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017325	TGA	3	9	450378	450386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017325	GAA	2	6	450399	450404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017325	GTCC	2	8	452631	452638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_017325	TTGT	2	8	452677	452684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017325	A	6	6	452743	452748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017325	GC	3	6	456934	456939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_017325	CCT	2	6	456944	456949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_017325	CCCT	2	8	457081	457088	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1091	NC_017325	GCAA	2	8	457818	457825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_017325	GCG	2	6	457873	457878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017325	AG	3	6	457943	457948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017325	GAA	2	6	457957	457962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017325	CGGA	2	8	458724	458731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_017325	GGA	2	6	458756	458761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017325	TTCAA	2	10	458794	458803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_017325	GGC	2	6	458906	458911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_017325	GA	3	6	458997	459002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017325	GCC	2	6	461248	461253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_017325	TCT	2	6	461323	461328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017325	CCG	2	6	461773	461778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_017325	G	6	6	461784	461789	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017325	GAT	2	6	461802	461807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017325	CTG	2	6	462281	462286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017325	CCGG	2	8	466682	466689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_017325	GCCG	2	8	466703	466710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_017325	GGA	2	6	466711	466716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017325	GCC	2	6	467978	467983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_017325	GAAGCG	2	12	468097	468108	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1111	NC_017325	CGC	2	6	468115	468120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_017325	GTT	2	6	468170	468175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017325	TTG	2	6	468176	468181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017325	GAC	2	6	469321	469326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017325	AGCC	2	8	469390	469397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_017325	GGC	2	6	469538	469543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017325	CGG	2	6	469567	469572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017325	GGC	2	6	469587	469592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017325	GCC	2	6	469599	469604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_017325	GGAT	2	8	469615	469622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017325	T	6	6	471791	471796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017325	TGA	2	6	471836	471841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017325	CGT	2	6	471913	471918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017325	CGCC	2	8	472774	472781	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1125	NC_017325	CGC	2	6	472786	472791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_017325	GC	3	6	472909	472914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_017325	ACCG	2	8	472922	472929	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_017325	CGC	2	6	472941	472946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_017325	CCTT	2	8	473016	473023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_017325	GCG	2	6	474909	474914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017325	CGGC	2	8	474960	474967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_017325	ATC	2	6	475032	475037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017325	ATT	2	6	475047	475052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017325	CG	3	6	475065	475070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_017325	CG	3	6	475164	475169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_017325	GC	3	6	478871	478876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_017325	GTTC	2	8	479891	479898	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1138	NC_017325	AGGC	2	8	479949	479956	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1139	NC_017325	CGT	2	6	482307	482312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1141	NC_017325	CGT	3	9	483327	483335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_017325	ATC	2	6	483336	483341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1144	NC_017325	CGG	2	6	483408	483413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1145	NC_017325	GCA	2	6	484171	484176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1146	NC_017325	GTG	2	6	484191	484196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_017325	TGC	2	6	486132	486137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1150	NC_017325	GCG	2	6	487569	487574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1151	NC_017325	ACT	2	6	487581	487586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1152	NC_017325	GCA	2	6	487629	487634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1153	NC_017325	ACC	2	6	488512	488517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1154	NC_017325	CGTCGG	2	12	488790	488801	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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1156	NC_017325	CGG	3	9	490949	490957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1158	NC_017325	TCT	2	6	492440	492445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1161	NC_017325	CTG	2	6	494449	494454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1164	NC_017325	CT	3	6	498776	498781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1253	NC_017325	CGG	2	6	530469	530474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_017325	GTAT	2	8	531775	531782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_017325	TTCGTC	2	12	532258	532269	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1257	NC_017325	GGCC	2	8	532733	532740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1258	NC_017325	GTT	2	6	532834	532839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1264	NC_017325	CGG	2	6	533682	533687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1265	NC_017325	GCCG	2	8	535658	535665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1266	NC_017325	TGA	2	6	535666	535671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_017325	CCG	2	6	535696	535701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1268	NC_017325	CTGCA	2	10	537912	537921	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1269	NC_017325	CGGC	2	8	537938	537945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1270	NC_017325	TC	3	6	538514	538519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1271	NC_017325	GACT	2	8	538573	538580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1411	NC_017325	CG	3	6	611025	611030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1412	NC_017325	G	6	6	611081	611086	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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