MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017046	GTT	2	6	1051350	1051355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017046	TGA	2	6	1051366	1051371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017046	GGC	2	6	1051378	1051383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017046	GCCGC	2	10	1051403	1051412	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3005	NC_017046	TGA	2	6	1051482	1051487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017046	TTA	2	6	1051551	1051556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017046	A	6	6	1051633	1051638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017046	ATA	2	6	1051643	1051648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017046	T	6	6	1051670	1051675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017046	ATA	2	6	1051682	1051687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017046	GTT	2	6	1051784	1051789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017046	ATT	2	6	1051822	1051827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017046	AATT	2	8	1051842	1051849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017046	AGA	2	6	1053332	1053337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017046	AAC	2	6	1054626	1054631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_017046	TGG	2	6	1056468	1056473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017046	ACT	2	6	1056482	1056487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_017046	ATG	2	6	1056568	1056573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017046	CGC	2	6	1056574	1056579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_017046	CCT	2	6	1056647	1056652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_017046	AT	3	6	1060782	1060787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017046	GTT	2	6	1060791	1060796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017046	ATGG	2	8	1060862	1060869	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017046	AGC	2	6	1060956	1060961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_017046	TTA	2	6	1061052	1061057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017046	TTTCA	2	10	1061153	1061162	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3027	NC_017046	CTA	2	6	1061173	1061178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_017046	CAG	2	6	1061358	1061363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_017046	GGC	2	6	1061372	1061377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_017046	CTG	2	6	1061412	1061417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_017046	ATCA	2	8	1061439	1061446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_017046	TTG	2	6	1061509	1061514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017046	T	6	6	1061644	1061649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017046	GTT	2	6	1061674	1061679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017046	CAG	2	6	1061683	1061688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_017046	GGA	2	6	1061700	1061705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017046	GGA	2	6	1061718	1061723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017046	TTGA	2	8	1061752	1061759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017046	TCT	2	6	1061777	1061782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_017046	TCA	2	6	1061786	1061791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_017046	GAA	2	6	1061848	1061853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017046	CCG	2	6	1061877	1061882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_017046	TG	3	6	1061944	1061949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017046	GATT	2	8	1062098	1062105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017046	TTG	2	6	1062107	1062112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017046	AAAATC	2	12	1062186	1062197	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3047	NC_017046	TCC	2	6	1062284	1062289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_017046	CTC	2	6	1062334	1062339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_017046	CAG	2	6	1062352	1062357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_017046	ACCCAA	2	12	1062361	1062372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_017046	CCAAG	2	10	1062384	1062393	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3052	NC_017046	CCA	2	6	1062460	1062465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_017046	AG	3	6	1062486	1062491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017046	GCA	2	6	1062756	1062761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_017046	GGTA	2	8	1062818	1062825	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017046	TCA	2	6	1064997	1065002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_017046	GAA	2	6	1065045	1065050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017046	CAG	2	6	1065253	1065258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_017046	AAAGCA	2	12	1065259	1065270	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3060	NC_017046	TTA	2	6	1065271	1065276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017046	TGT	2	6	1065298	1065303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017046	ATT	2	6	1065306	1065311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017046	TGA	2	6	1065312	1065317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017046	GAA	2	6	1065356	1065361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017046	TAA	2	6	1065418	1065423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017046	GCA	2	6	1065625	1065630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_017046	AT	3	6	1065667	1065672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017046	AAG	2	6	1065695	1065700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017046	TGAA	2	8	1065712	1065719	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017046	CCG	2	6	1065727	1065732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_017046	GCG	2	6	1065763	1065768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_017046	T	6	6	1065771	1065776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017046	ACA	2	6	1065796	1065801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_017046	TTCT	2	8	1065841	1065848	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_017046	TA	3	6	1065866	1065871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017046	GTT	2	6	1065874	1065879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017046	GC	3	6	1066147	1066152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3078	NC_017046	TGC	3	9	1066189	1066197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_017046	GT	3	6	1066219	1066224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017046	G	6	6	1066231	1066236	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017046	GAT	2	6	1066397	1066402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_017046	AG	3	6	1066439	1066444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017046	TAA	2	6	1066453	1066458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017046	AAC	2	6	1066504	1066509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_017046	CAT	2	6	1067171	1067176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3087	NC_017046	AAT	2	6	1068902	1068907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017046	TTA	2	6	1068959	1068964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017046	CCTCG	2	10	1068992	1069001	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3090	NC_017046	GTTTTT	2	12	1069007	1069018	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017046	T	8	8	1069014	1069021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017046	GGT	2	6	1069022	1069027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017046	G	7	7	1069052	1069058	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017046	GTC	2	6	1069104	1069109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_017046	GAG	2	6	1069132	1069137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017046	AG	3	6	1069160	1069165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017046	TCT	2	6	1069202	1069207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_017046	AAG	2	6	1069247	1069252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017046	CGG	2	6	1069330	1069335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_017046	CTTTTT	2	12	1069337	1069348	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3101	NC_017046	CAT	2	6	1069360	1069365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_017046	TCA	2	6	1069413	1069418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_017046	CA	3	6	1069417	1069422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_017046	A	6	6	1069528	1069533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017046	T	6	6	1069644	1069649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017046	GCC	2	6	1069672	1069677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_017046	TAC	2	6	1069745	1069750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_017046	TGGC	2	8	1069760	1069767	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_017046	C	6	6	1069821	1069826	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3110	NC_017046	GCT	2	6	1069842	1069847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_017046	CTG	2	6	1069870	1069875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_017046	GT	3	6	1069908	1069913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017046	TGTGG	2	10	1069992	1070001	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017046	CCG	2	6	1070036	1070041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_017046	CCGA	2	8	1070053	1070060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_017046	GTGG	2	8	1070067	1070074	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017046	CGA	2	6	1070126	1070131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_017046	CCTA	2	8	1070171	1070178	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_017046	TCT	2	6	1070181	1070186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_017046	TAT	2	6	1070225	1070230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017046	TTC	2	6	1070234	1070239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_017046	TTAA	2	8	1070260	1070267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017046	TAT	2	6	1070273	1070278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017046	AATA	2	8	1070299	1070306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017046	TCC	2	6	1070307	1070312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_017046	GGA	2	6	1070322	1070327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017046	TATT	2	8	1070328	1070335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017046	CA	3	6	1070361	1070366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_017046	CTG	2	6	1070448	1070453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_017046	TGT	2	6	1070487	1070492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_017046	T	6	6	1070512	1070517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3254	NC_017046	CTTT	2	8	1112719	1112726	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3255	NC_017046	ACG	2	6	1112752	1112757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3257	NC_017046	CGCTT	2	10	1112870	1112879	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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