MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 6242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017053	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017053	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017053	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017053	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017053	ACTA	2	8	147	154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017053	AAG	2	6	217	222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017053	AAC	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017053	TC	3	6	1656	1661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017053	TA	3	6	1682	1687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017053	CTA	4	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017053	TTA	3	9	1709	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017053	TTA	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017053	T	7	7	2904	2910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017053	TTA	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017053	ATA	2	6	2930	2935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017053	TAAA	2	8	3160	3167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017053	A	6	6	3202	3207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017053	AGA	2	6	3253	3258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017053	AAT	2	6	3331	3336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017053	TCT	2	6	3403	3408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017053	TCT	2	6	3426	3431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017053	T	6	6	3433	3438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017053	TAA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017053	TTGA	2	8	3451	3458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017053	GAA	2	6	4624	4629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017053	AAC	2	6	8750	8755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017053	GAAC	2	8	8785	8792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017053	TGC	2	6	8829	8834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017053	A	6	6	8860	8865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017053	A	6	6	14789	14794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017053	T	6	6	14820	14825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017053	GAT	2	6	14890	14895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017053	T	7	7	14900	14906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017053	TTA	2	6	14909	14914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017053	A	6	6	14970	14975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017053	AAT	2	6	14995	15000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017053	AGA	2	6	15001	15006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017053	AGA	2	6	15009	15014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017053	ACTA	2	8	15060	15067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017053	TAG	2	6	15077	15082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017053	ATA	2	6	16510	16515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017053	ACATT	2	10	16523	16532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017053	AGT	2	6	16560	16565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017053	TACT	2	8	16578	16585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017053	AT	3	6	16691	16696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017053	A	6	6	16710	16715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017053	A	7	7	16793	16799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017053	TAA	2	6	16832	16837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017053	AAAT	2	8	17021	17028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017053	AG	3	6	17072	17077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017053	GGC	2	6	17104	17109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017053	ACCT	2	8	17195	17202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017053	CGA	2	6	17349	17354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017053	GCA	2	6	17423	17428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017053	CGC	2	6	17470	17475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017053	GTGA	2	8	17476	17483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017053	TGT	2	6	17509	17514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017053	AGA	2	6	17518	17523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017053	ATG	2	6	17524	17529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017053	CCA	2	6	17545	17550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017053	TAAC	2	8	17559	17566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017053	CAG	2	6	17592	17597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017053	AGCG	2	8	17647	17654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017053	T	6	6	17662	17667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017053	AT	3	6	17776	17781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017053	GGA	2	6	17782	17787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017053	CT	3	6	17807	17812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017053	GAA	2	6	18046	18051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017053	GGT	2	6	18120	18125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017053	GTC	2	6	18134	18139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017053	TCGTG	2	10	18143	18152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017053	CAT	2	6	18202	18207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017053	TAA	2	6	18237	18242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017053	GGA	2	6	18246	18251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017053	ATC	2	6	18270	18275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017053	AC	3	6	18297	18302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017053	TGGT	2	8	18312	18319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017053	CGC	2	6	18436	18441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017053	AC	3	6	18466	18471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017053	CAC	2	6	18481	18486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017053	AGCC	2	8	18529	18536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017053	GAT	2	6	18552	18557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017053	CCT	2	6	18608	18613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017053	AGG	2	6	18707	18712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017053	CTA	2	6	18753	18758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017053	TG	3	6	18821	18826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017053	AGCG	2	8	18875	18882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017053	TA	3	6	18896	18901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017053	TAA	2	6	19001	19006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017053	A	7	7	19019	19025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017053	TAA	2	6	19032	19037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017053	GTTAA	2	10	19039	19048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017053	GAA	2	6	19085	19090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017053	ACG	2	6	19102	19107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017053	GTAA	2	8	19125	19132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017053	ACTA	2	8	19167	19174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017053	GAAG	2	8	19207	19214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017053	TAG	2	6	19273	19278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017053	GCGA	2	8	19281	19288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017053	AGA	2	6	19361	19366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017053	AG	3	6	19389	19394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017053	GGA	2	6	19477	19482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017053	CT	3	6	19503	19508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017053	GGGAG	2	10	19558	19567	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017053	ACA	2	6	19595	19600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017053	ATG	2	6	19662	19667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017053	TGT	2	6	19732	19737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017053	GGA	2	6	19795	19800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017053	TC	3	6	19881	19886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017053	ATC	2	6	20002	20007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017053	ACC	2	6	20060	20065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017053	AGC	2	6	20140	20145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017053	ATTC	2	8	20147	20154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017053	TG	3	6	20271	20276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017053	AAG	2	6	20277	20282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017053	GAG	2	6	20292	20297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017053	GA	3	6	20422	20427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017053	TA	3	6	20476	20481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017053	CTAA	2	8	20503	20510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017053	TAG	2	6	20605	20610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017053	GA	3	6	20718	20723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017053	CT	3	6	20833	20838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017053	GAT	2	6	20851	20856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017053	AGG	2	6	20896	20901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017053	CGG	2	6	20942	20947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017053	GA	3	6	21040	21045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017053	TAGG	2	8	21158	21165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017053	GTT	2	6	21202	21207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017053	TAC	2	6	21212	21217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017053	CCT	2	6	21300	21305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017053	TTGG	2	8	21341	21348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017053	AATC	2	8	21350	21357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017053	GGT	2	6	21436	21441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017053	TCG	2	6	21551	21556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017053	CGT	2	6	21631	21636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017053	AGGGA	2	10	21769	21778	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017053	C	6	6	21807	21812	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
138	NC_017053	GA	3	6	21855	21860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017053	AGTGTA	2	12	21882	21893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017053	ACTAAT	2	12	21910	21921	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017053	CAG	2	6	22072	22077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017053	GCTTA	2	10	22135	22144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017053	AC	3	6	22148	22153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017053	AGT	2	6	22329	22334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017053	T	6	6	22339	22344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017053	CGT	2	6	22669	22674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017053	GAG	2	6	22683	22688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017053	T	6	6	22777	22782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017053	CTC	2	6	22848	22853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_017053	CGC	2	6	23014	23019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_017053	TAT	2	6	23020	23025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017053	ATT	2	6	23130	23135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017053	GGA	2	6	23138	23143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017053	GCGT	2	8	23197	23204	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_017053	TCC	2	6	23221	23226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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157	NC_017053	GTT	2	6	23325	23330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017053	CGG	2	6	23378	23383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017053	TGT	2	6	23455	23460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017053	GGT	2	6	23535	23540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017053	GGT	2	6	23570	23575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017053	AT	4	8	23594	23601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017053	TAAA	2	8	23748	23755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_017053	ATT	2	6	23827	23832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_017053	CTTTT	3	15	24072	24086	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_017053	GTTA	2	8	24093	24100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017053	TAT	2	6	24130	24135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017053	TGA	2	6	24136	24141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017053	A	7	7	24724	24730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017053	TAA	2	6	24753	24758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017053	A	6	6	24769	24774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017053	ATA	2	6	24817	24822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_017053	T	7	7	25188	25194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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