MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus REY15A chromosome

Total Repeats: 8467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017276	GAA	2	6	1244906	1244911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017276	ATTAG	2	10	1244913	1244922	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017276	GAA	2	6	1244944	1244949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017276	AAT	2	6	1244955	1244960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017276	A	6	6	1245003	1245008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017276	A	6	6	1245034	1245039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017276	ATA	2	6	1245442	1245447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017276	TAA	2	6	1245453	1245458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017276	CT	3	6	1245462	1245467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_017276	TTG	2	6	1245489	1245494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017276	TA	3	6	1245530	1245535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017276	AAT	2	6	1245584	1245589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017276	ATT	2	6	1245623	1245628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017276	AGG	2	6	1245633	1245638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017276	AT	3	6	1245645	1245650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017276	TGAG	2	8	1245652	1245659	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017276	CTT	2	6	1245680	1245685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_017276	CTA	2	6	1246345	1246350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017276	TAC	2	6	1246351	1246356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_017276	TAT	2	6	1246361	1246366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017276	AAAAG	2	10	1246440	1246449	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017276	CTT	2	6	1246505	1246510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_017276	TAG	2	6	1246534	1246539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017276	TAA	3	9	1246559	1246567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017276	CTA	2	6	1246568	1246573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_017276	GGTT	2	8	1246868	1246875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017276	GAA	2	6	1246903	1246908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017276	GAA	2	6	1246912	1246917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017276	TCT	2	6	1246984	1246989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_017276	AG	3	6	1247315	1247320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017276	TAGA	2	8	1247331	1247338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017276	TAA	2	6	1247386	1247391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017276	AAAC	2	8	1247423	1247430	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_017276	A	6	6	1247443	1247448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017276	A	6	6	1247460	1247465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017276	GCA	2	6	1247466	1247471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017276	T	6	6	1247522	1247527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017276	A	6	6	1247539	1247544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017276	TA	3	6	1247575	1247580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017276	ATA	3	9	1247583	1247591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017276	AAT	2	6	1247608	1247613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017276	GAGG	2	8	1247671	1247678	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017276	AAT	2	6	1247703	1247708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017276	TCC	2	6	1248955	1248960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_017276	GTG	2	6	1248977	1248982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017276	TGA	2	6	1249001	1249006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017276	TTAG	2	8	1249030	1249037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017276	AT	3	6	1249044	1249049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017276	TCTT	2	8	1249167	1249174	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_017276	CAAA	2	8	1249203	1249210	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_017276	TTAA	2	8	1249214	1249221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017276	CA	3	6	1249270	1249275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_017276	TCT	2	6	1249308	1249313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_017276	TCT	2	6	1250064	1250069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_017276	ATA	2	6	1250092	1250097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017276	CT	3	6	1250169	1250174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_017276	T	6	6	1250184	1250189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017276	TA	3	6	1252845	1252850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017276	T	6	6	1252866	1252871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017276	TGA	3	9	1252891	1252899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017276	TGA	2	6	1252915	1252920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017276	T	6	6	1252976	1252981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017276	CGG	2	6	1253056	1253061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_017276	T	6	6	1253073	1253078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017276	ACT	2	6	1253087	1253092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_017276	TAT	2	6	1253139	1253144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017276	AAC	2	6	1253150	1253155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_017276	T	7	7	1253168	1253174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017276	TA	3	6	1253191	1253196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017276	TGA	2	6	1253198	1253203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017276	TTCT	2	8	1253216	1253223	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_017276	ATT	2	6	1253224	1253229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017276	TTG	2	6	1253289	1253294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017276	ATA	2	6	1253338	1253343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017276	TAA	2	6	1253349	1253354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017276	TA	3	6	1253395	1253400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017276	AT	3	6	1253401	1253406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017276	ATT	2	6	1258616	1258621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017276	A	6	6	1261370	1261375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017276	TACTT	2	10	1261390	1261399	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5081	NC_017276	ACT	2	6	1261411	1261416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_017276	TGT	2	6	1261453	1261458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017276	TCT	3	9	1261472	1261480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_017276	TAA	2	6	1261521	1261526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017276	A	9	9	1261561	1261569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017276	TCATAA	2	12	1261592	1261603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5087	NC_017276	TTC	2	6	1261659	1261664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_017276	T	6	6	1261696	1261701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017276	AT	3	6	1263499	1263504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017276	ATT	2	6	1266219	1266224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017276	ATC	2	6	1269274	1269279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_017276	TCA	2	6	1269298	1269303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017276	AG	3	6	1271094	1271099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017276	GTC	2	6	1271112	1271117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_017276	TCA	2	6	1271207	1271212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_017276	TGT	2	6	1271213	1271218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017276	GGGGAT	2	12	1271649	1271660	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017276	TGA	2	6	1271696	1271701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017276	GAT	2	6	1271718	1271723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017276	ATG	2	6	1271862	1271867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017276	GA	3	6	1271892	1271897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017276	GAC	2	6	1271926	1271931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_017276	TTTA	2	8	1274525	1274532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017276	AT	3	6	1274534	1274539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017276	T	7	7	1276554	1276560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017276	TAC	2	6	1277996	1278001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_017276	CAT	2	6	1278032	1278037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_017276	A	6	6	1279892	1279897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017276	TAGA	2	8	1279908	1279915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017276	ATG	2	6	1279927	1279932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017276	TAA	2	6	1279998	1280003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017276	AT	3	6	1280034	1280039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017276	ATA	2	6	1280050	1280055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017276	GAT	2	6	1280056	1280061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017276	A	6	6	1280065	1280070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017276	ATT	2	6	1280094	1280099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017276	AAAT	2	8	1280199	1280206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017276	T	6	6	1280217	1280222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017276	CAAT	2	8	1280224	1280231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5120	NC_017276	CCT	2	6	1280246	1280251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_017276	ATA	2	6	1280799	1280804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017276	AAG	2	6	1280808	1280813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017276	T	6	6	1280828	1280833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017276	CAT	2	6	1280852	1280857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_017276	TCT	2	6	1280858	1280863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_017276	TCTA	2	8	1281896	1281903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5127	NC_017276	ATT	2	6	1281926	1281931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017276	ATC	2	6	1281981	1281986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_017276	GTC	2	6	1282545	1282550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_017276	CAT	2	6	1282608	1282613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_017276	ATC	2	6	1282752	1282757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5133	NC_017276	AAGT	2	8	1282912	1282919	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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