MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus HVE10/4 chromosome

Total Repeats: 9051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017275	TAT	2	6	2281779	2281784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_017275	AT	3	6	2281834	2281839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017275	AAT	2	6	2281857	2281862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017275	T	6	6	2283014	2283019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017275	T	6	6	2283028	2283033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017275	AT	3	6	2284519	2284524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017275	TAAA	2	8	2284564	2284571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017275	TAAG	2	8	2285406	2285413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017275	ATT	2	6	2285422	2285427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017275	TTA	2	6	2285453	2285458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_017275	AAAT	2	8	2285546	2285553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017275	TATTT	2	10	2285586	2285595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_017275	ATGA	2	8	2285599	2285606	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_017275	A	6	6	2285647	2285652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017275	AG	3	6	2285673	2285678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017275	TAGA	2	8	2285704	2285711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017275	TCCT	2	8	2285713	2285720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8018	NC_017275	AT	3	6	2285726	2285731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017275	AT	3	6	2285738	2285743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017275	ATA	2	6	2285747	2285752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017275	TTA	2	6	2285761	2285766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017275	ATT	2	6	2285774	2285779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017275	CTTG	2	8	2285869	2285876	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8024	NC_017275	CTTA	2	8	2286542	2286549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8025	NC_017275	T	6	6	2287476	2287481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_017275	AGTG	2	8	2287982	2287989	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017275	CAT	2	6	2288115	2288120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_017275	TAA	2	6	2288125	2288130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017275	TCA	2	6	2288182	2288187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_017275	ATA	2	6	2288232	2288237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017275	AGA	2	6	2288273	2288278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_017275	GAA	2	6	2288323	2288328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017275	TCCC	2	8	2288639	2288646	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8034	NC_017275	CCA	2	6	2288663	2288668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8035	NC_017275	TC	3	6	2288685	2288690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8038	NC_017275	CTC	2	6	2288790	2288795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8039	NC_017275	GAG	2	6	2288829	2288834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_017275	CAT	2	6	2288835	2288840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_017275	CAA	2	6	2288862	2288867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_017275	ATCC	2	8	2288893	2288900	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8043	NC_017275	TAA	2	6	2288942	2288947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017275	TA	3	6	2289173	2289178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017275	A	6	6	2289178	2289183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017275	TAT	2	6	2289190	2289195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_017275	T	6	6	2289200	2289205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_017275	AATT	2	8	2289206	2289213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017275	TAA	2	6	2289218	2289223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017275	AT	3	6	2290158	2290163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_017275	CAAT	2	8	2290167	2290174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8052	NC_017275	CTT	2	6	2291123	2291128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_017275	ATATT	2	10	2291162	2291171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017275	CTTT	2	8	2291183	2291190	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8055	NC_017275	TAAAA	2	10	2291247	2291256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017275	TAG	2	6	2291286	2291291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8059	NC_017275	TAT	2	6	2292533	2292538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017275	A	6	6	2298763	2298768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8062	NC_017275	ATT	2	6	2300428	2300433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_017275	A	6	6	2300758	2300763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_017275	TA	3	6	2301346	2301351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8066	NC_017275	TTA	2	6	2301373	2301378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_017275	TTA	2	6	2301402	2301407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017275	TA	3	6	2301421	2301426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_017275	T	7	7	2303449	2303455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_017275	TA	3	6	2303463	2303468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017275	ATT	2	6	2303494	2303499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_017275	ATA	2	6	2303959	2303964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_017275	AT	3	6	2306094	2306099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8076	NC_017275	AAG	2	6	2307742	2307747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8078	NC_017275	AGA	2	6	2307772	2307777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8080	NC_017275	TA	3	6	2311954	2311959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_017275	AATT	2	8	2311960	2311967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_017275	ATG	2	6	2311982	2311987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_017275	TTTA	2	8	2311988	2311995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_017275	TA	3	6	2312013	2312018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_017275	TA	4	8	2312044	2312051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_017275	ATA	3	9	2312049	2312057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_017275	TA	4	8	2312056	2312063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_017275	AGTA	2	8	2312072	2312079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017275	A	6	6	2312084	2312089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8091	NC_017275	T	6	6	2313804	2313809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_017275	TTA	2	6	2313812	2313817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8095	NC_017275	ATTTT	2	10	2313942	2313951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_017275	AG	3	6	2318905	2318910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_017275	TA	3	6	2319024	2319029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8099	NC_017275	TA	3	6	2319130	2319135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_017275	TTAA	2	8	2319179	2319186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_017275	GAT	2	6	2319239	2319244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_017275	AT	3	6	2319255	2319260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_017275	TCT	2	6	2319386	2319391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_017275	TTC	2	6	2320154	2320159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_017275	TTA	2	6	2320190	2320195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_017275	CTAT	2	8	2320257	2320264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8107	NC_017275	ATA	2	6	2320285	2320290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_017275	TA	3	6	2320292	2320297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017275	TA	3	6	2320303	2320308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_017275	GAA	2	6	2320320	2320325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8112	NC_017275	TA	3	6	2320393	2320398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017275	TAA	2	6	2320415	2320420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_017275	AACAT	2	10	2320446	2320455	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8115	NC_017275	CAG	2	6	2320491	2320496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_017275	A	7	7	2320505	2320511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_017275	AGTAA	2	10	2320535	2320544	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_017275	GAA	2	6	2321657	2321662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_017275	CTT	2	6	2321754	2321759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8121	NC_017275	TAAAAT	2	12	2321809	2321820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_017275	ATA	2	6	2323615	2323620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017275	TC	3	6	2323654	2323659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8124	NC_017275	TCCTT	2	10	2323715	2323724	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8125	NC_017275	TA	3	6	2323739	2323744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_017275	TA	4	8	2325447	2325454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_017275	T	6	6	2325461	2325466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017275	TATTT	2	10	2325469	2325478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_017275	ATT	2	6	2325498	2325503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_017275	ATTAT	2	10	2326503	2326512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_017275	TAT	2	6	2326531	2326536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_017275	AT	3	6	2326553	2326558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_017275	ATA	3	9	2327300	2327308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8134	NC_017275	ATA	2	6	2327388	2327393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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