MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 10987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017274	ATA	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017274	TAG	2	6	87	92	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017274	TC	3	6	1391	1396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017274	T	6	6	1487	1492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017274	CCTT	2	8	1493	1500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017274	AG	3	6	1521	1526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017274	ATA	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017274	TAC	2	6	1562	1567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017274	TA	3	6	1577	1582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017274	A	6	6	1664	1669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017274	TAA	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017274	TAA	2	6	1776	1781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017274	AGGT	2	8	1794	1801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017274	CAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017274	CAG	2	6	2164	2169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017274	TAAA	2	8	3705	3712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017274	AAG	2	6	4578	4583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017274	ATA	2	6	4934	4939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017274	TTTTGT	2	12	4941	4952	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017274	AT	3	6	6199	6204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017274	CTTAA	2	10	7114	7123	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017274	CAT	2	6	7145	7150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017274	TTATA	2	10	7191	7200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017274	AAT	2	6	7213	7218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017274	AAT	2	6	7224	7229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017274	TAT	2	6	7267	7272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017274	TAA	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017274	CTATA	2	10	7361	7370	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017274	T	6	6	7376	7381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017274	AATAGA	2	12	7424	7435	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017274	GAA	2	6	7445	7450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017274	TTTA	2	8	7458	7465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017274	A	6	6	7539	7544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017274	CGT	2	6	7655	7660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017274	TAG	2	6	7697	7702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017274	CTT	2	6	7773	7778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017274	TA	3	6	7830	7835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017274	TAACG	2	10	7840	7849	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017274	TAG	3	9	7918	7926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017274	GTTC	2	8	7937	7944	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017274	TCA	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017274	T	6	6	9429	9434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017274	TA	3	6	9449	9454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017274	TA	3	6	10791	10796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017274	GTA	2	6	10804	10809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017274	CATC	2	8	11638	11645	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017274	TTA	2	6	18132	18137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017274	TC	3	6	18256	18261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017274	TAA	2	6	18295	18300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017274	CTT	2	6	18312	18317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017274	G	6	6	18341	18346	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017274	CT	3	6	18382	18387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017274	TG	3	6	18474	18479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017274	TGA	2	6	18484	18489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017274	AAC	3	9	18518	18526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017274	TCA	2	6	18576	18581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017274	TAT	2	6	18609	18614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017274	GGTT	2	8	19677	19684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017274	AT	3	6	19690	19695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017274	TAT	2	6	19718	19723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017274	CCTG	2	8	19736	19743	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017274	AAC	2	6	20450	20455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017274	T	6	6	22424	22429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017274	TGA	2	6	26317	26322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017274	GAT	2	6	26341	26346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017274	TAGA	2	8	26361	26368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017274	ATA	2	6	26389	26394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017274	AT	3	6	28058	28063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017274	ATA	2	6	28794	28799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017274	TAA	2	6	28809	28814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017274	GTA	2	6	28815	28820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017274	TAA	2	6	28831	28836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017274	TTC	2	6	28838	28843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017274	T	6	6	28855	28860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017274	ATAA	2	8	29947	29954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017274	TA	3	6	29962	29967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017274	TAT	2	6	29990	29995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017274	CTT	2	6	33159	33164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017274	AGA	2	6	33192	33197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017274	TAA	2	6	35940	35945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017274	TAC	2	6	35976	35981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017274	GGT	2	6	35991	35996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017274	TAA	2	6	38706	38711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017274	AG	3	6	39959	39964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017274	A	6	6	39970	39975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017274	TATTTA	2	12	39979	39990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017274	CCA	2	6	40177	40182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017274	TATTTA	2	12	40183	40194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017274	TTTA	2	8	40238	40245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017274	AGATA	2	10	40401	40410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017274	TAA	2	6	40495	40500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017274	TGGTG	2	10	40536	40545	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017274	AT	3	6	42293	42298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017274	TAA	2	6	42335	42340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017274	TTA	2	6	42342	42347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017274	TC	3	6	43542	43547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017274	TA	4	8	43968	43975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017274	TTA	2	6	46259	46264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017274	ATC	2	6	46279	46284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017274	TGA	2	6	47380	47385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017274	T	7	7	47393	47399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017274	TCT	2	6	47413	47418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017274	TC	3	6	49548	49553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017274	ACA	2	6	49575	49580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017274	AAAT	2	8	49595	49602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017274	CTCA	2	8	49716	49723	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017274	GAG	2	6	49779	49784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017274	GGA	2	6	49828	49833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017274	GTT	2	6	49838	49843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017274	TAC	2	6	49944	49949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017274	TTA	2	6	49957	49962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017274	CTT	2	6	49988	49993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017274	GAG	2	6	50009	50014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017274	AGTA	2	8	50048	50055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017274	GAA	2	6	50158	50163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017274	CTT	3	9	50244	50252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017274	CCT	2	6	50262	50267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017274	TGA	2	6	50300	50305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017274	TTG	2	6	50334	50339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017274	ATG	2	6	50353	50358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017274	ATA	3	9	50407	50415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017274	TAA	2	6	50441	50446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017274	CGAG	2	8	50534	50541	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017274	AAG	2	6	50557	50562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017274	ATT	2	6	50712	50717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017274	TTC	2	6	50731	50736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017274	TCA	2	6	50737	50742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017274	AAT	2	6	50759	50764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017274	AAT	2	6	50850	50855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017274	TTCT	2	8	50872	50879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017274	AAT	2	6	50881	50886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017274	AGA	2	6	50952	50957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017274	TTA	2	6	51078	51083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017274	TACT	2	8	51106	51113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017274	CT	3	6	52504	52509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017274	TAT	2	6	52545	52550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017274	ATA	2	6	52551	52556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017274	T	6	6	53710	53715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017274	AAC	2	6	53719	53724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017274	T	6	6	53738	53743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017274	AAT	2	6	53812	53817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017274	AAC	2	6	53860	53865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017274	TTC	2	6	53872	53877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017274	ACT	2	6	53931	53936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017274	TCAG	2	8	53964	53971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017274	AACT	2	8	53990	53997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017274	TAT	3	9	54002	54010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017274	TCC	2	6	54049	54054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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153	NC_017274	T	6	6	54396	54401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017274	TTA	2	6	54426	54431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_017274	TAC	2	6	107781	107786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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433	NC_017274	GAG	2	6	141103	141108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_017274	GAA	2	6	151784	151789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
443	NC_017274	ATA	2	6	151914	151919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_017274	ACTT	2	8	152028	152035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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454	NC_017274	ATA	2	6	154739	154744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_017274	TAT	3	9	154761	154769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_017274	TAT	2	6	158806	158811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_017274	TA	3	6	168612	168617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_017274	ATT	2	6	174746	174751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_017274	ATA	2	6	180411	180416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_017274	ATA	2	6	180429	180434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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