MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 10987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_017274	ATAA	2	8	2173455	2173462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_017274	CTC	2	6	2173610	2173615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7503	NC_017274	AAAT	2	8	2173675	2173682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_017274	TAT	2	6	2173789	2173794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_017274	GTT	2	6	2173862	2173867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_017274	TAT	2	6	2173897	2173902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_017274	T	6	6	2173909	2173914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_017274	T	6	6	2174830	2174835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_017274	TAT	2	6	2174846	2174851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_017274	TA	3	6	2174927	2174932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_017274	TTAA	2	8	2176220	2176227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_017274	TAA	2	6	2176239	2176244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_017274	TAAT	2	8	2176284	2176291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_017274	TTG	2	6	2176396	2176401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_017274	ATA	2	6	2176470	2176475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_017274	TA	3	6	2176688	2176693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_017274	ATT	2	6	2179632	2179637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_017274	AAAT	2	8	2179737	2179744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_017274	TAA	2	6	2179754	2179759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_017274	ATC	2	6	2179803	2179808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_017274	CTC	2	6	2179839	2179844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7522	NC_017274	CCT	2	6	2179845	2179850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7523	NC_017274	CAC	2	6	2179851	2179856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7524	NC_017274	GAAGG	2	10	2179928	2179937	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_017274	CCTTA	2	10	2179976	2179985	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7526	NC_017274	ACA	2	6	2179990	2179995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7527	NC_017274	TTC	2	6	2180001	2180006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_017274	TCC	2	6	2180023	2180028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7529	NC_017274	CCT	2	6	2180044	2180049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7530	NC_017274	CTA	2	6	2180070	2180075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7531	NC_017274	AACTT	2	10	2180091	2180100	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7532	NC_017274	CTC	2	6	2180150	2180155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7533	NC_017274	TA	3	6	2180190	2180195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_017274	TG	3	6	2180326	2180331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_017274	CAT	2	6	2180348	2180353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_017274	GTA	3	9	2180356	2180364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_017274	CTC	2	6	2180509	2180514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7538	NC_017274	TGT	2	6	2180544	2180549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_017274	CT	3	6	2180564	2180569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7540	NC_017274	CTTG	2	8	2180662	2180669	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7541	NC_017274	T	6	6	2180741	2180746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_017274	TGT	2	6	2180767	2180772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_017274	ATT	2	6	2180804	2180809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_017274	ATT	2	6	2180818	2180823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_017274	GCAG	2	8	2180856	2180863	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7546	NC_017274	A	6	6	2181986	2181991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_017274	T	6	6	2182003	2182008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_017274	AGA	2	6	2182050	2182055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_017274	AT	3	6	2182108	2182113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_017274	AAG	2	6	2182166	2182171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_017274	ATG	2	6	2182202	2182207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_017274	A	6	6	2182276	2182281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_017274	TA	3	6	2182322	2182327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_017274	ATC	2	6	2182337	2182342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_017274	GGGGA	2	10	2182361	2182370	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_017274	GAG	2	6	2182379	2182384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_017274	AAC	2	6	2183424	2183429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7558	NC_017274	GAA	2	6	2183442	2183447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_017274	CAT	2	6	2183468	2183473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7560	NC_017274	CAA	2	6	2183500	2183505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_017274	AAAG	2	8	2183523	2183530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_017274	CTA	2	6	2183544	2183549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7563	NC_017274	GAAA	2	8	2183565	2183572	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_017274	GAAA	2	8	2183585	2183592	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_017274	ACG	2	6	2183603	2183608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7566	NC_017274	AAC	2	6	2183653	2183658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_017274	CT	3	6	2183735	2183740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7568	NC_017274	CGA	2	6	2183751	2183756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7569	NC_017274	GAG	2	6	2183770	2183775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_017274	TAC	2	6	2183846	2183851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7571	NC_017274	ACT	2	6	2183877	2183882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7572	NC_017274	AGA	2	6	2183892	2183897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_017274	AGG	2	6	2183903	2183908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_017274	GAG	2	6	2184075	2184080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_017274	TAA	3	9	2184285	2184293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_017274	TAG	2	6	2184357	2184362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_017274	TTA	2	6	2184395	2184400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_017274	TCGA	2	8	2184466	2184473	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7579	NC_017274	TAATT	2	10	2184501	2184510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_017274	AT	3	6	2186870	2186875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_017274	TAT	2	6	2186877	2186882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7582	NC_017274	T	6	6	2187094	2187099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_017274	TAT	2	6	2187102	2187107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_017274	ATA	2	6	2187130	2187135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7585	NC_017274	TA	3	6	2187158	2187163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7586	NC_017274	ATAAAA	2	12	2187182	2187193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7587	NC_017274	A	8	8	2187190	2187197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_017274	CTT	2	6	2187282	2187287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7589	NC_017274	ATT	2	6	2187399	2187404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7590	NC_017274	GAG	2	6	2187461	2187466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7592	NC_017274	ATT	2	6	2188183	2188188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_017274	AGG	2	6	2188238	2188243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7595	NC_017274	TGAAA	2	10	2188314	2188323	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_017274	A	6	6	2188327	2188332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_017274	TAC	2	6	2188342	2188347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7599	NC_017274	AG	3	6	2188421	2188426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_017274	GAA	2	6	2188432	2188437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_017274	AAG	2	6	2188440	2188445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_017274	AGA	2	6	2188469	2188474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_017274	TA	3	6	2188509	2188514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_017274	GAG	2	6	2188515	2188520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_017274	AAG	2	6	2188597	2188602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7609	NC_017274	TTA	2	6	2189033	2189038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_017274	GGA	3	9	2189066	2189074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_017274	TAT	2	6	2189079	2189084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_017274	TAA	2	6	2189120	2189125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_017274	GGA	2	6	2189150	2189155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_017274	TAT	2	6	2189193	2189198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_017274	TTC	2	6	2189254	2189259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7619	NC_017274	TAT	2	6	2189549	2189554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7621	NC_017274	AGA	2	6	2189745	2189750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7622	NC_017274	AAGG	2	8	2189776	2189783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_017274	CTT	2	6	2189808	2189813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7624	NC_017274	CTAC	2	8	2189814	2189821	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7625	NC_017274	GAA	2	6	2189824	2189829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7626	NC_017274	TAA	2	6	2189858	2189863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_017274	GAAG	2	8	2189877	2189884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_017274	AGA	2	6	2189894	2189899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7629	NC_017274	CATA	2	8	2189960	2189967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7630	NC_017274	TGA	2	6	2190020	2190025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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