MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta africana DSM 8902 chromosome

Total Repeats: 4714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017098	ACCCG	2	10	1448	1457	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_017098	A	6	6	1508	1513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017098	TGC	2	6	1515	1520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017098	CAC	2	6	1526	1531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017098	TA	3	6	1536	1541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017098	CTA	5	15	1573	1587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017098	TA	3	6	1596	1601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017098	AGA	2	6	1615	1620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017098	CCA	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017098	GCAG	2	8	4385	4392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017098	GAA	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017098	T	7	7	7550	7556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017098	AT	3	6	7578	7583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017098	AAC	2	6	7589	7594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017098	TG	3	6	7689	7694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017098	GAG	2	6	7758	7763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017098	CGC	2	6	9681	9686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017098	GCG	2	6	9706	9711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017098	TCG	2	6	10990	10995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017098	TGC	2	6	14041	14046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017098	C	6	6	14055	14060	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_017098	GGGT	2	8	14722	14729	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017098	G	6	6	16209	16214	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017098	CCACC	2	10	16217	16226	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_017098	GCC	2	6	16234	16239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017098	C	6	6	16266	16271	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_017098	CGC	2	6	16308	16313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017098	CCG	2	6	16317	16322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017098	GCACCC	2	12	16348	16359	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017098	C	6	6	16357	16362	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_017098	GC	3	6	16363	16368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017098	CCGC	2	8	16405	16412	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_017098	GTG	2	6	16421	16426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017098	AGT	2	6	16500	16505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017098	TG	3	6	17775	17780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017098	CTA	2	6	17802	17807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017098	GGA	2	6	17816	17821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017098	ATC	2	6	17888	17893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017098	ATT	2	6	17928	17933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017098	AGG	2	6	17963	17968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017098	CTGG	2	8	18063	18070	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017098	AT	3	6	18120	18125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017098	TC	3	6	18213	18218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017098	AAC	2	6	18244	18249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017098	TAC	2	6	18777	18782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017098	A	7	7	18806	18812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017098	TC	3	6	18818	18823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017098	GCC	2	6	23125	23130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017098	AAC	2	6	23137	23142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017098	ATA	2	6	23241	23246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017098	GTA	2	6	23324	23329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017098	AGAT	2	8	23416	23423	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017098	CTC	2	6	23478	23483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017098	CAG	2	6	23505	23510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017098	ATTCTG	2	12	23691	23702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017098	TGC	2	6	23790	23795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017098	GTG	2	6	23856	23861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017098	GCC	2	6	23888	23893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017098	GCC	2	6	31159	31164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017098	T	7	7	31185	31191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017098	GTT	2	6	31228	31233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017098	GTT	2	6	31399	31404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017098	CTG	2	6	32125	32130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017098	ACC	2	6	38882	38887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017098	CCT	2	6	38913	38918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017098	AT	3	6	38922	38927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017098	ATT	2	6	40136	40141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017098	T	7	7	46724	46730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017098	ACT	2	6	46739	46744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017098	TGT	2	6	47967	47972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017098	A	6	6	49218	49223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017098	AAAT	2	8	49242	49249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017098	GAT	2	6	49269	49274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017098	GATA	2	8	50021	50028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017098	GGT	2	6	50037	50042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017098	GTAT	2	8	50066	50073	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017098	TTG	2	6	63420	63425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017098	TA	3	6	63431	63436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017098	TTA	2	6	63442	63447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017098	ATT	2	6	63463	63468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017098	CCG	2	6	69088	69093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017098	TCAGA	2	10	69153	69162	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017098	TGC	2	6	69168	69173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017098	GCA	2	6	69208	69213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017098	AGC	2	6	69742	69747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017098	GGC	2	6	69755	69760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017098	GGC	2	6	69771	69776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017098	GCTGGC	2	12	71001	71012	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017098	GAG	2	6	71020	71025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017098	CCT	2	6	75163	75168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017098	TGTTT	2	10	75172	75181	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017098	GTGC	2	8	75187	75194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017098	TGG	2	6	75196	75201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017098	TCAG	2	8	77317	77324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017098	T	8	8	77359	77366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017098	CG	3	6	79209	79214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017098	GCG	2	6	81825	81830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017098	GGT	2	6	81836	81841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017098	GCA	2	6	81851	81856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017098	C	6	6	84787	84792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_017098	TG	3	6	84801	84806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017098	TCAGA	2	10	87260	87269	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017098	GTCT	2	8	87327	87334	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017098	TCC	2	6	87341	87346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017098	CCG	2	6	89986	89991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017098	GCG	2	6	90012	90017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017098	GGC	2	6	90021	90026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017098	TAG	2	6	91852	91857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017098	TAT	2	6	91860	91865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017098	GGT	2	6	93911	93916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017098	TGCC	2	8	93936	93943	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017098	GCT	2	6	95054	95059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017098	CGG	2	6	95064	95069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017098	GCT	2	6	95071	95076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017098	CG	3	6	95083	95088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017098	AGCA	2	8	95764	95771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017098	AGCA	2	8	95782	95789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017098	AGCA	2	8	95800	95807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017098	TTG	2	6	97329	97334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017098	CCA	2	6	99342	99347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017098	TG	3	6	105124	105129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017098	AGT	2	6	105147	105152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017098	GTTC	2	8	105771	105778	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017098	GTCT	2	8	105780	105787	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017098	A	6	6	105792	105797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017098	T	6	6	105822	105827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017098	CGC	2	6	105860	105865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017098	GCA	2	6	107701	107706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017098	GT	3	6	107735	107740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017098	AAAT	2	8	111358	111365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017098	T	6	6	111378	111383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017098	GT	4	8	111386	111393	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017098	ATGA	2	8	111457	111464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017098	TTCA	2	8	111468	111475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017098	AGG	2	6	111506	111511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017098	A	6	6	119191	119196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017098	CAA	2	6	119206	119211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017098	GAGT	2	8	124934	124941	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017098	TCC	2	6	124942	124947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017098	TCG	2	6	124974	124979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017098	GAG	2	6	125710	125715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017098	TTAT	2	8	126070	126077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017098	ATA	2	6	126131	126136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017098	AGC	2	6	126148	126153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017098	AGG	2	6	128151	128156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017098	TGTT	2	8	130273	130280	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017098	TAA	2	6	130297	130302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017098	TGAGG	2	10	132994	133003	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017098	T	6	6	134527	134532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017098	CCT	2	6	135782	135787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_017098	A	8	8	135831	135838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017098	CCT	2	6	136630	136635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_017098	CCG	3	9	136652	136660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_017098	TCA	2	6	136682	136687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017098	TCC	2	6	136708	136713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_017098	GCT	2	6	145761	145766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_017098	CAG	2	6	147532	147537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_017098	ACA	2	6	147588	147593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_017098	CGGA	2	8	147600	147607	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_017098	CAG	2	6	147631	147636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_017098	TACT	2	8	147652	147659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_017098	AGAA	2	8	147663	147670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017098	AGG	2	6	147675	147680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017098	CAG	2	6	149934	149939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_017098	CGG	2	6	153565	153570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_017098	GCGGG	2	10	153616	153625	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
170	NC_017098	CT	3	6	153698	153703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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175	NC_017098	GCT	2	6	166567	166572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_017098	CTAT	2	8	166635	166642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
180	NC_017098	AGG	2	6	166659	166664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017098	CAG	2	6	168895	168900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_017098	CAG	2	6	168914	168919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_017098	CAG	2	6	168937	168942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_017098	A	6	6	169007	169012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017098	GC	3	6	169031	169036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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189	NC_017098	AGG	2	6	175109	175114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_017098	TAT	2	6	182173	182178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_017098	GCG	2	6	192369	192374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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251	NC_017098	CGG	2	6	239645	239650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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270	NC_017098	T	10	10	261847	261856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017098	ACTC	2	8	262368	262375	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
272	NC_017098	TA	3	6	262400	262405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017098	AAT	2	6	262444	262449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017098	AGG	2	6	262484	262489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017098	T	6	6	262505	262510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_017098	TTTC	2	8	262519	262526	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
277	NC_017098	GCC	2	6	262952	262957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
278	NC_017098	GGC	2	6	262969	262974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_017098	T	7	7	262975	262981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017098	GGC	2	6	262994	262999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_017098	TTATG	2	10	264055	264064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017098	TCC	2	6	270515	270520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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284	NC_017098	CGG	2	6	272385	272390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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