MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017046	AACT	2	8	2172523	2172530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7002	NC_017046	CT	3	6	2172549	2172554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7003	NC_017046	CTG	2	6	2172646	2172651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_017046	A	6	6	2172664	2172669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_017046	ATC	2	6	2172740	2172745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_017046	TCAT	2	8	2173636	2173643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7007	NC_017046	AATT	2	8	2175709	2175716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_017046	AC	3	6	2175729	2175734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7009	NC_017046	TCA	2	6	2175750	2175755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_017046	TTG	2	6	2175784	2175789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_017046	CAG	2	6	2175801	2175806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_017046	TTA	2	6	2175841	2175846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_017046	TTA	2	6	2175993	2175998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_017046	ACCA	2	8	2176007	2176014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7015	NC_017046	GTT	2	6	2176024	2176029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_017046	AAC	2	6	2177066	2177071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_017046	ACC	2	6	2178510	2178515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7018	NC_017046	GTT	2	6	2184046	2184051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_017046	CTT	2	6	2185478	2185483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_017046	GTTATT	2	12	2185522	2185533	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_017046	ACC	2	6	2192147	2192152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_017046	TGC	2	6	2199648	2199653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_017046	AAT	2	6	2199695	2199700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_017046	TCA	2	6	2199723	2199728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_017046	ATT	2	6	2199732	2199737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_017046	CAT	2	6	2199833	2199838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_017046	A	8	8	2199843	2199850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_017046	AAT	2	6	2199877	2199882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_017046	CTT	2	6	2199925	2199930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_017046	ATT	2	6	2199947	2199952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_017046	GC	3	6	2200061	2200066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7032	NC_017046	TTG	2	6	2200086	2200091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_017046	GAT	2	6	2200167	2200172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_017046	ATTT	2	8	2200199	2200206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_017046	ACTCC	2	10	2200207	2200216	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7036	NC_017046	AT	3	6	2200235	2200240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_017046	ATT	2	6	2200248	2200253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_017046	GCATT	2	10	2200328	2200337	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7039	NC_017046	CCG	2	6	2200341	2200346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7040	NC_017046	TAT	2	6	2200347	2200352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_017046	CAGG	2	8	2202014	2202021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7042	NC_017046	AAGG	2	8	2205308	2205315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_017046	G	6	6	2205314	2205319	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_017046	CAG	2	6	2205355	2205360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_017046	GGC	2	6	2205400	2205405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_017046	GGA	3	9	2205471	2205479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_017046	CAGC	2	8	2205506	2205513	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7048	NC_017046	CGC	2	6	2209511	2209516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_017046	GAC	2	6	2209517	2209522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_017046	CTT	2	6	2209543	2209548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_017046	ATT	2	6	2210955	2210960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_017046	TCC	3	9	2211002	2211010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7053	NC_017046	ATG	2	6	2211061	2211066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_017046	TCA	2	6	2211074	2211079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_017046	CTG	2	6	2211136	2211141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_017046	TGCCG	2	10	2211163	2211172	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7057	NC_017046	AAT	2	6	2211254	2211259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_017046	ATT	2	6	2222341	2222346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_017046	ATAACA	2	12	2222350	2222361	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7060	NC_017046	AC	3	6	2222408	2222413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7061	NC_017046	ACG	2	6	2222452	2222457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_017046	ATT	2	6	2222478	2222483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_017046	AGT	2	6	2222517	2222522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_017046	T	6	6	2222522	2222527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_017046	ACATAA	2	12	2222568	2222579	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7066	NC_017046	GGT	2	6	2226648	2226653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_017046	GCCC	2	8	2226682	2226689	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7068	NC_017046	CTC	2	6	2226704	2226709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7069	NC_017046	GCC	2	6	2226712	2226717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7070	NC_017046	TCA	2	6	2226718	2226723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_017046	TCA	2	6	2226744	2226749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_017046	T	6	6	2228138	2228143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_017046	TAT	2	6	2228197	2228202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_017046	ACC	2	6	2228249	2228254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7075	NC_017046	T	6	6	2228290	2228295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_017046	A	6	6	2228309	2228314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_017046	GCCA	2	8	2228400	2228407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7081	NC_017046	AAT	2	6	2228610	2228615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7083	NC_017046	GATT	2	8	2228715	2228722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_017046	TA	3	6	2229927	2229932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7086	NC_017046	TAA	2	6	2230047	2230052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_017046	TA	3	6	2230103	2230108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_017046	TCG	2	6	2230150	2230155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7091	NC_017046	GTA	2	6	2230310	2230315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7093	NC_017046	AGG	2	6	2230483	2230488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_017046	TGTTTA	2	12	2230554	2230565	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_017046	CAT	2	6	2230619	2230624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7096	NC_017046	AT	3	6	2230643	2230648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_017046	TAA	2	6	2230735	2230740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_017046	TTG	2	6	2231063	2231068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_017046	TTC	2	6	2232031	2232036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_017046	GACC	2	8	2233182	2233189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7101	NC_017046	T	6	6	2233211	2233216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_017046	CTG	2	6	2233226	2233231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_017046	TAT	2	6	2233296	2233301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_017046	GAC	2	6	2237316	2237321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7107	NC_017046	AAG	2	6	2239028	2239033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_017046	GTC	2	6	2239044	2239049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_017046	CTGT	2	8	2239090	2239097	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7110	NC_017046	GCG	2	6	2239123	2239128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_017046	TGC	2	6	2239201	2239206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_017046	ACG	2	6	2239207	2239212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_017046	CCA	2	6	2239275	2239280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_017046	AC	3	6	2239292	2239297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7115	NC_017046	T	6	6	2239693	2239698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_017046	T	6	6	2239735	2239740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_017046	TTA	2	6	2239842	2239847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_017046	TTCA	2	8	2239865	2239872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7119	NC_017046	AT	3	6	2239884	2239889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_017046	ATG	2	6	2243422	2243427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7122	NC_017046	CGA	2	6	2244151	2244156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7124	NC_017046	TTA	2	6	2244746	2244751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_017046	TTG	2	6	2244809	2244814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_017046	CAA	2	6	2244848	2244853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_017046	ATT	2	6	2244870	2244875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_017046	TTA	2	6	2244884	2244889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7130	NC_017046	A	6	6	2244931	2244936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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