MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 15617

< Previous12...20212223242526272829303132Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_017046	GCC	2	6	4835444	4835449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15502	NC_017046	TGG	2	6	4835461	4835466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_017046	CTGG	2	8	4835468	4835475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15504	NC_017046	CGGCG	2	10	4835485	4835494	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15505	NC_017046	TCG	3	9	4835505	4835513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15506	NC_017046	AT	3	6	4835579	4835584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_017046	A	7	7	4835660	4835666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_017046	GCC	2	6	4837541	4837546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15509	NC_017046	GGC	2	6	4839994	4839999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15510	NC_017046	GAA	2	6	4840033	4840038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_017046	CGG	2	6	4840049	4840054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_017046	CTGAT	2	10	4842441	4842450	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15513	NC_017046	ATT	2	6	4842453	4842458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_017046	TGT	2	6	4843713	4843718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_017046	TCG	2	6	4843798	4843803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_017046	AC	3	6	4843846	4843851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15517	NC_017046	GCC	2	6	4843876	4843881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15518	NC_017046	AAC	2	6	4843892	4843897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15519	NC_017046	ACC	2	6	4844957	4844962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15520	NC_017046	AAAAT	2	10	4844972	4844981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_017046	CCT	2	6	4845058	4845063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15522	NC_017046	ATC	2	6	4845104	4845109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15523	NC_017046	AGCC	2	8	4845117	4845124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15524	NC_017046	GAA	2	6	4845141	4845146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_017046	TCG	2	6	4845165	4845170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_017046	G	6	6	4845183	4845188	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_017046	AGT	2	6	4845189	4845194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_017046	ACA	2	6	4845206	4845211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15529	NC_017046	TGT	2	6	4849954	4849959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_017046	TAA	2	6	4849965	4849970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_017046	ATC	2	6	4849999	4850004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15532	NC_017046	TGA	2	6	4850010	4850015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_017046	ATA	2	6	4850057	4850062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_017046	TAG	2	6	4850079	4850084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_017046	AGTG	2	8	4850087	4850094	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_017046	TGT	2	6	4850135	4850140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_017046	ATA	2	6	4850150	4850155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_017046	TC	3	6	4850171	4850176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15539	NC_017046	ATT	2	6	4850181	4850186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_017046	TTA	2	6	4851224	4851229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_017046	CGA	2	6	4851812	4851817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_017046	ACAAT	2	10	4851833	4851842	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15543	NC_017046	CTG	2	6	4851892	4851897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15544	NC_017046	AGCGCC	2	12	4853008	4853019	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15545	NC_017046	TGTA	2	8	4854441	4854448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_017046	TGT	2	6	4854453	4854458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_017046	TGT	2	6	4854519	4854524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_017046	AAGCG	2	10	4854534	4854543	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15549	NC_017046	CAG	2	6	4854571	4854576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15550	NC_017046	AAGCGC	2	12	4855906	4855917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15551	NC_017046	CAGC	2	8	4857683	4857690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15552	NC_017046	A	6	6	4857713	4857718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_017046	GTTAT	2	10	4859759	4859768	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_017046	CGG	2	6	4859795	4859800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15555	NC_017046	CGC	2	6	4860178	4860183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15556	NC_017046	AAT	2	6	4860230	4860235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_017046	A	8	8	4860790	4860797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_017046	ATA	2	6	4862362	4862367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_017046	T	6	6	4862371	4862376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_017046	T	8	8	4862396	4862403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_017046	T	7	7	4862416	4862422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_017046	ATT	2	6	4862440	4862445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_017046	ATTTT	2	10	4862467	4862476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_017046	TAA	2	6	4862485	4862490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_017046	CTG	2	6	4865155	4865160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15566	NC_017046	GC	4	8	4866540	4866547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15567	NC_017046	CCA	2	6	4868280	4868285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15568	NC_017046	GTAAAA	2	12	4870845	4870856	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_017046	CCTG	2	8	4871596	4871603	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15570	NC_017046	TTG	2	6	4872177	4872182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_017046	ATAAA	2	10	4872218	4872227	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_017046	ATATT	2	10	4872228	4872237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_017046	CTT	2	6	4872252	4872257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15574	NC_017046	TCTGT	2	10	4872258	4872267	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15575	NC_017046	GGC	2	6	4872277	4872282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15576	NC_017046	TAA	2	6	4872369	4872374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_017046	AAG	2	6	4872385	4872390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15578	NC_017046	TGA	2	6	4872397	4872402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_017046	T	6	6	4872426	4872431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15580	NC_017046	ATA	2	6	4872433	4872438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_017046	TTA	2	6	4872440	4872445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_017046	GGA	2	6	4872452	4872457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_017046	TTTA	2	8	4872458	4872465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_017046	TAA	2	6	4872486	4872491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_017046	ACG	2	6	4872495	4872500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15586	NC_017046	ATT	2	6	4873191	4873196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_017046	CAA	2	6	4873281	4873286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15588	NC_017046	TGA	2	6	4873363	4873368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_017046	AGCGA	2	10	4873440	4873449	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15590	NC_017046	GGA	2	6	4873464	4873469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_017046	GA	3	6	4873477	4873482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_017046	GGCG	2	8	4873498	4873505	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15593	NC_017046	CGC	2	6	4873525	4873530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15594	NC_017046	CTC	2	6	4873540	4873545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15595	NC_017046	CGG	2	6	4873547	4873552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15596	NC_017046	GAT	2	6	4873601	4873606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_017046	TCA	2	6	4873643	4873648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15598	NC_017046	ATT	2	6	4873698	4873703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_017046	AGC	2	6	4873809	4873814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15600	NC_017046	TGA	2	6	4873824	4873829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_017046	AGC	2	6	4873856	4873861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15602	NC_017046	T	6	6	4873872	4873877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_017046	T	6	6	4873916	4873921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_017046	AGG	2	6	4874049	4874054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_017046	CCTG	2	8	4874918	4874925	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15606	NC_017046	CAA	2	6	4875006	4875011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15607	NC_017046	CAT	2	6	4875012	4875017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15608	NC_017046	TAA	2	6	4875123	4875128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_017046	AT	3	6	4875146	4875151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_017046	TGA	2	6	4875180	4875185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_017046	ATC	2	6	4875187	4875192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15612	NC_017046	TCA	2	6	4875211	4875216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15613	NC_017046	TAA	2	6	4875254	4875259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_017046	TGA	2	6	4875263	4875268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15615	NC_017046	TAAAT	2	10	4875291	4875300	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15616	NC_017046	TAAA	2	8	4875306	4875313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15617	NC_017046	ATA	2	6	4876204	4876209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...20212223242526272829303132Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.