MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 10987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017274	GAG	2	6	1037864	1037869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017274	AGA	2	6	1037943	1037948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_017274	TTCC	2	8	1037972	1037979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_017274	TAA	2	6	1038029	1038034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017274	ATA	2	6	1038049	1038054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_017274	TTC	2	6	1038494	1038499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_017274	TTG	2	6	1039036	1039041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017274	TTA	2	6	1039089	1039094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_017274	ATATT	2	10	1039099	1039108	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017274	T	6	6	1039110	1039115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_017274	GAA	2	6	1039131	1039136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017274	ACGTC	2	10	1039194	1039203	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3513	NC_017274	AGTCCT	2	12	1039207	1039218	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_017274	CTC	2	6	1039228	1039233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_017274	AG	3	6	1039235	1039240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_017274	CAT	2	6	1039296	1039301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_017274	TCCT	2	8	1039313	1039320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_017274	AAT	2	6	1039333	1039338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017274	CTTC	2	8	1039347	1039354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_017274	CACATC	2	12	1039429	1039440	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_017274	CTT	2	6	1039459	1039464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_017274	TCC	3	9	1039580	1039588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_017274	TTC	2	6	1039637	1039642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_017274	AAG	2	6	1039664	1039669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_017274	CTC	2	6	1039670	1039675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_017274	TCC	2	6	1039677	1039682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_017274	AGG	2	6	1039685	1039690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_017274	ACG	2	6	1039716	1039721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_017274	CCT	2	6	1039801	1039806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_017274	TCC	2	6	1039830	1039835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_017274	GAG	2	6	1039957	1039962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017274	TA	3	6	1040090	1040095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017274	TCAT	2	8	1040142	1040149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_017274	T	6	6	1040154	1040159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017274	A	6	6	1040164	1040169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_017274	CCAA	2	8	1040201	1040208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_017274	AGT	2	6	1040298	1040303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_017274	TCC	2	6	1040324	1040329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_017274	ATT	2	6	1040366	1040371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017274	TCC	2	6	1040429	1040434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_017274	TCCT	2	8	1040505	1040512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_017274	TGA	2	6	1040601	1040606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_017274	TTCC	2	8	1040629	1040636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_017274	T	6	6	1040686	1040691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_017274	GTA	2	6	1040694	1040699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_017274	AAC	2	6	1040731	1040736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_017274	CTA	2	6	1040739	1040744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_017274	CGT	2	6	1040875	1040880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_017274	ATA	2	6	1041068	1041073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_017274	TTTC	2	8	1041081	1041088	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3551	NC_017274	T	7	7	1041145	1041151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_017274	TAT	2	6	1041172	1041177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_017274	AGA	2	6	1041247	1041252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017274	A	6	6	1041276	1041281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017274	GTT	2	6	1041297	1041302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_017274	GAAGA	2	10	1041303	1041312	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_017274	GTT	2	6	1041317	1041322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_017274	AGA	2	6	1041325	1041330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017274	AAT	2	6	1041345	1041350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017274	A	6	6	1041406	1041411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017274	CAGCTG	2	12	1041425	1041436	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_017274	G	6	6	1041457	1041462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017274	ATT	2	6	1041486	1041491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017274	AATT	2	8	1041494	1041501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017274	ATA	2	6	1041506	1041511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017274	CGG	2	6	1041550	1041555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_017274	TAT	3	9	1041586	1041594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017274	A	6	6	1041602	1041607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_017274	A	7	7	1041626	1041632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_017274	A	6	6	1041691	1041696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_017274	GATA	2	8	1041714	1041721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_017274	TTC	3	9	1041757	1041765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_017274	TTC	2	6	1041850	1041855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_017274	CAC	2	6	1041884	1041889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_017274	TTTG	2	8	1041901	1041908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_017274	CTA	2	6	1041929	1041934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_017274	TAC	2	6	1041969	1041974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_017274	TCT	2	6	1041999	1042004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_017274	ATC	2	6	1042092	1042097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_017274	TTG	2	6	1042166	1042171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_017274	AAC	2	6	1042228	1042233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_017274	CTA	2	6	1042237	1042242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_017274	C	6	6	1042301	1042306	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3584	NC_017274	TTG	2	6	1042388	1042393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_017274	TAAC	2	8	1042412	1042419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3587	NC_017274	ATA	2	6	1042598	1042603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_017274	CTT	2	6	1042644	1042649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_017274	TGA	2	6	1042658	1042663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3591	NC_017274	CCG	2	6	1042815	1042820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_017274	TCT	2	6	1042828	1042833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_017274	CTT	2	6	1042868	1042873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_017274	CTA	2	6	1043075	1043080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3596	NC_017274	T	6	6	1043166	1043171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_017274	GTG	2	6	1043261	1043266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_017274	AAG	2	6	1043354	1043359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_017274	A	6	6	1043361	1043366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_017274	GAA	2	6	1043381	1043386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_017274	TA	4	8	1043405	1043412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017274	TAT	2	6	1043435	1043440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017274	CGT	2	6	1044508	1044513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_017274	CAC	2	6	1044517	1044522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_017274	TTA	3	9	1044548	1044556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017274	T	6	6	1044572	1044577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017274	ATT	2	6	1044582	1044587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_017274	ATGTT	2	10	1044593	1044602	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_017274	ATA	2	6	1044605	1044610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_017274	AAT	2	6	1044675	1044680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017274	T	6	6	1044731	1044736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017274	ATT	2	6	1044753	1044758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_017274	C	6	6	1044763	1044768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3614	NC_017274	TCT	2	6	1044784	1044789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_017274	GTA	2	6	1044901	1044906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_017274	TAC	2	6	1044914	1044919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_017274	TCTA	2	8	1044980	1044987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_017274	TTTC	2	8	1045045	1045052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3619	NC_017274	TTC	2	6	1045058	1045063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_017274	TCT	2	6	1045075	1045080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_017274	TATC	2	8	1045134	1045141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_017274	TCT	2	6	1045176	1045181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_017274	TTC	2	6	1045248	1045253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_017274	ATTT	2	8	1045298	1045305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_017274	CT	3	6	1045309	1045314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_017274	TAA	2	6	1045332	1045337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_017274	TTC	2	6	1045499	1045504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_017274	GT	3	6	1045552	1045557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_017274	ATC	2	6	1045692	1045697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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