MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017046	CGC	3	9	3115124	3115132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10002	NC_017046	CAC	2	6	3115158	3115163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_017046	TTTAC	2	10	3115399	3115408	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10004	NC_017046	GATTAT	2	12	3115438	3115449	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_017046	TTG	2	6	3115463	3115468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_017046	CTG	2	6	3115585	3115590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_017046	AATT	2	8	3115613	3115620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_017046	CGA	2	6	3115674	3115679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_017046	AC	3	6	3115784	3115789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10010	NC_017046	AAC	2	6	3115795	3115800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_017046	TTTCG	2	10	3115812	3115821	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10012	NC_017046	CTG	2	6	3115830	3115835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_017046	CGT	2	6	3115859	3115864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_017046	CGTT	2	8	3115975	3115982	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10015	NC_017046	ATCGA	2	10	3116032	3116041	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10016	NC_017046	AAT	2	6	3116057	3116062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_017046	ATCGA	2	10	3116093	3116102	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10018	NC_017046	AAT	2	6	3116118	3116123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_017046	TCC	2	6	3116240	3116245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_017046	AC	3	6	3116333	3116338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10021	NC_017046	T	8	8	3116349	3116356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_017046	CCTGTT	2	12	3116357	3116368	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_017046	CGG	2	6	3116427	3116432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_017046	T	6	6	3116474	3116479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_017046	AGG	2	6	3116522	3116527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_017046	TAC	2	6	3116537	3116542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_017046	GTG	2	6	3116581	3116586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_017046	AAAT	2	8	3116592	3116599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_017046	GAG	2	6	3116653	3116658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_017046	AT	3	6	3116782	3116787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_017046	AC	3	6	3116821	3116826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10032	NC_017046	ACT	2	6	3116850	3116855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_017046	CAC	2	6	3116865	3116870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_017046	CAA	2	6	3116889	3116894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_017046	ATT	2	6	3116900	3116905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_017046	A	6	6	3116936	3116941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_017046	T	6	6	3116955	3116960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_017046	ATT	2	6	3117822	3117827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_017046	A	7	7	3117880	3117886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_017046	CCG	2	6	3117888	3117893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_017046	CCG	2	6	3119292	3119297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10042	NC_017046	T	6	6	3119305	3119310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_017046	ATT	2	6	3121037	3121042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_017046	CCT	2	6	3121043	3121048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_017046	CA	3	6	3121067	3121072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10046	NC_017046	GGGA	2	8	3121073	3121080	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_017046	A	6	6	3121136	3121141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_017046	CA	3	6	3121143	3121148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10049	NC_017046	TAT	2	6	3122015	3122020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_017046	TA	3	6	3122059	3122064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_017046	AT	3	6	3122070	3122075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_017046	ATT	2	6	3122119	3122124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_017046	ACA	2	6	3122134	3122139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_017046	ATA	2	6	3122142	3122147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_017046	A	7	7	3122167	3122173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_017046	A	7	7	3122215	3122221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_017046	CACCC	2	10	3122240	3122249	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
10058	NC_017046	A	8	8	3122267	3122274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_017046	ATT	2	6	3122278	3122283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_017046	A	6	6	3122330	3122335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_017046	T	6	6	3122342	3122347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_017046	T	6	6	3122349	3122354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_017046	ACAT	2	8	3122360	3122367	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_017046	AAAT	2	8	3122369	3122376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_017046	AT	3	6	3122375	3122380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_017046	ATA	2	6	3122395	3122400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_017046	ATA	2	6	3122460	3122465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_017046	TAT	2	6	3122470	3122475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_017046	GCA	2	6	3122498	3122503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_017046	TTAA	2	8	3122561	3122568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_017046	TTG	2	6	3122694	3122699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_017046	CT	3	6	3122710	3122715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10073	NC_017046	T	6	6	3122724	3122729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_017046	GAAAT	2	10	3123335	3123344	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_017046	GGC	2	6	3129851	3129856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_017046	GTC	2	6	3131027	3131032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_017046	AGA	2	6	3131068	3131073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_017046	CGT	2	6	3132422	3132427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_017046	TAA	2	6	3133776	3133781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_017046	TTG	2	6	3135238	3135243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_017046	TTA	2	6	3135250	3135255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_017046	TTTGC	2	10	3135261	3135270	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10083	NC_017046	GC	3	6	3135312	3135317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10084	NC_017046	CA	4	8	3135318	3135325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10085	NC_017046	CAA	2	6	3135335	3135340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_017046	GAAAT	2	10	3135409	3135418	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_017046	GGCGTC	2	12	3135424	3135435	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_017046	AGG	2	6	3135441	3135446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_017046	AGA	2	6	3135456	3135461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_017046	A	6	6	3135500	3135505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_017046	CTG	2	6	3135506	3135511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_017046	GCAA	2	8	3135593	3135600	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10093	NC_017046	G	6	6	3135622	3135627	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_017046	GTC	2	6	3137211	3137216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_017046	ATG	2	6	3137232	3137237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_017046	GAA	2	6	3137250	3137255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_017046	A	7	7	3137260	3137266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_017046	GCA	2	6	3137303	3137308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_017046	CTT	2	6	3137418	3137423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_017046	CCG	2	6	3137450	3137455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10101	NC_017046	CTG	2	6	3137568	3137573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_017046	TCA	2	6	3137579	3137584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_017046	CGA	2	6	3137618	3137623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_017046	GTT	2	6	3137720	3137725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_017046	TA	3	6	3137727	3137732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_017046	TC	3	6	3137803	3137808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10107	NC_017046	TC	3	6	3138380	3138385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10108	NC_017046	TCA	2	6	3139342	3139347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_017046	GCC	2	6	3140784	3140789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10110	NC_017046	AGC	2	6	3140790	3140795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_017046	T	6	6	3140850	3140855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_017046	ATG	2	6	3140856	3140861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_017046	ATC	2	6	3140862	3140867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_017046	CTC	2	6	3140946	3140951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10115	NC_017046	TTC	2	6	3140981	3140986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_017046	T	7	7	3141103	3141109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_017046	AAG	2	6	3141140	3141145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_017046	ATT	2	6	3141149	3141154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_017046	TCA	2	6	3141183	3141188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_017046	ATT	2	6	3141214	3141219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_017046	TA	3	6	3141232	3141237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_017046	T	6	6	3141277	3141282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_017046	TCC	2	6	3141316	3141321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10124	NC_017046	CGC	2	6	3144090	3144095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10125	NC_017046	TTG	2	6	3144106	3144111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_017046	TCGCT	2	10	3144119	3144128	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10127	NC_017046	C	6	6	3144169	3144174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10128	NC_017046	GGC	2	6	3144989	3144994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_017046	AGCGC	2	10	3145044	3145053	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10130	NC_017046	CT	4	8	3146886	3146893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10131	NC_017046	ACA	2	6	3146909	3146914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_017046	GCT	2	6	3146934	3146939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_017046	AAT	2	6	3146950	3146955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_017046	ATC	2	6	3146972	3146977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_017046	AATT	2	8	3147030	3147037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10138	NC_017046	TAA	2	6	3147091	3147096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_017046	T	6	6	3147099	3147104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10140	NC_017046	GAA	2	6	3147120	3147125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10141	NC_017046	TAC	2	6	3147131	3147136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10142	NC_017046	AAT	2	6	3147153	3147158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10143	NC_017046	T	6	6	3147183	3147188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10144	NC_017046	T	6	6	3147212	3147217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10145	NC_017046	TGA	2	6	3147231	3147236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10147	NC_017046	T	6	6	3147295	3147300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10148	NC_017046	TTA	2	6	3147340	3147345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10150	NC_017046	ACA	2	6	3147442	3147447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10151	NC_017046	GCG	2	6	3150636	3150641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10154	NC_017046	TGA	2	6	3153295	3153300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10161	NC_017046	GTT	2	6	3155954	3155959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10162	NC_017046	CTGT	2	8	3156031	3156038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10163	NC_017046	T	8	8	3156076	3156083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10164	NC_017046	TCT	3	9	3156324	3156332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10171	NC_017046	GTAGC	2	10	3158373	3158382	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10172	NC_017046	A	7	7	3160224	3160230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10202	NC_017046	A	8	8	3178529	3178536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10250	NC_017046	ACC	2	6	3197948	3197953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10251	NC_017046	TAT	2	6	3197987	3197992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_017046	AT	3	6	3197999	3198004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_017046	A	7	7	3198049	3198055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_017046	T	6	6	3198083	3198088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_017046	ATCG	2	8	3199808	3199815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10256	NC_017046	ATTT	2	8	3199845	3199852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10259	NC_017046	TAAA	2	8	3199891	3199898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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