MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 10987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017274	ATT	2	6	2238774	2238779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_017274	AT	3	6	2238807	2238812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017274	TTAGG	2	10	2238844	2238853	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017274	CTA	2	6	2238860	2238865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_017274	AGG	2	6	2240169	2240174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017274	GTT	2	6	2240219	2240224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017274	GTA	2	6	2240350	2240355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017274	AAATT	2	10	2240356	2240365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017274	GTA	2	6	2240478	2240483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017274	AAT	2	6	2240525	2240530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_017274	ACT	2	6	2240641	2240646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_017274	TAT	2	6	2240788	2240793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_017274	TAT	2	6	2240855	2240860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_017274	TCC	2	6	2241002	2241007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_017274	AAAG	2	8	2241064	2241071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017274	GTATT	2	10	2241080	2241089	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017274	ACA	2	6	2241125	2241130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_017274	CAAG	2	8	2241223	2241230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8019	NC_017274	ATA	2	6	2241266	2241271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017274	TAA	2	6	2241280	2241285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017274	T	6	6	2241301	2241306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017274	TTAA	2	8	2241329	2241336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017274	ATT	2	6	2241353	2241358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017274	TA	3	6	2241362	2241367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_017274	ATA	2	6	2241398	2241403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_017274	A	6	6	2241461	2241466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017274	CTT	2	6	2241491	2241496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_017274	GAGG	2	8	2241506	2241513	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017274	ATA	2	6	2241518	2241523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017274	ATT	2	6	2241529	2241534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017274	AAT	2	6	2241578	2241583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_017274	AT	3	6	2241599	2241604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017274	TCT	2	6	2241610	2241615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_017274	CTC	2	6	2241616	2241621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8035	NC_017274	GAT	2	6	2241692	2241697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_017274	ATA	2	6	2241770	2241775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_017274	GAA	2	6	2241866	2241871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_017274	TTG	2	6	2241906	2241911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017274	GGA	2	6	2241917	2241922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_017274	AGA	2	6	2241954	2241959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_017274	TAT	2	6	2241969	2241974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_017274	ATAAA	2	10	2241975	2241984	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_017274	A	7	7	2241989	2241995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017274	ATT	2	6	2242054	2242059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017274	ATT	2	6	2242090	2242095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017274	TATAA	2	10	2242103	2242112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_017274	GAT	2	6	2242196	2242201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_017274	AAG	2	6	2242250	2242255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017274	GAA	2	6	2242313	2242318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017274	CTC	2	6	2242335	2242340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_017274	AGAT	2	8	2242366	2242373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_017274	GGA	2	6	2242387	2242392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017274	ATA	2	6	2242400	2242405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017274	CAC	2	6	2242408	2242413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8055	NC_017274	GA	3	6	2242429	2242434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017274	AT	3	6	2242462	2242467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017274	A	6	6	2242581	2242586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017274	ATT	2	6	2242661	2242666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017274	TAC	2	6	2242709	2242714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_017274	TAATT	2	10	2242828	2242837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_017274	TGA	2	6	2242923	2242928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_017274	TTA	2	6	2242963	2242968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_017274	A	6	6	2243011	2243016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_017274	ATA	2	6	2243021	2243026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_017274	AAT	2	6	2243049	2243054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017274	TTTTA	2	10	2243061	2243070	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_017274	AGA	2	6	2243071	2243076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017274	AAT	2	6	2243094	2243099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_017274	GCT	2	6	2243158	2243163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_017274	ATTT	2	8	2243186	2243193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017274	AAT	2	6	2243194	2243199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_017274	ATC	2	6	2243273	2243278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8075	NC_017274	ATT	2	6	2243344	2243349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_017274	CA	3	6	2243388	2243393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8077	NC_017274	ATA	2	6	2243413	2243418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_017274	ATT	2	6	2243425	2243430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_017274	A	6	6	2243479	2243484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_017274	GA	4	8	2243485	2243492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_017274	AAC	2	6	2243515	2243520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_017274	TC	3	6	2243541	2243546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8083	NC_017274	AGG	2	6	2243556	2243561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_017274	TGG	2	6	2243611	2243616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8087	NC_017274	TCT	2	6	2243770	2243775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_017274	AAGG	2	8	2243814	2243821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017274	CT	3	6	2243830	2243835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8090	NC_017274	TCC	2	6	2244506	2244511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8091	NC_017274	TTAG	2	8	2244515	2244522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_017274	TAT	2	6	2244551	2244556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_017274	TC	3	6	2244602	2244607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8095	NC_017274	CAA	2	6	2244625	2244630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_017274	TA	4	8	2244667	2244674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_017274	TTC	2	6	2244690	2244695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8100	NC_017274	TA	3	6	2244793	2244798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_017274	GTT	2	6	2244809	2244814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_017274	GA	3	6	2244816	2244821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_017274	TAA	2	6	2244922	2244927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_017274	ATT	2	6	2245009	2245014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_017274	ATA	2	6	2245034	2245039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_017274	AGT	3	9	2245061	2245069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8108	NC_017274	TAG	2	6	2245186	2245191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017274	AT	3	6	2245214	2245219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_017274	T	6	6	2245314	2245319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_017274	ATA	2	6	2245321	2245326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_017274	TAAGG	2	10	2245388	2245397	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017274	ACT	2	6	2245409	2245414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_017274	TACGT	2	10	2245456	2245465	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8115	NC_017274	AT	3	6	2245471	2245476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_017274	AAG	2	6	2245529	2245534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_017274	ACT	2	6	2245604	2245609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_017274	GAG	2	6	2245642	2245647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_017274	TA	3	6	2245719	2245724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_017274	CT	3	6	2246457	2246462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_017274	T	6	6	2246536	2246541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_017274	GGA	2	6	2248433	2248438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017274	ATT	2	6	2248445	2248450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_017274	AAG	2	6	2248486	2248491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8126	NC_017274	CTA	2	6	2248607	2248612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_017274	AGAA	2	8	2248671	2248678	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017274	CTA	2	6	2248684	2248689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_017274	GAT	2	6	2248774	2248779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_017274	CGT	2	6	2248903	2248908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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