MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB01

Total Repeats: 7129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017324	CGC	3	9	1591133	1591141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7002	NC_017324	CATC	2	8	1591143	1591150	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7003	NC_017324	AGG	2	6	1591223	1591228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_017324	TTG	2	6	1591288	1591293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_017324	GCG	2	6	1591378	1591383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_017324	TCG	2	6	1591389	1591394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_017324	CTG	2	6	1591564	1591569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_017324	TTCA	2	8	1591598	1591605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7009	NC_017324	CGT	2	6	1591624	1591629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_017324	GGA	2	6	1591659	1591664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_017324	CCA	2	6	1595112	1595117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7012	NC_017324	TCA	2	6	1595386	1595391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_017324	CGT	2	6	1595400	1595405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_017324	GCA	2	6	1595439	1595444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_017324	GCC	2	6	1595452	1595457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7016	NC_017324	TCG	2	6	1595472	1595477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_017324	GCC	2	6	1595500	1595505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7018	NC_017324	CATC	2	8	1595555	1595562	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7019	NC_017324	CG	3	6	1595586	1595591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7020	NC_017324	CGG	2	6	1595596	1595601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_017324	TTG	2	6	1595613	1595618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_017324	CG	3	6	1595636	1595641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7023	NC_017324	TTC	2	6	1595681	1595686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_017324	CGG	2	6	1595693	1595698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_017324	TCGG	2	8	1595789	1595796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7026	NC_017324	GGAC	2	8	1595867	1595874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7027	NC_017324	GGA	2	6	1595944	1595949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_017324	GATGC	2	10	1596378	1596387	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7029	NC_017324	CTC	2	6	1596419	1596424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7030	NC_017324	ACG	2	6	1596457	1596462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_017324	AAAT	2	8	1596503	1596510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_017324	CACT	2	8	1596624	1596631	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7033	NC_017324	CGC	2	6	1596672	1596677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7034	NC_017324	CAG	2	6	1596712	1596717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_017324	AAT	2	6	1596750	1596755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_017324	ATCA	2	8	1596808	1596815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7037	NC_017324	GTC	2	6	1596835	1596840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_017324	CCT	2	6	1596880	1596885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7039	NC_017324	ACG	2	6	1596935	1596940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_017324	AAT	2	6	1596946	1596951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_017324	GAAC	2	8	1597008	1597015	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7042	NC_017324	TTA	2	6	1597016	1597021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_017324	ATT	2	6	1597042	1597047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_017324	CCCGC	2	10	1597085	1597094	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7045	NC_017324	TTG	2	6	1597112	1597117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_017324	GAC	2	6	1597156	1597161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_017324	AGG	2	6	1597651	1597656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_017324	AGC	2	6	1597992	1597997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_017324	GGC	2	6	1598020	1598025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_017324	TGAG	2	8	1598051	1598058	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_017324	TCA	2	6	1598109	1598114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_017324	AAGG	2	8	1598148	1598155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_017324	GACC	2	8	1598175	1598182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7054	NC_017324	CCG	2	6	1598309	1598314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7055	NC_017324	GCA	2	6	1598355	1598360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_017324	TCG	2	6	1598368	1598373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_017324	GGT	2	6	1598413	1598418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_017324	AGC	2	6	1600464	1600469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_017324	CG	3	6	1600489	1600494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7060	NC_017324	CAA	2	6	1600528	1600533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_017324	AG	3	6	1600547	1600552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_017324	CTT	2	6	1600653	1600658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_017324	GGA	2	6	1600727	1600732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_017324	CAT	2	6	1600763	1600768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_017324	C	6	6	1600922	1600927	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7066	NC_017324	GAT	2	6	1600960	1600965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_017324	GCC	2	6	1600966	1600971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7068	NC_017324	CTG	2	6	1601001	1601006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_017324	CTTC	2	8	1601018	1601025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7070	NC_017324	AGGA	2	8	1601035	1601042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_017324	TGAA	2	8	1603358	1603365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_017324	ACA	2	6	1603369	1603374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_017324	ATC	2	6	1603375	1603380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_017324	ATC	2	6	1603411	1603416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_017324	ATC	2	6	1603435	1603440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_017324	GGC	2	6	1603453	1603458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7077	NC_017324	GC	3	6	1603585	1603590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7078	NC_017324	GTT	2	6	1603642	1603647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_017324	AG	3	6	1603678	1603683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_017324	CGA	2	6	1603770	1603775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_017324	GCA	2	6	1603783	1603788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7082	NC_017324	C	6	6	1603823	1603828	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7083	NC_017324	CG	3	6	1603856	1603861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7084	NC_017324	CGA	2	6	1603869	1603874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_017324	CGGTG	2	10	1603877	1603886	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7086	NC_017324	GAA	2	6	1603950	1603955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_017324	CGCC	2	8	1603966	1603973	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7088	NC_017324	GCA	2	6	1604003	1604008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_017324	TG	4	8	1604295	1604302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_017324	CTTC	2	8	1604370	1604377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7091	NC_017324	ACA	2	6	1604392	1604397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_017324	GCG	2	6	1604450	1604455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_017324	CCT	2	6	1604458	1604463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7094	NC_017324	CGA	2	6	1604500	1604505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_017324	GTCCG	2	10	1604512	1604521	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7096	NC_017324	CGA	2	6	1604580	1604585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7097	NC_017324	GCCC	2	8	1604595	1604602	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7098	NC_017324	CGC	2	6	1604675	1604680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7099	NC_017324	TC	5	10	1606645	1606654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7100	NC_017324	GCAC	2	8	1608257	1608264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7101	NC_017324	CGA	2	6	1608303	1608308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_017324	CCG	2	6	1608317	1608322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7103	NC_017324	GAA	2	6	1608340	1608345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_017324	CAT	2	6	1608358	1608363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_017324	AT	3	6	1608576	1608581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_017324	TCA	2	6	1608584	1608589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_017324	CAG	2	6	1608621	1608626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_017324	CGG	2	6	1608642	1608647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_017324	GTC	2	6	1608700	1608705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_017324	GTC	2	6	1611017	1611022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_017324	CCGC	2	8	1611029	1611036	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7112	NC_017324	GGC	2	6	1611041	1611046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_017324	GGTT	2	8	1611748	1611755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_017324	GAC	2	6	1611780	1611785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_017324	CCA	2	6	1611832	1611837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7116	NC_017324	GC	3	6	1611839	1611844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7117	NC_017324	TGA	2	6	1611856	1611861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_017324	GA	3	6	1611860	1611865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_017324	TGC	2	6	1611871	1611876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_017324	AG	3	6	1611890	1611895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_017324	ACCGT	2	10	1611902	1611911	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7122	NC_017324	CTTT	2	8	1611949	1611956	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7123	NC_017324	CGC	2	6	1613005	1613010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7124	NC_017324	ATC	2	6	1613011	1613016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_017324	GTT	2	6	1614033	1614038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_017324	CGAAAC	2	12	1614121	1614132	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_017324	CAAA	2	8	1615056	1615063	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7128	NC_017324	ACA	2	6	1615144	1615149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_017324	CGT	2	6	1615204	1615209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.