MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1

Total Repeats: 678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017078	TGG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017078	TTTA	2	8	2291	2298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017078	TTAT	2	8	2311	2318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017078	C	6	6	2350	2355	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_017078	ACC	2	6	2383	2388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017078	AGA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017078	ACC	2	6	2437	2442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017078	A	7	7	2475	2481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017078	CAC	2	6	2558	2563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017078	CAC	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017078	CAC	2	6	2685	2690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017078	TCC	2	6	2710	2715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017078	A	6	6	2742	2747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017078	C	6	6	2794	2799	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_017078	TA	4	8	2814	2821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017078	TTA	2	6	2822	2827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017078	TAT	2	6	2834	2839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017078	ATATA	2	10	2846	2855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017078	TGT	2	6	2869	2874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017078	CCA	2	6	2897	2902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017078	TAA	2	6	2912	2917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017078	AAG	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017078	TGT	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017078	T	6	6	4375	4380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017078	TAA	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017078	AGA	2	6	4446	4451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017078	GAG	2	6	4457	4462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017078	CAG	2	6	5792	5797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017078	CCT	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017078	AAT	2	6	5885	5890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017078	TAT	2	6	5907	5912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017078	GAAT	2	8	5962	5969	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017078	AT	3	6	5978	5983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017078	GGA	2	6	6006	6011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017078	A	6	6	8956	8961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017078	GCA	2	6	9062	9067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017078	ATC	2	6	9083	9088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017078	AAT	2	6	9094	9099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017078	AT	3	6	9105	9110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017078	AG	3	6	9113	9118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017078	ATT	2	6	9384	9389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017078	T	6	6	9401	9406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017078	GAT	2	6	9428	9433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017078	TGG	2	6	9456	9461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017078	ATA	2	6	9470	9475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017078	C	6	6	9477	9482	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_017078	TTG	2	6	9498	9503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017078	ATT	2	6	9534	9539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017078	GAG	2	6	9545	9550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017078	ATC	2	6	9553	9558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017078	ATA	2	6	10600	10605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017078	CAGGT	2	10	12098	12107	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017078	TAT	2	6	12199	12204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017078	TA	3	6	12223	12228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017078	TAT	2	6	14706	14711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017078	AT	3	6	15924	15929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017078	TC	3	6	15932	15937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017078	ATG	2	6	15939	15944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017078	CGT	2	6	15973	15978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017078	TGG	2	6	15991	15996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017078	TGA	2	6	16000	16005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017078	A	6	6	16034	16039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017078	TTA	2	6	16040	16045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017078	CAT	2	6	16085	16090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017078	T	8	8	16098	16105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017078	GGA	2	6	17747	17752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017078	AGG	2	6	18116	18121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017078	AGG	2	6	18134	18139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017078	GCAA	2	8	18699	18706	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017078	AGG	3	9	19463	19471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017078	ATAAA	2	10	22304	22313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017078	TCTG	2	8	22377	22384	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017078	CTGT	2	8	22389	22396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017078	ATT	2	6	23026	23031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017078	GAA	2	6	23352	23357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017078	TCT	2	6	25076	25081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017078	AGA	2	6	26783	26788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017078	TTAT	2	8	26802	26809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017078	AAGTA	2	10	27323	27332	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017078	TCA	2	6	27495	27500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017078	GAA	2	6	27540	27545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017078	CTG	2	6	27550	27555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017078	AGG	2	6	27571	27576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017078	TGG	2	6	27612	27617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017078	GAAA	2	8	27635	27642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017078	AAT	2	6	27651	27656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017078	ATT	2	6	27678	27683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017078	TGA	3	9	28305	28313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017078	TAG	2	6	28316	28321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017078	CTGTT	2	10	29730	29739	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017078	CAAT	2	8	29740	29747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017078	TTG	2	6	29767	29772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017078	TTG	2	6	31284	31289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017078	CTTA	2	8	31317	31324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017078	AGG	2	6	31337	31342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017078	ATC	2	6	31374	31379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017078	AAG	2	6	31394	31399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017078	TCA	2	6	33269	33274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017078	TAC	2	6	33284	33289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017078	TCAAG	2	10	33302	33311	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017078	GGA	2	6	33322	33327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017078	TTG	2	6	33328	33333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017078	AAG	2	6	33871	33876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017078	T	6	6	33881	33886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017078	CAGGA	2	10	33889	33898	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017078	ATA	2	6	34216	34221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017078	GCC	2	6	34224	34229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017078	CCT	2	6	34559	34564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017078	AAT	2	6	34575	34580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017078	TCTA	2	8	34613	34620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017078	ATATC	2	10	34624	34633	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017078	GTT	2	6	34657	34662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017078	A	6	6	34664	34669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017078	ATT	2	6	34739	34744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017078	CTGGG	2	10	34751	34760	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017078	AAG	2	6	34837	34842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017078	GCA	2	6	34891	34896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017078	G	6	6	34907	34912	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017078	GGT	2	6	35424	35429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017078	TAA	2	6	35970	35975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017078	TCCTG	2	10	35984	35993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017078	A	6	6	36070	36075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017078	AGCC	2	8	36077	36084	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017078	GT	3	6	37437	37442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017078	ATA	2	6	37480	37485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017078	AAT	2	6	37498	37503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017078	AGG	2	6	37508	37513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017078	T	7	7	37588	37594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017078	TGAA	2	8	37650	37657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017078	AGCTC	2	10	39305	39314	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017078	GTG	2	6	39368	39373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017078	AGGA	2	8	39397	39404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017078	TCA	2	6	43082	43087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017078	T	6	6	43168	43173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017078	AT	3	6	43179	43184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017078	GGA	2	6	43256	43261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017078	AGG	2	6	43930	43935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017078	T	7	7	45613	45619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017078	ATA	2	6	45654	45659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017078	ATC	2	6	45662	45667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017078	A	7	7	45668	45674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017078	GAG	2	6	45701	45706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017078	CTG	2	6	46707	46712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017078	TTAT	2	8	46716	46723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017078	ATA	2	6	46986	46991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017078	AGG	2	6	47014	47019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_017078	T	7	7	49138	49144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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