MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 7136

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017068	AAT	2	6	2094085	2094090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017068	ATTT	2	8	2095052	2095059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017068	TAT	2	6	2095071	2095076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017068	GAC	2	6	2095083	2095088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_017068	GCC	2	6	2095108	2095113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_017068	A	6	6	2095133	2095138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017068	TTA	2	6	2097961	2097966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017068	TGT	2	6	2098006	2098011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017068	AC	3	6	2099694	2099699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_017068	A	8	8	2099715	2099722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017068	CTG	2	6	2100153	2100158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017068	ATG	2	6	2102615	2102620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017068	TTC	2	6	2102633	2102638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_017068	ATA	2	6	2102647	2102652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017068	A	6	6	2102670	2102675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017068	TTA	2	6	2102676	2102681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017068	A	8	8	2102681	2102688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017068	CA	3	6	2106328	2106333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_017068	TAT	2	6	2106339	2106344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017068	CCG	2	6	2106348	2106353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_017068	AAAACG	2	12	2106370	2106381	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5022	NC_017068	AAT	2	6	2106410	2106415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017068	GCA	2	6	2106437	2106442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_017068	ATTT	2	8	2106445	2106452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017068	CTG	2	6	2106513	2106518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_017068	ATTG	2	8	2106520	2106527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017068	TAAA	2	8	2106860	2106867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017068	A	6	6	2106865	2106870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017068	TAT	2	6	2106871	2106876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017068	A	6	6	2106881	2106886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017068	CGAA	2	8	2106975	2106982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_017068	GC	3	6	2106983	2106988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_017068	AAT	2	6	2107017	2107022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017068	T	8	8	2107055	2107062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017068	TAT	2	6	2107068	2107073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017068	TCC	2	6	2108313	2108318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_017068	ACCTC	2	10	2109308	2109317	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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5039	NC_017068	CAGA	2	8	2109329	2109336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_017068	T	6	6	2109373	2109378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017068	CCTG	2	8	2109379	2109386	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_017068	TCC	2	6	2109950	2109955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_017068	CCTG	2	8	2110011	2110018	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_017068	TG	3	6	2110059	2110064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017068	CCCG	2	8	2111211	2111218	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5049	NC_017068	TACCGT	2	12	2111307	2111318	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5052	NC_017068	AATG	2	8	2111448	2111455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017068	TGA	2	6	2111587	2111592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5058	NC_017068	CATC	2	8	2111999	2112006	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5061	NC_017068	ACA	2	6	2112160	2112165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_017068	CTA	2	6	2112216	2112221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5064	NC_017068	ATT	2	6	2112244	2112249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017068	CA	3	6	2112284	2112289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_017068	TAT	2	6	2112320	2112325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017068	ATG	2	6	2113806	2113811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017068	ATT	2	6	2113829	2113834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017068	TAA	2	6	2113842	2113847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017068	A	7	7	2113846	2113852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5075	NC_017068	TAT	2	6	2119307	2119312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_017068	TCCC	2	8	2127630	2127637	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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5083	NC_017068	CCTG	2	8	2128379	2128386	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_017068	ATTCT	2	10	2128402	2128411	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5088	NC_017068	CTG	2	6	2133212	2133217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_017068	A	7	7	2133218	2133224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017068	A	8	8	2133229	2133236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017068	CGAA	2	8	2133295	2133302	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5098	NC_017068	ATCAA	2	10	2133787	2133796	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5099	NC_017068	ATG	2	6	2133823	2133828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5104	NC_017068	ACAT	2	8	2138728	2138735	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_017068	CA	4	8	2144271	2144278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5109	NC_017068	TA	4	8	2148148	2148155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017068	CTG	2	6	2148167	2148172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_017068	AAT	2	6	2148178	2148183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017068	CA	3	6	2148234	2148239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_017068	TTTC	2	8	2148645	2148652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_017068	AGAA	2	8	2148701	2148708	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017068	AAT	2	6	2149233	2149238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017068	CAT	2	6	2149239	2149244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5123	NC_017068	TA	3	6	2149562	2149567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017068	CAGG	2	8	2149623	2149630	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5125	NC_017068	T	6	6	2149631	2149636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017068	TA	3	6	2149667	2149672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017068	G	6	6	2149687	2149692	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5129	NC_017068	TCG	2	6	2151377	2151382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_017068	T	6	6	2151403	2151408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_017068	ATT	2	6	2152265	2152270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_017068	TTG	2	6	2152290	2152295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_017068	GCAA	2	8	2152372	2152379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5134	NC_017068	AGGC	2	8	2152385	2152392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5135	NC_017068	GTCA	2	8	2152409	2152416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5136	NC_017068	ACT	2	6	2152458	2152463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5137	NC_017068	AC	3	6	2152475	2152480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5138	NC_017068	GTC	2	6	2152539	2152544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5139	NC_017068	TACA	2	8	2153692	2153699	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5140	NC_017068	ACA	2	6	2153747	2153752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5141	NC_017068	GCC	2	6	2153782	2153787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5142	NC_017068	CAT	3	9	2154047	2154055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5143	NC_017068	CCTT	2	8	2155921	2155928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5144	NC_017068	ATAC	2	8	2156809	2156816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5145	NC_017068	TAT	2	6	2162956	2162961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_017068	CCT	2	6	2165616	2165621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5147	NC_017068	TAC	2	6	2166419	2166424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5148	NC_017068	AG	3	6	2166432	2166437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_017068	CT	3	6	2166447	2166452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5150	NC_017068	T	6	6	2166480	2166485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_017068	GCC	2	6	2166490	2166495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5152	NC_017068	CTG	2	6	2166520	2166525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5153	NC_017068	CGCAG	2	10	2168621	2168630	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5154	NC_017068	TTAT	2	8	2168668	2168675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_017068	ATA	2	6	2171552	2171557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5156	NC_017068	ATTT	2	8	2171612	2171619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_017068	TGA	2	6	2171683	2171688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5159	NC_017068	AGG	2	6	2171731	2171736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5160	NC_017068	TA	3	6	2172307	2172312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5161	NC_017068	CA	3	6	2172317	2172322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5162	NC_017068	A	7	7	2175619	2175625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5164	NC_017068	AAAAG	2	10	2177287	2177296	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5167	NC_017068	TAATA	2	10	2177415	2177424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5168	NC_017068	T	6	6	2177452	2177457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5169	NC_017068	T	6	6	2177462	2177467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5170	NC_017068	CTT	2	6	2178781	2178786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5172	NC_017068	AAAAT	2	10	2181372	2181381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_017068	TGC	2	6	2181391	2181396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5176	NC_017068	CCT	2	6	2184528	2184533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5178	NC_017068	ATA	2	6	2186330	2186335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5179	NC_017068	ACC	2	6	2188421	2188426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5181	NC_017068	A	6	6	2188491	2188496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5182	NC_017068	ATCA	2	8	2188521	2188528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5185	NC_017068	TAT	2	6	2190265	2190270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5187	NC_017068	A	6	6	2190325	2190330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5188	NC_017068	T	8	8	2190348	2190355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5198	NC_017068	CG	3	6	2190996	2191001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5232	NC_017068	TC	3	6	2193493	2193498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5253	NC_017068	GACT	2	8	2194494	2194501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5267	NC_017068	ATT	2	6	2195246	2195251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5270	NC_017068	T	6	6	2195372	2195377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5275	NC_017068	T	6	6	2195504	2195509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5383	NC_017068	TTATT	2	10	2259985	2259994	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5387	NC_017068	A	6	6	2260076	2260081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5388	NC_017068	CCT	2	6	2262154	2262159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5394	NC_017068	TCTAT	2	10	2265008	2265017	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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