MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 7136

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017068	TAT	2	6	57	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017068	TTG	2	6	75	80	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017068	GGA	2	6	118	123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017068	ATA	2	6	196	201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017068	A	7	7	228	234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017068	ATGTC	2	10	1873	1882	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017068	CTA	4	12	1909	1920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017068	TATT	2	8	1925	1932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017068	TA	3	6	1933	1938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017068	A	7	7	1955	1961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017068	T	6	6	7743	7748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017068	GTTC	2	8	14587	14594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017068	TGGC	2	8	14596	14603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017068	GGC	2	6	14606	14611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017068	GTG	2	6	14616	14621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017068	AAT	2	6	14651	14656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017068	ATT	2	6	14740	14745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017068	ACC	2	6	14782	14787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017068	GCC	2	6	14791	14796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017068	TTG	2	6	14823	14828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017068	GTA	2	6	14835	14840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017068	T	6	6	14953	14958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017068	AGG	2	6	14993	14998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017068	AAGG	2	8	16885	16892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017068	GTT	2	6	18427	18432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017068	TTTC	2	8	18453	18460	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017068	CTT	2	6	18547	18552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017068	TCT	2	6	18570	18575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017068	ATA	2	6	18589	18594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017068	CCG	2	6	18606	18611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017068	ATA	2	6	18629	18634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017068	CAA	2	6	18671	18676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017068	GCT	2	6	18720	18725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017068	TTG	2	6	18736	18741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017068	TTC	2	6	18766	18771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017068	AAC	2	6	18772	18777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017068	ATG	2	6	18802	18807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017068	ATT	2	6	18862	18867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017068	ATAA	2	8	18952	18959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017068	ATT	2	6	19134	19139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017068	GAA	2	6	19209	19214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017068	A	7	7	20795	20801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017068	GCC	2	6	21495	21500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017068	ACA	3	9	21517	21525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017068	GTT	2	6	21537	21542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017068	ACA	2	6	21559	21564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017068	A	6	6	21586	21591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017068	A	6	6	23648	23653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017068	T	7	7	23673	23679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017068	A	6	6	25391	25396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017068	ATA	2	6	25404	25409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017068	TAT	2	6	25420	25425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017068	TAA	2	6	25466	25471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017068	A	6	6	25473	25478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017068	ATA	2	6	25493	25498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017068	GGT	2	6	26506	26511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017068	AGGA	2	8	28074	28081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017068	TGT	3	9	31046	31054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017068	GAT	2	6	31074	31079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017068	G	6	6	33318	33323	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017068	T	6	6	34310	34315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017068	GCC	2	6	36904	36909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017068	GCC	2	6	36915	36920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017068	T	6	6	36936	36941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017068	T	6	6	36978	36983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017068	AGT	2	6	37012	37017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017068	ACA	2	6	37018	37023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017068	TCAT	2	8	37030	37037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017068	AT	3	6	37060	37065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017068	T	6	6	37147	37152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017068	TAA	2	6	37167	37172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017068	ATC	2	6	39691	39696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017068	TTG	2	6	39710	39715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017068	TTA	2	6	39723	39728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017068	GTA	2	6	39748	39753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017068	AGG	2	6	39766	39771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017068	A	6	6	40298	40303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017068	T	6	6	40340	40345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017068	GA	3	6	41682	41687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017068	TA	3	6	41688	41693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017068	AT	3	6	41705	41710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017068	CTG	2	6	41819	41824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017068	GATA	2	8	41883	41890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017068	CTT	2	6	43168	43173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017068	TACA	2	8	43201	43208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017068	TAA	2	6	43209	43214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017068	AAAG	2	8	43253	43260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017068	T	6	6	43786	43791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017068	A	6	6	43824	43829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017068	AT	3	6	43889	43894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017068	CA	3	6	43957	43962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017068	TGC	2	6	43963	43968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017068	TA	3	6	43970	43975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017068	ATT	2	6	44033	44038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017068	CAG	2	6	44081	44086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017068	ATT	2	6	44131	44136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017068	TGA	2	6	44154	44159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017068	ATTTT	2	10	44846	44855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017068	T	6	6	44852	44857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017068	AAGT	2	8	44896	44903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017068	CTTT	2	8	45370	45377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017068	AT	3	6	45380	45385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017068	GAAA	2	8	45389	45396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017068	CCT	2	6	47189	47194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017068	AGC	2	6	47209	47214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017068	TCA	2	6	47215	47220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017068	GCT	2	6	47234	47239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017068	TC	3	6	49168	49173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017068	A	7	7	49180	49186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017068	ATG	2	6	49195	49200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017068	TA	3	6	50910	50915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017068	AGTC	2	8	50928	50935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017068	TCAA	2	8	50940	50947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017068	A	6	6	50955	50960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017068	A	6	6	51040	51045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017068	AT	3	6	51058	51063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017068	AT	3	6	51074	51079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017068	CTT	2	6	53220	53225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017068	CCT	2	6	53805	53810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017068	CTG	2	6	53853	53858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017068	ATT	2	6	53873	53878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017068	A	6	6	55720	55725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017068	A	7	7	55753	55759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017068	ATG	2	6	55792	55797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017068	AG	3	6	55862	55867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017068	GAAA	2	8	55870	55877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017068	GAT	2	6	56190	56195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017068	GTG	2	6	56225	56230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017068	CTT	2	6	57312	57317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017068	TTC	2	6	58663	58668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017068	ATA	2	6	58679	58684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017068	A	6	6	58757	58762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017068	TTA	2	6	58776	58781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017068	TCC	2	6	60201	60206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017068	TTA	2	6	62105	62110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017068	AAT	2	6	62370	62375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017068	T	6	6	63506	63511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017068	A	6	6	64252	64257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017068	ACC	2	6	65324	65329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017068	AGG	2	6	65382	65387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017068	CAG	2	6	65394	65399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017068	ATA	2	6	66057	66062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017068	AGG	2	6	69092	69097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017068	TG	3	6	69118	69123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017068	T	6	6	69128	69133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017068	ACA	3	9	69151	69159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017068	TAA	2	6	69163	69168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017068	TAA	2	6	69198	69203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017068	A	6	6	69202	69207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017068	TGG	2	6	69230	69235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_017068	CGG	2	6	71016	71021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_017068	AT	3	6	75596	75601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_017068	TTA	2	6	132286	132291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017068	TGG	2	6	132295	132300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017068	CGCTT	2	10	132334	132343	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
284	NC_017068	GGT	2	6	132370	132375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017068	AATC	2	8	133149	133156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
286	NC_017068	TAC	2	6	133173	133178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_017068	AAT	2	6	133572	133577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_017068	TTA	2	6	133623	133628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_017068	T	6	6	157030	157035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_017068	AAAT	2	8	157052	157059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_017068	GAT	2	6	157078	157083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_017068	ATA	2	6	157118	157123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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