MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC7

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017077	AAT	2	6	1288	1293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017077	AGCA	2	8	1304	1311	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017077	TTGCT	2	10	1354	1363	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017077	GCT	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017077	GA	3	6	1442	1447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017077	GA	3	6	1463	1468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017077	GA	3	6	1496	1501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017077	GA	3	6	1517	1522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017077	GA	3	6	1548	1553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017077	GA	3	6	1568	1573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017077	ACAT	2	8	1591	1598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017077	GA	3	6	1631	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017077	ATT	2	6	1659	1664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017077	ACA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017077	AGA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017077	AGGG	2	8	3353	3360	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017077	T	6	6	3372	3377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017077	TACA	2	8	3389	3396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017077	GGA	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017077	CCG	2	6	8553	8558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017077	A	6	6	8561	8566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017077	GAGG	2	8	9622	9629	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017077	GGGA	2	8	9635	9642	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017077	TGG	2	6	9664	9669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017077	GTT	2	6	9671	9676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017077	ATT	2	6	9702	9707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017077	C	6	6	9719	9724	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_017077	G	6	6	9733	9738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017077	GCA	2	6	9754	9759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017077	GCC	2	6	12284	12289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017077	TAT	2	6	12292	12297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017077	ACT	2	6	12411	12416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017077	GGT	2	6	12506	12511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017077	ACC	2	6	23904	23909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017077	ATCT	2	8	23978	23985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017077	TGT	2	6	26964	26969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017077	TAT	2	6	27019	27024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017077	CTC	2	6	27064	27069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017077	AAG	2	6	27085	27090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017077	T	6	6	27888	27893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017077	ATCT	2	8	27912	27919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017077	AT	3	6	27938	27943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017077	TAT	2	6	28017	28022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017077	CTA	2	6	28104	28109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017077	TAT	2	6	29087	29092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017077	TA	3	6	29109	29114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017077	TTTTA	2	10	29515	29524	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017077	ATT	2	6	29562	29567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017077	T	6	6	29566	29571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017077	TATAA	2	10	29574	29583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017077	ATAA	2	8	29587	29594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017077	TAT	2	6	29597	29602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017077	TA	3	6	29628	29633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017077	TA	3	6	29655	29660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017077	GTA	2	6	29738	29743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.