MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB02

Total Repeats: 4069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017323	GTTC	2	8	1677858	1677865	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_017323	TCA	2	6	1677998	1678003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_017323	TCA	2	6	1678033	1678038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_017323	ATT	2	6	1678158	1678163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017323	AAG	2	6	1678186	1678191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017323	CGG	2	6	1678251	1678256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_017323	ATT	2	6	1678283	1678288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017323	CAA	2	6	1678308	1678313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_017323	AAG	2	6	1678335	1678340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017323	TTC	2	6	1678428	1678433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017323	CG	3	6	1678531	1678536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_017323	TAAA	2	8	1678558	1678565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017323	AGA	2	6	1678656	1678661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017323	TC	3	6	1678677	1678682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_017323	GA	3	6	1678703	1678708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017323	CTTTT	2	10	1678711	1678720	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4017	NC_017323	CTATT	2	10	1678724	1678733	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4018	NC_017323	AAG	2	6	1680207	1680212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017323	CCGC	2	8	1680544	1680551	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4020	NC_017323	CCG	2	6	1680559	1680564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_017323	CGG	2	6	1680586	1680591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_017323	GCC	2	6	1680604	1680609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_017323	TAAA	2	8	1680628	1680635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017323	CCG	2	6	1681986	1681991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_017323	CTGG	2	8	1682013	1682020	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4026	NC_017323	GA	3	6	1682039	1682044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017323	CCG	2	6	1682045	1682050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_017323	GTTT	2	8	1682892	1682899	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017323	TGGA	2	8	1682907	1682914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017323	A	7	7	1682950	1682956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017323	GTTTC	2	10	1682976	1682985	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4032	NC_017323	TTTGA	2	10	1682997	1683006	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017323	CAA	2	6	1683021	1683026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_017323	A	6	6	1683025	1683030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017323	ATC	2	6	1684736	1684741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_017323	CCG	2	6	1684760	1684765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_017323	ATC	2	6	1685022	1685027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_017323	TTC	2	6	1685043	1685048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_017323	CAG	2	6	1685109	1685114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017323	A	6	6	1685140	1685145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017323	TTCG	2	8	1685146	1685153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_017323	CTT	2	6	1685157	1685162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_017323	GTAA	2	8	1685167	1685174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017323	GTAGTC	2	12	1685181	1685192	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4045	NC_017323	CGT	2	6	1685227	1685232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017323	TAGG	2	8	1685241	1685248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017323	GTT	2	6	1685285	1685290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017323	GTG	2	6	1686664	1686669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017323	GCA	2	6	1686688	1686693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017323	CAA	2	6	1686710	1686715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_017323	ATTTG	2	10	1686745	1686754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017323	AAT	2	6	1686793	1686798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017323	CGC	2	6	1686819	1686824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_017323	TTA	2	6	1686904	1686909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017323	GGAATC	2	12	1686952	1686963	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4056	NC_017323	GGC	2	6	1687002	1687007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_017323	GCC	2	6	1687011	1687016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_017323	GC	3	6	1687050	1687055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_017323	CG	3	6	1687107	1687112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_017323	GAA	2	6	1687126	1687131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017323	CGTC	2	8	1687139	1687146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_017323	CGC	2	6	1689393	1689398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_017323	GCG	2	6	1689412	1689417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_017323	CG	3	6	1690514	1690519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_017323	CGCA	2	8	1690531	1690538	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_017323	CGA	2	6	1690543	1690548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_017323	TGC	2	6	1690558	1690563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_017323	CGC	2	6	1690575	1690580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4069	NC_017323	T	6	6	1690582	1690587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.