MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017046	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017046	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017046	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017046	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017046	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017046	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017046	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017046	T	8	8	303	310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017046	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017046	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017046	A	7	7	5924	5930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017046	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017046	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017046	GGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017046	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017046	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017046	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017046	CCTTC	2	10	8674	8683	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_017046	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017046	TAG	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017046	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017046	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017046	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017046	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017046	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017046	GAAAA	2	10	10061	10070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017046	TCTTT	2	10	11322	11331	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017046	TTA	2	6	11332	11337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017046	ATTTA	2	10	11364	11373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017046	TCTG	2	8	11389	11396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017046	A	6	6	11423	11428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017046	T	6	6	11429	11434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017046	TGA	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017046	GTG	2	6	11486	11491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017046	A	8	8	11498	11505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017046	TTA	2	6	11540	11545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017046	ATG	2	6	11561	11566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017046	TTC	2	6	14753	14758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017046	T	6	6	14780	14785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017046	TTG	2	6	14834	14839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017046	CAG	2	6	14877	14882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017046	A	7	7	14904	14910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017046	GTGAT	2	10	14912	14921	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017046	T	6	6	14937	14942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017046	TAT	2	6	14970	14975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017046	T	7	7	14985	14991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017046	ATG	2	6	16001	16006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017046	CCT	2	6	16022	16027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017046	ATT	2	6	16055	16060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017046	T	6	6	16478	16483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017046	TATTG	2	10	17576	17585	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017046	ATT	2	6	17612	17617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017046	GTT	2	6	17704	17709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017046	GTT	2	6	17728	17733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017046	ATC	2	6	17757	17762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017046	GAT	2	6	17769	17774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017046	T	6	6	17791	17796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017046	CCA	2	6	20031	20036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017046	TTA	2	6	23166	23171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017046	TCTTAA	2	12	23203	23214	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017046	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017046	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017046	GTT	2	6	24116	24121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017046	ACA	2	6	24195	24200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017046	GAT	2	6	24232	24237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017046	TAA	2	6	24259	24264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017046	TAA	2	6	24266	24271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017046	ACG	2	6	24306	24311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017046	AAG	2	6	24353	24358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017046	T	7	7	24363	24369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017046	GAA	2	6	24399	24404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017046	CAG	2	6	24409	24414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017046	A	6	6	24425	24430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017046	TGAA	2	8	24466	24473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017046	T	7	7	25025	25031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017046	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017046	GT	3	6	33041	33046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017046	ATA	2	6	33134	33139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017046	T	6	6	33146	33151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017046	T	6	6	33154	33159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017046	T	6	6	33186	33191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017046	CAT	2	6	33201	33206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017046	TTTTA	2	10	33211	33220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017046	TAA	2	6	33255	33260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017046	GTG	2	6	33300	33305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017046	ATG	2	6	33327	33332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017046	CCAG	2	8	33346	33353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017046	ATA	3	9	34849	34857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017046	T	6	6	34903	34908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017046	ATCGT	2	10	34918	34927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017046	ATG	2	6	34937	34942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017046	T	6	6	34944	34949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017046	ATTTT	2	10	34962	34971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017046	TAG	2	6	34995	35000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017046	TGAT	2	8	35032	35039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017046	TTG	2	6	35043	35048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017046	AAT	2	6	35055	35060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017046	A	6	6	35093	35098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017046	TAG	2	6	35152	35157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017046	TTTTA	2	10	35223	35232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017046	ATT	2	6	35234	35239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017046	TTG	2	6	35253	35258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017046	TGT	2	6	35292	35297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017046	TCA	2	6	38754	38759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017046	ATTA	2	8	38765	38772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017046	TGT	2	6	39567	39572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017046	AAG	2	6	39576	39581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017046	TGT	2	6	39672	39677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017046	TTA	2	6	39678	39683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017046	TGT	2	6	39717	39722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017046	AAT	2	6	39768	39773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017046	AT	3	6	39831	39836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017046	T	7	7	39904	39910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017046	AT	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017046	AAT	2	6	39980	39985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017046	GAA	2	6	40011	40016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017046	AT	5	10	40033	40042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017046	AATT	2	8	40048	40055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017046	AT	3	6	40089	40094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017046	TGAAA	2	10	40127	40136	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017046	AAT	2	6	41628	41633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017046	A	6	6	41637	41642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017046	GTA	2	6	42916	42921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017046	TAAAA	2	10	44191	44200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017046	TGA	2	6	44205	44210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017046	GTT	2	6	44214	44219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017046	ATC	2	6	46034	46039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017046	TGAC	2	8	46042	46049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017046	A	6	6	46056	46061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017046	A	7	7	46090	46096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017046	TCA	2	6	46105	46110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017046	TA	3	6	46111	46116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017046	TAG	2	6	46151	46156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017046	GAA	2	6	46161	46166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017046	GA	3	6	46178	46183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017046	GA	3	6	47412	47417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017046	TACC	2	8	48322	48329	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017046	TAA	2	6	51313	51318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017046	ATT	2	6	51895	51900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017046	AGTA	2	8	51938	51945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017046	AGT	2	6	51960	51965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017046	ATCA	2	8	51978	51985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017046	ATT	2	6	51986	51991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017046	TTA	2	6	52014	52019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017046	GGT	2	6	52052	52057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017046	T	6	6	52063	52068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017046	GAAA	2	8	52098	52105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017046	AGGG	2	8	52131	52138	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017046	GC	3	6	52513	52518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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289	NC_017046	GTTT	2	8	88259	88266	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_017046	CAGG	2	8	138141	138148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
433	NC_017046	CCCAA	2	10	138180	138189	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
434	NC_017046	ATC	2	6	138191	138196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_017046	T	7	7	139750	139756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_017046	T	6	6	139838	139843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_017046	CAG	2	6	141352	141357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_017046	CCG	2	6	156883	156888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
462	NC_017046	CT	3	6	157897	157902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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