MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 10987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017274	ACA	2	6	2097429	2097434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_017274	CAT	2	6	2097602	2097607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_017274	AAT	2	6	2097673	2097678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_017274	CCA	2	6	2097746	2097751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_017274	GAG	2	6	2097756	2097761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_017274	AAG	2	6	2097935	2097940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_017274	AGA	2	6	2097991	2097996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_017274	CTT	2	6	2098107	2098112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_017274	CTT	2	6	2098125	2098130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_017274	CTA	2	6	2098230	2098235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_017274	CAT	2	6	2098236	2098241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_017274	GCCAA	2	10	2098252	2098261	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7013	NC_017274	TA	3	6	2098312	2098317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_017274	GAA	2	6	2098385	2098390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_017274	AAT	2	6	2098448	2098453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_017274	TGATA	2	10	2098575	2098584	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_017274	TA	3	6	2098610	2098615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_017274	AAG	2	6	2098667	2098672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_017274	AGGAT	2	10	2098680	2098689	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_017274	CAT	2	6	2098769	2098774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_017274	TAT	2	6	2098891	2098896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_017274	ATT	2	6	2098943	2098948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_017274	GATGTT	2	12	2098991	2099002	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_017274	TAT	2	6	2099011	2099016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_017274	AGA	2	6	2099171	2099176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_017274	ATT	2	6	2099200	2099205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_017274	TGA	2	6	2099275	2099280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_017274	GAA	2	6	2099312	2099317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_017274	GAAA	2	8	2099361	2099368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_017274	AT	3	6	2099493	2099498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_017274	CAA	2	6	2099586	2099591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_017274	T	7	7	2099640	2099646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_017274	ATG	2	6	2099684	2099689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_017274	AGA	2	6	2099707	2099712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_017274	GAAA	2	8	2099738	2099745	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_017274	GGT	2	6	2099831	2099836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_017274	AAG	3	9	2099892	2099900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_017274	AAC	2	6	2099943	2099948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_017274	CTAGCA	2	12	2100132	2100143	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_017274	TCA	2	6	2100185	2100190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_017274	TGA	2	6	2100250	2100255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_017274	C	6	6	2100281	2100286	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7043	NC_017274	AGG	2	6	2100288	2100293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_017274	GA	3	6	2100297	2100302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_017274	GTTAAC	2	12	2100417	2100428	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7046	NC_017274	AGA	2	6	2100456	2100461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_017274	GTT	2	6	2100498	2100503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_017274	CAC	2	6	2100512	2100517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_017274	GA	3	6	2100555	2100560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_017274	TAGA	2	8	2100602	2100609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_017274	TAG	2	6	2100613	2100618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_017274	GTA	2	6	2100629	2100634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_017274	CAT	2	6	2100684	2100689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_017274	CCT	2	6	2100730	2100735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7055	NC_017274	CCT	2	6	2100825	2100830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7056	NC_017274	TCCC	2	8	2100892	2100899	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7057	NC_017274	CTTT	2	8	2101097	2101104	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7058	NC_017274	AT	3	6	2101126	2101131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_017274	CTT	2	6	2101163	2101168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_017274	TC	3	6	2101223	2101228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7061	NC_017274	T	7	7	2101234	2101240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_017274	AG	3	6	2101396	2101401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_017274	TCT	2	6	2101408	2101413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_017274	ATA	2	6	2101476	2101481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_017274	TTG	2	6	2101532	2101537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_017274	AGT	2	6	2101712	2101717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_017274	A	6	6	2101832	2101837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_017274	AAT	2	6	2101855	2101860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_017274	T	6	6	2101860	2101865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_017274	TTC	2	6	2103155	2103160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_017274	T	9	9	2103201	2103209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_017274	T	6	6	2103232	2103237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_017274	TAT	2	6	2103249	2103254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_017274	ATA	2	6	2103279	2103284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_017274	TTC	2	6	2103289	2103294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_017274	TA	3	6	2103356	2103361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_017274	ATG	2	6	2103412	2103417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_017274	T	6	6	2103547	2103552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_017274	TAT	2	6	2103559	2103564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7081	NC_017274	AG	3	6	2106271	2106276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_017274	AG	3	6	2106336	2106341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_017274	TAT	2	6	2106342	2106347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_017274	AGA	2	6	2106359	2106364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_017274	CCTT	2	8	2106487	2106494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7086	NC_017274	TATAAA	2	12	2106569	2106580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_017274	GAC	2	6	2106590	2106595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7089	NC_017274	T	6	6	2106608	2106613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_017274	GAAAA	2	10	2106644	2106653	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_017274	TTG	2	6	2109524	2109529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_017274	GTA	3	9	2109569	2109577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_017274	TTTA	2	8	2109666	2109673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_017274	TAA	2	6	2109720	2109725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_017274	ATTT	2	8	2109734	2109741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_017274	GAT	2	6	2109749	2109754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7098	NC_017274	ACT	2	6	2109949	2109954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_017274	ACT	2	6	2109956	2109961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_017274	TTC	2	6	2109963	2109968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_017274	TTC	2	6	2109978	2109983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_017274	ACT	2	6	2110167	2110172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_017274	TC	3	6	2110195	2110200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7104	NC_017274	AT	5	10	2110210	2110219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_017274	T	6	6	2110229	2110234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_017274	A	6	6	2111563	2111568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_017274	T	9	9	2113822	2113830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_017274	TC	4	8	2113835	2113842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7109	NC_017274	GTG	2	6	2114015	2114020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_017274	ATT	2	6	2114030	2114035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_017274	ATA	2	6	2114049	2114054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_017274	ATT	2	6	2114098	2114103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_017274	AACAT	2	10	2114108	2114117	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7114	NC_017274	A	6	6	2114133	2114138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_017274	TAA	3	9	2114154	2114162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_017274	GAG	2	6	2114163	2114168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_017274	GTG	2	6	2114188	2114193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_017274	ACG	2	6	2114197	2114202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_017274	ATA	2	6	2115270	2115275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_017274	TTG	2	6	2115778	2115783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_017274	ATA	2	6	2115853	2115858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_017274	TTAG	2	8	2115864	2115871	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_017274	TAT	2	6	2115971	2115976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7127	NC_017274	TTA	2	6	2116146	2116151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_017274	TTTC	2	8	2116174	2116181	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7129	NC_017274	TTA	2	6	2116188	2116193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7131	NC_017274	TAT	2	6	2117560	2117565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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