MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus HVE10/4 chromosome

Total Repeats: 9051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017275	GT	3	6	24	29	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017275	ATT	2	6	135	140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017275	GTCAC	2	10	202	211	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017275	ATT	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017275	TAA	2	6	279	284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017275	T	8	8	290	297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017275	TAAA	2	8	2213	2220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017275	TA	5	10	2229	2238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017275	T	6	6	3095	3100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017275	T	6	6	3119	3124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017275	TAT	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017275	TACAAA	2	12	5587	5598	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017275	TAT	2	6	5684	5689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017275	AAG	2	6	5722	5727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017275	TTAAA	2	10	5728	5737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017275	ACA	2	6	5741	5746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017275	GAA	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017275	T	6	6	5950	5955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017275	ATGTT	2	10	5959	5968	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017275	TGTGA	2	10	5993	6002	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017275	GA	3	6	6011	6016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017275	ATC	2	6	6035	6040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017275	GTTC	2	8	6049	6056	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017275	TCA	2	6	6058	6063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017275	T	6	6	7541	7546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017275	TA	3	6	7561	7566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017275	TA	3	6	8903	8908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017275	GTA	2	6	8916	8921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017275	CATC	2	8	9750	9757	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017275	ATT	2	6	16186	16191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017275	TGGTAT	2	12	17654	17665	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017275	TAA	2	6	17691	17696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017275	TTA	2	6	17701	17706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017275	TAT	2	6	17753	17758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017275	CAT	2	6	17779	17784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017275	GGTT	2	8	17799	17806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017275	ATT	2	6	17825	17830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017275	TAT	2	6	17840	17845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017275	ACTG	2	8	17858	17865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017275	AAC	2	6	18572	18577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017275	T	6	6	20546	20551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017275	ATC	2	6	23300	23305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017275	GAT	2	6	24410	24415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017275	TGA	2	6	24439	24444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017275	GAT	2	6	24463	24468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017275	TAGA	2	8	24483	24490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017275	ATA	2	6	24511	24516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017275	CA	3	6	26174	26179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017275	AT	3	6	26180	26185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017275	TAA	2	6	26917	26922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017275	AAAAT	2	10	26999	27008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017275	ATAA	2	8	28069	28076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017275	TA	3	6	28084	28089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017275	TAT	2	6	28112	28117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017275	TTA	2	6	31280	31285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017275	AGA	2	6	31312	31317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017275	AT	3	6	32547	32552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017275	CTTTTC	2	12	32572	32583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017275	ATC	2	6	32626	32631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017275	ACA	2	6	32636	32641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017275	TAA	2	6	34062	34067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017275	TAC	2	6	34098	34103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017275	GGT	2	6	34113	34118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017275	T	6	6	35130	35135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017275	ACT	2	6	36825	36830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017275	TATTTA	2	12	38100	38111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017275	A	6	6	38138	38143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017275	AT	4	8	38341	38348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017275	ATTT	2	8	38355	38362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017275	AAAT	2	8	38366	38373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017275	AT	3	6	38375	38380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017275	AAAT	2	8	38431	38438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017275	AT	3	6	38437	38442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017275	GAT	2	6	38463	38468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017275	CTG	2	6	38504	38509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017275	ATT	2	6	38535	38540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017275	TTC	2	6	38561	38566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017275	TAA	2	6	38627	38632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017275	TAA	2	6	38721	38726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017275	ATT	2	6	38834	38839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017275	AATA	2	8	38841	38848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017275	TGGTG	2	10	38881	38890	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017275	AT	3	6	40638	40643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017275	TA	4	8	42312	42319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017275	GTT	2	6	44582	44587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017275	TTA	2	6	44601	44606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017275	ATC	2	6	44621	44626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017275	TAGC	2	8	45623	45630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017275	TAA	2	6	45720	45725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017275	GTT	2	6	45733	45738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017275	TGA	2	6	45790	45795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017275	T	7	7	45803	45809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017275	TCT	2	6	45823	45828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017275	TC	3	6	47958	47963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017275	TCTAGT	2	12	47970	47981	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017275	TCAA	2	8	48042	48049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017275	TTA	2	6	48067	48072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017275	AGA	2	6	48079	48084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017275	TAT	2	6	48103	48108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017275	TAT	2	6	49531	49536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017275	ATA	2	6	49537	49542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017275	T	6	6	50744	50749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017275	TTG	2	6	50761	50766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017275	AAGT	2	8	50836	50843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017275	CAA	2	6	50876	50881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017275	TTAT	2	8	50912	50919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017275	ATCT	2	8	50927	50934	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017275	AGA	2	6	58061	58066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017275	AACA	2	8	58659	58666	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017275	CA	3	6	58739	58744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017275	TAA	2	6	58745	58750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017275	GAA	2	6	58781	58786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017275	TCC	2	6	58812	58817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017275	TGA	2	6	58833	58838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017275	ATG	2	6	58858	58863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017275	T	8	8	58897	58904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017275	TAATT	2	10	60866	60875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017275	CTT	2	6	60918	60923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017275	GTTT	2	8	65219	65226	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017275	TAT	2	6	65237	65242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017275	A	6	6	65292	65297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017275	ATT	2	6	65321	65326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017275	TTG	2	6	67945	67950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017275	TAA	2	6	67991	67996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017275	TTA	2	6	68004	68009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017275	TCAT	2	8	68011	68018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017275	ACT	2	6	68706	68711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017275	TCTA	2	8	68739	68746	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017275	A	6	6	68746	68751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017275	TAA	2	6	68870	68875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017275	TAT	2	6	68876	68881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017275	AT	4	8	68897	68904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017275	TTC	2	6	69466	69471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017275	CAT	3	9	69492	69500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017275	TA	3	6	70023	70028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017275	TA	3	6	70066	70071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017275	CT	3	6	71385	71390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017275	TAT	2	6	71441	71446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017275	AAC	2	6	71877	71882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017275	AATAAA	2	12	71887	71898	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017275	GTTTT	2	10	71903	71912	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017275	GAT	2	6	72797	72802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017275	ATA	2	6	74256	74261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017275	T	6	6	74267	74272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017275	AAG	2	6	74295	74300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017275	A	6	6	76103	76108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017275	AT	3	6	80598	80603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017275	ATA	2	6	80617	80622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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