MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus HVE10/4 chromosome

Total Repeats: 9051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017275	AAG	2	6	998336	998341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017275	TAA	2	6	998416	998421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017275	T	6	6	1000682	1000687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017275	AAG	2	6	1002130	1002135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017275	ATT	2	6	1002168	1002173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017275	AAT	2	6	1002178	1002183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017275	TGA	2	6	1002206	1002211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017275	TGAT	2	8	1002224	1002231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017275	AAATAT	2	12	1005199	1005210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017275	ATT	2	6	1005220	1005225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017275	ATA	2	6	1005248	1005253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017275	TAT	2	6	1005277	1005282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017275	TA	3	6	1005295	1005300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017275	TGC	2	6	1006159	1006164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_017275	TA	4	8	1006226	1006233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017275	T	6	6	1007402	1007407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017275	CGT	2	6	1007457	1007462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_017275	TGG	2	6	1007712	1007717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017275	ACT	2	6	1007811	1007816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_017275	TTA	2	6	1007860	1007865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017275	GGA	2	6	1007975	1007980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017275	TA	3	6	1008072	1008077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017275	GAA	2	6	1008103	1008108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017275	TAC	2	6	1008119	1008124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_017275	AGAAA	2	10	1008169	1008178	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017275	TGA	2	6	1008179	1008184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017275	TAA	2	6	1008252	1008257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017275	AAT	2	6	1008258	1008263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017275	TTAG	2	8	1008290	1008297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017275	AATT	2	8	1008304	1008311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017275	T	6	6	1009226	1009231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017275	TC	3	6	1009251	1009256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_017275	A	6	6	1009291	1009296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017275	TTGAT	2	10	1009298	1009307	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017275	ATG	2	6	1009315	1009320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017275	A	6	6	1009360	1009365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017275	ATA	2	6	1009464	1009469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017275	ATG	2	6	1009493	1009498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017275	AGTT	2	8	1009505	1009512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017275	GTCC	2	8	1009609	1009616	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_017275	TA	3	6	1009629	1009634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017275	ATT	2	6	1010877	1010882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017275	TCC	2	6	1010906	1010911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_017275	TGA	2	6	1010968	1010973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017275	CT	3	6	1010986	1010991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_017275	GGA	2	6	1010992	1010997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017275	AGTT	2	8	1011041	1011048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017275	T	6	6	1011074	1011079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017275	ATA	2	6	1011082	1011087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017275	A	6	6	1012181	1012186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017275	T	6	6	1012227	1012232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017275	A	6	6	1012238	1012243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017275	AAAT	2	8	1012282	1012289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017275	TTC	2	6	1012316	1012321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_017275	AT	3	6	1012325	1012330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017275	ATA	2	6	1012372	1012377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017275	TGAA	2	8	1012395	1012402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017275	ATT	2	6	1012403	1012408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017275	TTG	2	6	1012419	1012424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017275	TGT	2	6	1012482	1012487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017275	AAG	2	6	1012491	1012496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017275	TAAG	2	8	1012511	1012518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017275	TAA	3	9	1012700	1012708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017275	TCCC	2	8	1012733	1012740	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5065	NC_017275	C	6	6	1012738	1012743	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5066	NC_017275	TTA	2	6	1012818	1012823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017275	ATA	2	6	1012847	1012852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017275	TAA	2	6	1012859	1012864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017275	TTA	2	6	1013629	1013634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017275	AAGT	2	8	1013731	1013738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017275	TTA	2	6	1013795	1013800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017275	ACTTAT	2	12	1013813	1013824	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5073	NC_017275	GAA	2	6	1013832	1013837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017275	TCT	2	6	1013860	1013865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017275	ACC	2	6	1013914	1013919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_017275	AGG	2	6	1013946	1013951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017275	ACA	2	6	1013979	1013984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_017275	GAG	2	6	1014011	1014016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017275	AAT	2	6	1014017	1014022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017275	AAG	2	6	1014076	1014081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017275	CCT	2	6	1014105	1014110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_017275	ACT	2	6	1014124	1014129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_017275	GAA	2	6	1014169	1014174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017275	TAC	2	6	1014203	1014208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_017275	AGA	2	6	1014265	1014270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017275	CTT	2	6	1014277	1014282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_017275	CTT	2	6	1014287	1014292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_017275	T	8	8	1014295	1014302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017275	CTTG	2	8	1014325	1014332	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5090	NC_017275	TAG	2	6	1014338	1014343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017275	TTG	2	6	1014416	1014421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017275	TAG	2	6	1014422	1014427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017275	CTT	2	6	1014460	1014465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_017275	TCT	2	6	1014489	1014494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_017275	T	6	6	1014508	1014513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017275	CTT	2	6	1014571	1014576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_017275	TAC	2	6	1014758	1014763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_017275	GTT	2	6	1014818	1014823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017275	TTGA	2	8	1014888	1014895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017275	TTGG	2	8	1014961	1014968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017275	GA	3	6	1015034	1015039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017275	ATCA	2	8	1015059	1015066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5103	NC_017275	GTA	2	6	1015168	1015173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017275	GAC	2	6	1015183	1015188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_017275	AGCA	2	8	1015220	1015227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5106	NC_017275	ACT	2	6	1015237	1015242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_017275	GTG	2	6	1015247	1015252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017275	GTAGT	2	10	1015497	1015506	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017275	AGG	2	6	1015526	1015531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017275	GGAG	2	8	1015552	1015559	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017275	TTA	2	6	1015647	1015652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017275	GTT	2	6	1015660	1015665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017275	TA	3	6	1015674	1015679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017275	GAG	2	6	1015727	1015732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017275	AAGAGG	2	12	1015820	1015831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017275	CTC	2	6	1015847	1015852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_017275	TGG	2	6	1015860	1015865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017275	GGA	2	6	1015912	1015917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017275	AGG	2	6	1015945	1015950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017275	TGA	2	6	1015962	1015967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017275	AAC	2	6	1015993	1015998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_017275	CA	3	6	1016035	1016040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_017275	T	6	6	1016049	1016054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017275	TAC	2	6	1016084	1016089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_017275	AAT	2	6	1016164	1016169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017275	ATTAA	2	10	1016176	1016185	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017275	AT	3	6	1016212	1016217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017275	A	6	6	1016225	1016230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017275	TA	3	6	1016231	1016236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017275	AT	3	6	1017830	1017835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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