MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017046	CGT	2	6	3434197	3434202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_017046	TCAT	2	8	3434209	3434216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11003	NC_017046	GCC	2	6	3434220	3434225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_017046	GAT	2	6	3434274	3434279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_017046	CTTT	2	8	3434296	3434303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11006	NC_017046	CGT	2	6	3434313	3434318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_017046	TCAT	2	8	3434325	3434332	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11008	NC_017046	GAT	2	6	3434390	3434395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_017046	CTTT	2	8	3434412	3434419	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11010	NC_017046	CGT	2	6	3434429	3434434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_017046	TCAT	2	8	3434441	3434448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11012	NC_017046	GCC	2	6	3434452	3434457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11013	NC_017046	CCG	2	6	3434474	3434479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11014	NC_017046	CTTT	2	8	3434520	3434527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11015	NC_017046	CGT	2	6	3434537	3434542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_017046	TCAT	2	8	3434549	3434556	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11017	NC_017046	GCC	2	6	3434560	3434565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11018	NC_017046	CCG	2	6	3434582	3434587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11019	NC_017046	GAA	2	6	3434601	3434606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_017046	TCAT	2	8	3434645	3434652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11021	NC_017046	AGC	2	6	3434680	3434685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_017046	CG	3	6	3434775	3434780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11023	NC_017046	CGG	2	6	3434835	3434840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_017046	CT	3	6	3434845	3434850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11025	NC_017046	C	7	7	3434871	3434877	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11026	NC_017046	TCC	2	6	3434917	3434922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11027	NC_017046	GAC	3	9	3434945	3434953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_017046	GCG	2	6	3434957	3434962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_017046	GC	3	6	3434981	3434986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11030	NC_017046	CG	3	6	3435000	3435005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11031	NC_017046	CGT	2	6	3436250	3436255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11032	NC_017046	GCC	2	6	3437984	3437989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11033	NC_017046	TAT	3	9	3438114	3438122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_017046	ATT	2	6	3438222	3438227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_017046	CA	3	6	3438273	3438278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11036	NC_017046	A	6	6	3438302	3438307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_017046	TAACCA	2	12	3438412	3438423	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11039	NC_017046	CCA	2	6	3440146	3440151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11040	NC_017046	ATTCAA	2	12	3440159	3440170	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11041	NC_017046	GCA	2	6	3440224	3440229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_017046	T	7	7	3442083	3442089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_017046	TCG	2	6	3442095	3442100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_017046	CAC	2	6	3442161	3442166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11045	NC_017046	ACAAA	2	10	3442241	3442250	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11046	NC_017046	TTTC	2	8	3442267	3442274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11047	NC_017046	TGA	2	6	3442304	3442309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_017046	TG	3	6	3442319	3442324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_017046	TTATTT	2	12	3442358	3442369	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_017046	TCC	2	6	3446445	3446450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11051	NC_017046	CGG	2	6	3446461	3446466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_017046	AC	3	6	3446504	3446509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11053	NC_017046	ACA	2	6	3446568	3446573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_017046	GAA	3	9	3446598	3446606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_017046	ATA	2	6	3448392	3448397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_017046	ATCA	2	8	3452140	3452147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11057	NC_017046	GTC	2	6	3453069	3453074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_017046	A	7	7	3453106	3453112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_017046	ATC	2	6	3456774	3456779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_017046	CAT	2	6	3457502	3457507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_017046	CCA	2	6	3457533	3457538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11062	NC_017046	GGA	2	6	3457543	3457548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_017046	GGC	2	6	3459916	3459921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_017046	CAA	2	6	3459928	3459933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_017046	ATT	2	6	3459955	3459960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_017046	GCA	2	6	3460005	3460010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_017046	GGC	2	6	3461964	3461969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_017046	AGCGC	2	10	3462017	3462026	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11069	NC_017046	AAC	2	6	3462073	3462078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_017046	TA	3	6	3463873	3463878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_017046	TATGA	2	10	3463885	3463894	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_017046	TTA	2	6	3463977	3463982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_017046	ATC	2	6	3463992	3463997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_017046	CT	4	8	3465838	3465845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11075	NC_017046	TC	3	6	3465868	3465873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11076	NC_017046	A	7	7	3465914	3465920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_017046	TTTAC	2	10	3465951	3465960	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11078	NC_017046	GGC	2	6	3467902	3467907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11082	NC_017046	CAA	2	6	3468991	3468996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_017046	CCAG	2	8	3469002	3469009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11084	NC_017046	CGT	2	6	3471224	3471229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_017046	TCT	2	6	3471240	3471245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_017046	AACCCT	2	12	3471268	3471279	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
11087	NC_017046	CG	3	6	3471305	3471310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11088	NC_017046	TCAT	2	8	3471329	3471336	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11089	NC_017046	CAA	2	6	3471339	3471344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_017046	TGC	2	6	3471365	3471370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11092	NC_017046	A	6	6	3471381	3471386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_017046	GGT	2	6	3471582	3471587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_017046	CGC	2	6	3471761	3471766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11095	NC_017046	AAT	2	6	3471778	3471783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_017046	GCG	2	6	3471798	3471803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_017046	CT	3	6	3471821	3471826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11098	NC_017046	A	6	6	3473216	3473221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_017046	ATC	2	6	3473286	3473291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_017046	CAA	2	6	3473311	3473316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_017046	GGC	2	6	3473317	3473322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_017046	GAGC	2	8	3473368	3473375	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11103	NC_017046	GAC	2	6	3473402	3473407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_017046	TTCC	2	8	3476096	3476103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11105	NC_017046	TTA	2	6	3476113	3476118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_017046	A	7	7	3478116	3478122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_017046	A	6	6	3478158	3478163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_017046	CGG	2	6	3478209	3478214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_017046	T	7	7	3478237	3478243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_017046	CGA	2	6	3478330	3478335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_017046	CGA	2	6	3478353	3478358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_017046	GCT	2	6	3478367	3478372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_017046	CTG	2	6	3478430	3478435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_017046	GGACG	2	10	3478450	3478459	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11115	NC_017046	ATGA	2	8	3478523	3478530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_017046	GAT	2	6	3478634	3478639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_017046	ATTT	2	8	3478653	3478660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_017046	TCAA	2	8	3478703	3478710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11119	NC_017046	TTCTA	2	10	3478717	3478726	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11120	NC_017046	T	6	6	3480107	3480112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_017046	ACT	2	6	3481269	3481274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_017046	ACT	2	6	3481333	3481338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_017046	GAT	2	6	3481355	3481360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_017046	AG	3	6	3481401	3481406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_017046	ACAT	2	8	3481408	3481415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11126	NC_017046	GTAT	2	8	3481418	3481425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_017046	CCT	2	6	3481486	3481491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11129	NC_017046	A	8	8	3481516	3481523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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